RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.33□□□□□ -1.72
TTPA-201ENST00000260116 MDN1Q9NU22 5596 aa4.27□□□□□ -1.73
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP10-12P60413 245 aa4.26□□□□□ -1.73
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.23□□□□□ -1.73
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.2□□□□□ -1.74
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.2□□□□□ -1.74
TTPA-201ENST00000260116 TNP1P09430 55 aa4.18□□□□□ -1.74
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.17□□□□□ -1.74
TTPA-201ENST00000260116 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.16□□□□□ -1.74
TTPA-201ENST00000260116 LCE3AQ5TA76 89 aa4.15□□□□□ -1.74
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.1□□□□□ -1.75
TTPA-201ENST00000260116 PP632Q6XCG6 107 aa4.1□□□□□ -1.75
TTPA-201ENST00000260116 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP5-9P26371 169 aa4.08□□□□□ -1.76
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.07□□□□□ -1.76
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.07□□□□□ -1.76
TTPA-201ENST00000260116 NEBP20929 6669 aa4□□□□□ -1.77
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TTPA-201ENST00000260116 LCE4AQ5TA78 99 aa3.98□□□□□ -1.77
TTPA-201ENST00000260116 SPRR2EP22531 72 aa3.98□□□□□ -1.77
TTPA-201ENST00000260116 SPRR2BP35325 72 aa3.98□□□□□ -1.77
TTPA-201ENST00000260116 SPRR2AP35326 72 aa3.98□□□□□ -1.77
TTPA-201ENST00000260116 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.96□□□□□ -1.78
TTPA-201ENST00000260116 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.95□□□□□ -1.78
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP12-3P60328 96 aa3.94□□□□□ -1.78
TTPA-201ENST00000260116 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.89□□□□□ -1.79
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.87□□□□□ -1.79
TTPA-201ENST00000260116 MT1LQ93083 61 aa3.87□□□□□ -1.79
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.83□□□□□ -1.8
TTPA-201ENST00000260116 SPRR2DP22532 72 aa3.82□□□□□ -1.8
TTPA-201ENST00000260116 MT1GP13640 62 aa3.77□□□□□ -1.81
TTPA-201ENST00000260116 MT1MQ8N339 61 aa3.77□□□□□ -1.81
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.75□□□□□ -1.81
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.68□□□□□ -1.82
TTPA-201ENST00000260116 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.65□□□□□ -1.82
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.64□□□□□ -1.83
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.64□□□□□ -1.83
TTPA-201ENST00000260116 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.59□□□□□ -1.83
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.55□□□□□ -1.84
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.55□□□□□ -1.84
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.55□□□□□ -1.84
TTPA-201ENST00000260116 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
TTPA-201ENST00000260116 MT4P47944 62 aa3.42□□□□□ -1.86
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
TTPA-201ENST00000260116 LCE1FQ5T754 118 aa3.4□□□□□ -1.87
TTPA-201ENST00000260116 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.38□□□□□ -1.87
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.33□□□□□ -1.88
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.31□□□□□ -1.88
TTPA-201ENST00000260116 LCE1EQ5T753 118 aa3.28□□□□□ -1.88
TTPA-201ENST00000260116 MT1AP04731 61 aa3.24□□□□□ -1.89
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP12-4P60329 112 aa3.2□□□□□ -1.9
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.18□□□□□ -1.9
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.1□□□□□ -1.91
TTPA-201ENST00000260116 MT3P25713 68 aa3.06□□□□□ -1.92
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
TTPA-201ENST00000260116 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3□□□□□ -1.93
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.97□□□□□ -1.93
TTPA-201ENST00000260116 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.95□□□□□ -1.94
TTPA-201ENST00000260116 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.9□□□□□ -1.95
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.88□□□□□ -1.95
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.83□□□□□ -1.96
TTPA-201ENST00000260116 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.76□□□□□ -1.97
TTPA-201ENST00000260116 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP5-8O75690 187 aa2.72□□□□□ -1.97
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.67□□□□□ -1.98
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.65□□□□□ -1.99
TTPA-201ENST00000260116 MUC5ACP98088 5654 aa2.64□□□□□ -1.99
TTPA-201ENST00000260116 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.57□□□□□ -2
TTPA-201ENST00000260116 PRM1P04553 51 aa2.54□□□□□ -2
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.54□□□□□ -2
TTPA-201ENST00000260116 LCE1CQ5T751 118 aa2.42□□□□□ -2.02
TTPA-201ENST00000260116 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.14□□□□□ -2.07
TTPA-201ENST00000260116 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.01□□□□□ -2.09
TTPA-201ENST00000260116 PHGR1C9JFL3 82 aa1.88□□□□□ -2.11
TTPA-201ENST00000260116 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.8□□□□□ -2.12
TTPA-201ENST00000260116 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.15□□□□□ -2.23
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