RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 LCE1EQ5T753 118 aa1.18□□□□□ -2.22
CCSAP-202ENST00000366686 LCE3EQ5T5B0 92 aa1.17□□□□□ -2.22
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa1.17□□□□□ -2.22
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.17□□□□□ -2.22
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP1.16□□□□□ -2.22
CCSAP-202ENST00000366686 OBSCNQ5VST9 7968 aa1.15□□□□□ -2.22
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP5-8O75690 187 aa1.15□□□□□ -2.23
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP10-10P60014 251 aa1.14□□□□□ -2.23
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa1.12□□□□□ -2.23
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP10-5P60370 271 aa1.12□□□□□ -2.23
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP12-1P59990 96 aa1.12□□□□□ -2.23
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa1.12□□□□□ -2.23
CCSAP-202ENST00000366686 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa1.1□□□□□ -2.23
CCSAP-202ENST00000366686 NEBP20929 6669 aa1.08□□□□□ -2.24
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.08□□□□□ -2.24
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.07□□□□□ -2.24
CCSAP-202ENST00000366686 KMT2DO14686 5537 aa1.07□□□□□ -2.24
CCSAP-202ENST00000366686 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.06□□□□□ -2.24
CCSAP-202ENST00000366686 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
CCSAP-202ENST00000366686 CRCT1Q9UGL9 99 aa1.04□□□□□ -2.24
CCSAP-202ENST00000366686 MUC12Q9UKN1 5478 aa1.04□□□□□ -2.24
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.04□□□□□ -2.24
CCSAP-202ENST00000366686 LCE3DQ9BYE3 92 aa1.04□□□□□ -2.24
CCSAP-202ENST00000366686 MT1HL1P0DM35 61 aa1.03□□□□□ -2.24
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.03□□□□□ -2.24
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa1.01□□□□□ -2.25
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP12-4P60329 112 aa0.99□□□□□ -2.25
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa0.99□□□□□ -2.25
CCSAP-202ENST00000366686 LCE3AQ5TA76 89 aa0.98□□□□□ -2.25
CCSAP-202ENST00000366686 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP12-3P60328 96 aa0.94□□□□□ -2.26
CCSAP-202ENST00000366686 MUC5ACP98088 5654 aa0.93□□□□□ -2.26
CCSAP-202ENST00000366686 SPRR2BP35325 72 aa0.9□□□□□ -2.27
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa0.89□□□□□ -2.27
CCSAP-202ENST00000366686 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa0.88□□□□□ -2.27
CCSAP-202ENST00000366686 SPRR2AP35326 72 aa0.87□□□□□ -2.27
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa0.86□□□□□ -2.27
CCSAP-202ENST00000366686 MUC19Q7Z5P9 8384 aa0.85□□□□□ -2.27
CCSAP-202ENST00000366686 MT1HP80294 61 aa0.84□□□□□ -2.28
CCSAP-202ENST00000366686 SPRR2FQ96RM1 72 aa0.84□□□□□ -2.28
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa0.83□□□□□ -2.28
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa0.83□□□□□ -2.28
CCSAP-202ENST00000366686 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP0.82□□□□□ -2.28
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa0.82□□□□□ -2.28
CCSAP-202ENST00000366686 MDN1Q9NU22 5596 aa0.82□□□□□ -2.28
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa0.81□□□□□ -2.28
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa0.81□□□□□ -2.28
CCSAP-202ENST00000366686 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP0.81□□□□□ -2.28
CCSAP-202ENST00000366686 MT2AP02795 61 aa0.8□□□□□ -2.28
CCSAP-202ENST00000366686 FSIP2Q5CZC0 6907 aa0.79□□□□□ -2.28
CCSAP-202ENST00000366686 MT1FP04733 61 aa0.78□□□□□ -2.28
CCSAP-202ENST00000366686 SPRR2GQ9BYE4 73 aa0.77□□□□□ -2.29
CCSAP-202ENST00000366686 MT1GP13640 62 aa0.76□□□□□ -2.29
CCSAP-202ENST00000366686 LCE1CQ5T751 118 aa0.76□□□□□ -2.29
CCSAP-202ENST00000366686 LCE1BQ5T7P3 118 aa0.76□□□□□ -2.29
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa0.76□□□□□ -2.29
CCSAP-202ENST00000366686 SPRR2EP22531 72 aa0.75□□□□□ -2.29
CCSAP-202ENST00000366686 SPRR2DP22532 72 aa0.75□□□□□ -2.29
CCSAP-202ENST00000366686 MT1AP04731 61 aa0.73□□□□□ -2.29
CCSAP-202ENST00000366686 MT1BP07438 61 aa0.71□□□□□ -2.3
CCSAP-202ENST00000366686 MT1XP80297 61 aa0.71□□□□□ -2.3
CCSAP-202ENST00000366686 MT1EP04732 61 aa0.7□□□□□ -2.3
CCSAP-202ENST00000366686 MT1LQ93083 61 aa0.69□□□□□ -2.3
CCSAP-202ENST00000366686 MT4P47944 62 aa0.68□□□□□ -2.3
CCSAP-202ENST00000366686 PRM1P04553 51 aa0.68□□□□□ -2.3
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa0.66□□□□□ -2.3
CCSAP-202ENST00000366686 MT1MQ8N339 61 aa0.63□□□□□ -2.31
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa0.59□□□□□ -2.31
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa0.59□□□□□ -2.31
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa0.57□□□□□ -2.32
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa0.56□□□□□ -2.32
CCSAP-202ENST00000366686 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.55□□□□□ -2.32
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.52□□□□□ -2.33
CCSAP-202ENST00000366686 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa0.52□□□□□ -2.33
CCSAP-202ENST00000366686 PHGR1C9JFL3 82 aa0.44□□□□□ -2.34
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 154.2 ms