RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395145.3

CLDN3-201, Transcript of claudin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN3, Length 1,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.37□□□□□ -1.23
CLDN3-201ENST00000395145 LCE3BQ5TA77 95 aa7.36□□□□□ -1.23
CLDN3-201ENST00000395145 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.32□□□□□ -1.24
CLDN3-201ENST00000395145 MT1GP13640 62 aa7.31□□□□□ -1.24
CLDN3-201ENST00000395145 MT1LQ93083 61 aa7.29□□□□□ -1.24
CLDN3-201ENST00000395145 PP632Q6XCG6 107 aa7.24□□□□□ -1.25
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP12-3P60328 96 aa7.23□□□□□ -1.25
CLDN3-201ENST00000395145 MT1MQ8N339 61 aa7.19□□□□□ -1.26
CLDN3-201ENST00000395145 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.15□□□□□ -1.26
CLDN3-201ENST00000395145 ROMO1P60602 79 aa7.1□□□□□ -1.27
CLDN3-201ENST00000395145 GPR98Q8WXG9 6306 aa7.09□□□□□ -1.27
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.98□□□□□ -1.29
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.92□□□□□ -1.3
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.92□□□□□ -1.3
CLDN3-201ENST00000395145 BRK1Q8WUW1 75 aa6.9□□□□□ -1.3
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.89□□□□□ -1.31
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.86□□□□□ -1.31
CLDN3-201ENST00000395145 LCE4AQ5TA78 99 aa6.75□□□□□ -1.33
CLDN3-201ENST00000395145 SVIPQ8NHG7 77 aa6.73□□□□□ -1.33
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.71□□□□□ -1.34
CLDN3-201ENST00000395145 LCE1DQ5T752 114 aa6.7□□□□□ -1.34
CLDN3-201ENST00000395145 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.69□□□□□ -1.34
CLDN3-201ENST00000395145 MT4P47944 62 aa6.6□□□□□ -1.35
CLDN3-201ENST00000395145 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.6□□□□□ -1.35
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CLDN3-201ENST00000395145 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.54□□□□□ -1.36
CLDN3-201ENST00000395145 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.54□□□□□ -1.36
CLDN3-201ENST00000395145 PMAIP1Q13794 54 aa6.53□□□□□ -1.36
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.46□□□□□ -1.38
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.41□□□□□ -1.38
CLDN3-201ENST00000395145 PRO0628Q9UI54 55 aa6.36□□□□□ -1.39
CLDN3-201ENST00000395145 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.31□□□□□ -1.4
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP12-4P60329 112 aa6.31□□□□□ -1.4
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.3□□□□□ -1.4
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.29□□□□□ -1.4
CLDN3-201ENST00000395145 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.22□□□□□ -1.41
CLDN3-201ENST00000395145 MT1AP04731 61 aa6.21□□□□□ -1.42
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.18□□□□□ -1.42
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.15□□□□□ -1.42
CLDN3-201ENST00000395145 PRAC1Q96KF2 57 aa6.14□□□□□ -1.43
CLDN3-201ENST00000395145 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6□□□□□ -1.45
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.97□□□□□ -1.45
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.93□□□□□ -1.46
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.8□□□□□ -1.48
CLDN3-201ENST00000395145 MT3P25713 68 aa5.66□□□□□ -1.5
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.66□□□□□ -1.5
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP5-8O75690 187 aa5.47□□□□□ -1.53
CLDN3-201ENST00000395145 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.53
CLDN3-201ENST00000395145 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.44□□□□□ -1.54
CLDN3-201ENST00000395145 MUC5ACP98088 5654 aa5.42□□□□□ -1.54
CLDN3-201ENST00000395145 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.26□□□□□ -1.57
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.25□□□□□ -1.57
CLDN3-201ENST00000395145 LUZP6Q538Z0 58 aa5.22□□□□□ -1.57
CLDN3-201ENST00000395145 LCE1EQ5T753 118 aa5.15□□□□□ -1.59
CLDN3-201ENST00000395145 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.87□□□□□ -1.63
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.83□□□□□ -1.64
CLDN3-201ENST00000395145 LCE1CQ5T751 118 aa4.78□□□□□ -1.64
CLDN3-201ENST00000395145 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.78□□□□□ -1.64
CLDN3-201ENST00000395145 H3BS24 57 aa4.75□□□□□ -1.65
CLDN3-201ENST00000395145 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.64□□□□□ -1.67
CLDN3-201ENST00000395145 NDUFAF8A1L188 74 aa4.48□□□□□ -1.69
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.31□□□□□ -1.72
CLDN3-201ENST00000395145 A0A0A0MQY5 61 aa4.24□□□□□ -1.73
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.22□□□□□ -1.73
CLDN3-201ENST00000395145 LCE1FQ5T754 118 aa4.12□□□□□ -1.75
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.05□□□□□ -1.76
CLDN3-201ENST00000395145 INE1O15225 51 aa3.81□□□□□ -1.8
CLDN3-201ENST00000395145 PHGR1C9JFL3 82 aa3.78□□□□□ -1.8
CLDN3-201ENST00000395145 PRM1P04553 51 aa3.63□□□□□ -1.83
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.62□□□□□ -1.83
CLDN3-201ENST00000395145 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.31□□□□□ -1.88
CLDN3-201ENST00000395145 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.86□□□□□ -1.95
CLDN3-201ENST00000395145 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.45□□□□□ -2.02
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