RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259467.8

PDCL-201, Transcript of phosducin like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL, Length 2,813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL-201ENST00000259467 KMT2DO14686 5537 aa3.93□□□□□ -1.78
PDCL-201ENST00000259467 INE1O15225 51 aa3.92□□□□□ -1.78
PDCL-201ENST00000259467 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.89□□□□□ -1.79
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.84□□□□□ -1.8
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP10-12P60413 245 aa3.83□□□□□ -1.8
PDCL-201ENST00000259467 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP12-3P60328 96 aa3.78□□□□□ -1.8
PDCL-201ENST00000259467 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.65□□□□□ -1.83
PDCL-201ENST00000259467 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.64□□□□□ -1.83
PDCL-201ENST00000259467 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.58□□□□□ -1.84
PDCL-201ENST00000259467 MDN1Q9NU22 5596 aa3.57□□□□□ -1.84
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.57□□□□□ -1.84
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.54□□□□□ -1.84
PDCL-201ENST00000259467 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.48□□□□□ -1.85
PDCL-201ENST00000259467 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.48□□□□□ -1.85
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.47□□□□□ -1.85
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.46□□□□□ -1.86
PDCL-201ENST00000259467 MT1EP04732 61 aa3.46□□□□□ -1.86
PDCL-201ENST00000259467 MT1LQ93083 61 aa3.44□□□□□ -1.86
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.4□□□□□ -1.87
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP5-9P26371 169 aa3.39□□□□□ -1.87
PDCL-201ENST00000259467 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.38□□□□□ -1.87
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.38□□□□□ -1.87
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.38□□□□□ -1.87
PDCL-201ENST00000259467 SPRR2EP22531 72 aa3.32□□□□□ -1.88
PDCL-201ENST00000259467 SPRR2BP35325 72 aa3.32□□□□□ -1.88
PDCL-201ENST00000259467 SPRR2AP35326 72 aa3.32□□□□□ -1.88
PDCL-201ENST00000259467 NEBP20929 6669 aa3.32□□□□□ -1.88
PDCL-201ENST00000259467 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.32□□□□□ -1.88
PDCL-201ENST00000259467 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.31□□□□□ -1.88
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.27□□□□□ -1.89
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.27□□□□□ -1.89
PDCL-201ENST00000259467 MT1GP13640 62 aa3.24□□□□□ -1.89
PDCL-201ENST00000259467 MT1MQ8N339 61 aa3.23□□□□□ -1.89
PDCL-201ENST00000259467 SPRR2DP22532 72 aa3.19□□□□□ -1.9
PDCL-201ENST00000259467 LCE4AQ5TA78 99 aa3.16□□□□□ -1.9
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.03□□□□□ -1.92
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP12-4P60329 112 aa3.02□□□□□ -1.93
PDCL-201ENST00000259467 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.93□□□□□ -1.94
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.92□□□□□ -1.94
PDCL-201ENST00000259467 MT1AP04731 61 aa2.91□□□□□ -1.94
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.9□□□□□ -1.95
PDCL-201ENST00000259467 MT4P47944 62 aa2.86□□□□□ -1.95
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.77□□□□□ -1.97
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.77□□□□□ -1.97
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.76□□□□□ -1.97
PDCL-201ENST00000259467 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.75□□□□□ -1.97
PDCL-201ENST00000259467 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.75□□□□□ -1.97
PDCL-201ENST00000259467 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.74□□□□□ -1.97
PDCL-201ENST00000259467 PRM1P04553 51 aa2.69□□□□□ -1.98
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.66□□□□□ -1.98
PDCL-201ENST00000259467 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.65□□□□□ -1.99
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.63□□□□□ -1.99
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.6□□□□□ -1.99
PDCL-201ENST00000259467 MT3P25713 68 aa2.59□□□□□ -1.99
PDCL-201ENST00000259467 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.55□□□□□ -2
PDCL-201ENST00000259467 LCE1EQ5T753 118 aa2.53□□□□□ -2
PDCL-201ENST00000259467 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP5-8O75690 187 aa2.4□□□□□ -2.03
PDCL-201ENST00000259467 LCE1FQ5T754 118 aa2.39□□□□□ -2.03
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.38□□□□□ -2.03
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.32□□□□□ -2.04
PDCL-201ENST00000259467 MUC5ACP98088 5654 aa2.27□□□□□ -2.05
PDCL-201ENST00000259467 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.18□□□□□ -2.06
PDCL-201ENST00000259467 LCE1CQ5T751 118 aa2.08□□□□□ -2.08
PDCL-201ENST00000259467 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.92□□□□□ -2.1
PDCL-201ENST00000259467 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.85□□□□□ -2.11
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.74□□□□□ -2.13
PDCL-201ENST00000259467 PHGR1C9JFL3 82 aa1.58□□□□□ -2.16
PDCL-201ENST00000259467 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.1□□□□□ -2.23
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.9 ms