RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345015.4

KCNQ1-203, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene KCNQ1, Length 304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.47□□□□□ -1.69
KCNQ1-203ENST00000345015 LCE3BQ5TA77 95 aa4.45□□□□□ -1.7
KCNQ1-203ENST00000345015 MT1GP13640 62 aa4.44□□□□□ -1.7
KCNQ1-203ENST00000345015 LCE3AQ5TA76 89 aa4.44□□□□□ -1.7
KCNQ1-203ENST00000345015 PP632Q6XCG6 107 aa4.42□□□□□ -1.7
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.41□□□□□ -1.7
KCNQ1-203ENST00000345015 MT1LQ93083 61 aa4.35□□□□□ -1.71
KCNQ1-203ENST00000345015 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.35□□□□□ -1.71
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP12-3P60328 96 aa4.34□□□□□ -1.71
KCNQ1-203ENST00000345015 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.72
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.33□□□□□ -1.72
KCNQ1-203ENST00000345015 MT1MQ8N339 61 aa4.3□□□□□ -1.72
KCNQ1-203ENST00000345015 ROMO1P60602 79 aa4.25□□□□□ -1.73
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.18□□□□□ -1.74
KCNQ1-203ENST00000345015 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.13□□□□□ -1.75
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.13□□□□□ -1.75
KCNQ1-203ENST00000345015 LCE4AQ5TA78 99 aa4.12□□□□□ -1.75
KCNQ1-203ENST00000345015 LCE1DQ5T752 114 aa4.07□□□□□ -1.76
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.07□□□□□ -1.76
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.06□□□□□ -1.76
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.04□□□□□ -1.76
KCNQ1-203ENST00000345015 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.02□□□□□ -1.77
KCNQ1-203ENST00000345015 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.01□□□□□ -1.77
KCNQ1-203ENST00000345015 MT4P47944 62 aa4□□□□□ -1.77
KCNQ1-203ENST00000345015 BRK1Q8WUW1 75 aa3.98□□□□□ -1.77
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.91□□□□□ -1.78
KCNQ1-203ENST00000345015 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.86□□□□□ -1.79
KCNQ1-203ENST00000345015 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.86□□□□□ -1.79
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP12-4P60329 112 aa3.85□□□□□ -1.79
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.83□□□□□ -1.8
KCNQ1-203ENST00000345015 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.82□□□□□ -1.8
KCNQ1-203ENST00000345015 PMAIP1Q13794 54 aa3.79□□□□□ -1.8
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.77□□□□□ -1.81
KCNQ1-203ENST00000345015 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
KCNQ1-203ENST00000345015 MT1AP04731 61 aa3.73□□□□□ -1.81
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.72□□□□□ -1.81
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.71□□□□□ -1.82
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.69□□□□□ -1.82
KCNQ1-203ENST00000345015 PRO0628Q9UI54 55 aa3.68□□□□□ -1.82
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.64□□□□□ -1.83
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.59□□□□□ -1.83
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.59□□□□□ -1.83
KCNQ1-203ENST00000345015 PRAC1Q96KF2 57 aa3.5□□□□□ -1.85
KCNQ1-203ENST00000345015 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.47□□□□□ -1.85
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.45□□□□□ -1.86
KCNQ1-203ENST00000345015 MT3P25713 68 aa3.44□□□□□ -1.86
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.43□□□□□ -1.86
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP5-8O75690 187 aa3.34□□□□□ -1.87
KCNQ1-203ENST00000345015 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.33□□□□□ -1.88
KCNQ1-203ENST00000345015 SVIPQ8NHG7 77 aa3.21□□□□□ -1.9
KCNQ1-203ENST00000345015 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
KCNQ1-203ENST00000345015 LCE1EQ5T753 118 aa3.18□□□□□ -1.9
KCNQ1-203ENST00000345015 MUC5ACP98088 5654 aa3.17□□□□□ -1.9
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.16□□□□□ -1.9
KCNQ1-203ENST00000345015 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.14□□□□□ -1.91
KCNQ1-203ENST00000345015 LUZP6Q538Z0 58 aa3.09□□□□□ -1.91
KCNQ1-203ENST00000345015 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.94□□□□□ -1.94
KCNQ1-203ENST00000345015 LCE1CQ5T751 118 aa2.93□□□□□ -1.94
KCNQ1-203ENST00000345015 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.93□□□□□ -1.94
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.89□□□□□ -1.95
KCNQ1-203ENST00000345015 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.8□□□□□ -1.96
KCNQ1-203ENST00000345015 H3BS24 57 aa2.79□□□□□ -1.96
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.63□□□□□ -1.99
KCNQ1-203ENST00000345015 LCE1FQ5T754 118 aa2.57□□□□□ -2
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.56□□□□□ -2
KCNQ1-203ENST00000345015 NDUFAF8A1L188 74 aa2.51□□□□□ -2.01
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.43□□□□□ -2.02
KCNQ1-203ENST00000345015 PHGR1C9JFL3 82 aa2.25□□□□□ -2.05
KCNQ1-203ENST00000345015 INE1O15225 51 aa2.18□□□□□ -2.06
KCNQ1-203ENST00000345015 A0A0A0MQY5 61 aa2.15□□□□□ -2.07
KCNQ1-203ENST00000345015 PRM1P04553 51 aa2.12□□□□□ -2.07
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.11□□□□□ -2.07
KCNQ1-203ENST00000345015 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.04□□□□□ -2.08
KCNQ1-203ENST00000345015 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.67□□□□□ -2.14
KCNQ1-203ENST00000345015 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.48□□□□□ -2.17
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