RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 PRO2289Q9P1D8 64 aa11.61□□□□□ -0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 BATFQ16520 125 aa11.6□□□□□ -0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 LCE1AQ5T7P2 110 aa11.57□□□□□ -0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 SPRR2DP22532 72 aa11.53□□□□□ -0.56
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A087WVE0 104 aa11.52□□□□□ -0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 MT1XP80297 61 aa11.47□□□□□ -0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa11.47□□□□□ -0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 UBL5Q9BZL1 73 aa11.46□□□□□ -0.57
CAPNS1-217ENST00000629983 A8MUN3 132 aa11.43□□□□□ -0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 TAX1BP3O14907 124 aa11.42□□□□□ -0.58
CAPNS1-217ENST00000629983 PLAC4Q8WY50 150 aa11.39□□□□□ -0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa11.38□□□□□ -0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFC1O43677 76 aa11.36□□□□□ -0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 H0YAA0 97 aa11.35□□□□□ -0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PPM0 123 aa11.34□□□□□ -0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 C9orf118A6NHY6 69 aa11.34□□□□□ -0.59
CAPNS1-217ENST00000629983 ADM2Q7Z4H4 148 aa11.32□□□□□ -0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP12-2P59991 146 aa11.31□□□□□ -0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 K7EP34 96 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa11.24□□□□□ -0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 LCE3BQ5TA77 95 aa11.24□□□□□ -0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa11.24□□□□□ -0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa11.22□□□□□ -0.61
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR98Q8WXG9 6306 aa11.19□□□□□ -0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV22A0A0B4J277 110 aa11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 SPCS1Q9Y6A9 102 aa11.17□□□□□ -0.62
CAPNS1-217ENST00000629983 R4GN34 69 aa11.11□□□□□ -0.63
CAPNS1-217ENST00000629983 ACYP1P07311 99 aa11.07□□□□□ -0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 F8W1H4 67 aa11.04□□□□□ -0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 K7ERU9 68 aa11.03□□□□□ -0.64
CAPNS1-217ENST00000629983 M0QZ58 72 aa11□□□□□ -0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC01554Q52M75 96 aa10.94□□□□□ -0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 C20orf197Q8N268 126 aa10.94□□□□□ -0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 PRO0461Q9UI25 63 aa10.94□□□□□ -0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 P0C880 135 aa10.93□□□□□ -0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 H0Y9P7 68 aa10.92□□□□□ -0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 J3QR89 54 aa10.9□□□□□ -0.66
CAPNS1-217ENST00000629983 ATOX1O00244 68 aa10.89□□□□□ -0.67
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP10-12P60413 245 aa10.86□□□□□ -0.67
CAPNS1-217ENST00000629983 UQCRQO14949 82 aa10.85□□□□□ -0.67
CAPNS1-217ENST00000629983 ETDBQ3ZM63 59 aa10.82□□□□□ -0.68
CAPNS1-217ENST00000629983 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00208Q96KT6 92 aa10.68□□□□□ -0.7
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa10.68□□□□□ -0.7
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa10.64□□□□□ -0.71
CAPNS1-217ENST00000629983 SCGB1A1P11684 91 aa10.6□□□□□ -0.71
CAPNS1-217ENST00000629983 PCP4P48539 62 aa10.6□□□□□ -0.71
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa10.56□□□□□ -0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 MT-ATP8P03928 68 aa10.56□□□□□ -0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa10.54□□□□□ -0.72
CAPNS1-217ENST00000629983 MP68P56378 58 aa10.51□□□□□ -0.73
CAPNS1-217ENST00000629983 DMAC1Q96GE9 116 aa10.4□□□□□ -0.74
CAPNS1-217ENST00000629983 LCE5AQ5TCM9 118 aa10.39□□□□□ -0.75
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00643Q86TS7 51 aa10.32□□□□□ -0.76
CAPNS1-217ENST00000629983 LCE1DQ5T752 114 aa10.31□□□□□ -0.76
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa10.3□□□□□ -0.76
CAPNS1-217ENST00000629983 OCR1Q9BZK8 76 aa10.29□□□□□ -0.76
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa10.25□□□□□ -0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 HMCN1Q96RW7 5635 aa10.25□□□□□ -0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 MT1EP04732 61 aa10.23□□□□□ -0.77
CAPNS1-217ENST00000629983 H3BPC8 53 aa10.18□□□□□ -0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV7A0A075B6U4 112 aa10.16□□□□□ -0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 CYSTM1Q9H1C7 97 aa10.16□□□□□ -0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 MT4P47944 62 aa10.15□□□□□ -0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa10.15□□□□□ -0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 ANAPC13Q9BS18 74 aa10.15□□□□□ -0.78
CAPNS1-217ENST00000629983 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa10.12□□□□□ -0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 SPTSSBQ8NFR3 76 aa10.11□□□□□ -0.79
CAPNS1-217ENST00000629983 LCE4AQ5TA78 99 aa10.08□□□□□ -0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 ACYP2P14621 99 aa10.03□□□□□ -0.8
CAPNS1-217ENST00000629983 MT1GP13640 62 aa9.95□□□□□ -0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa9.94□□□□□ -0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 PP632Q6XCG6 107 aa9.94□□□□□ -0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa9.9□□□□□ -0.82
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC179H3BU77 68 aa9.89□□□□□ -0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa9.89□□□□□ -0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 COX7CP15954 63 aa9.88□□□□□ -0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa9.86□□□□□ -0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 SERP2Q8N6R1 65 aa9.85□□□□□ -0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 SMIM20Q8N5G0 67 aa9.84□□□□□ -0.83
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0D9SG42 100 aa9.82□□□□□ -0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 MT1MQ8N339 61 aa9.79□□□□□ -0.84
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa9.72□□□□□ -0.85
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa9.7□□□□□ -0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 MT1LQ93083 61 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM258P61165 79 aa9.62□□□□□ -0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa9.62□□□□□ -0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa9.61□□□□□ -0.87
CAPNS1-217ENST00000629983 SPINT4Q6UDR6 99 aa9.53□□□□□ -0.88
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS28P62857 69 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CAPNS1-217ENST00000629983 H7BZZ5 65 aa9.45□□□□□ -0.9
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CAPNS1-217ENST00000629983 SNURFQ9Y675 71 aa9.4□□□□□ -0.9
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA8Q6RVD6 105 aa9.38□□□□□ -0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa9.36□□□□□ -0.91
CAPNS1-217ENST00000629983 C10orf95Q9H7T3 257 aa9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.4 ms