RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589548.5

CXXC1-211, Transcript of CXXC finger protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CXXC1, Length 849 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1-211ENST00000589548 TSTD3H0UI37 97 aa7.48□□□□□ -1.21
CXXC1-211ENST00000589548 M0R143 59 aa7.48□□□□□ -1.21
CXXC1-211ENST00000589548 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.48□□□□□ -1.21
CXXC1-211ENST00000589548 KRTAP12-2P59991 146 aa7.43□□□□□ -1.22
CXXC1-211ENST00000589548 LCE3BQ5TA77 95 aa7.43□□□□□ -1.22
CXXC1-211ENST00000589548 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.42□□□□□ -1.22
CXXC1-211ENST00000589548 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.42□□□□□ -1.22
CXXC1-211ENST00000589548 H3BT86 120 aa7.39□□□□□ -1.23
CXXC1-211ENST00000589548 BATFQ16520 125 aa7.37□□□□□ -1.23
CXXC1-211ENST00000589548 A8MUN3 132 aa7.35□□□□□ -1.23
CXXC1-211ENST00000589548 H0YAA0 97 aa7.35□□□□□ -1.23
CXXC1-211ENST00000589548 TAX1BP3O14907 124 aa7.31□□□□□ -1.24
CXXC1-211ENST00000589548 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.31□□□□□ -1.24
CXXC1-211ENST00000589548 PLAC4Q8WY50 150 aa7.3□□□□□ -1.24
CXXC1-211ENST00000589548 C9orf118A6NHY6 69 aa7.29□□□□□ -1.24
CXXC1-211ENST00000589548 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.29□□□□□ -1.24
CXXC1-211ENST00000589548 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.28□□□□□ -1.24
CXXC1-211ENST00000589548 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CXXC1-211ENST00000589548 A0A1W2PPM0 123 aa7.24□□□□□ -1.25
CXXC1-211ENST00000589548 K7EP34 96 aa7.23□□□□□ -1.25
CXXC1-211ENST00000589548 NDUFC1O43677 76 aa7.23□□□□□ -1.25
CXXC1-211ENST00000589548 UBL5Q9BZL1 73 aa7.22□□□□□ -1.25
CXXC1-211ENST00000589548 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CXXC1-211ENST00000589548 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.19□□□□□ -1.26
CXXC1-211ENST00000589548 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.16□□□□□ -1.26
CXXC1-211ENST00000589548 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.15□□□□□ -1.26
CXXC1-211ENST00000589548 KRTAP10-12P60413 245 aa7.14□□□□□ -1.27
CXXC1-211ENST00000589548 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.13□□□□□ -1.27
CXXC1-211ENST00000589548 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.12□□□□□ -1.27
CXXC1-211ENST00000589548 R4GN34 69 aa7.1□□□□□ -1.27
CXXC1-211ENST00000589548 P0C880 135 aa7.08□□□□□ -1.28
CXXC1-211ENST00000589548 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.08□□□□□ -1.28
CXXC1-211ENST00000589548 PRO0461Q9UI25 63 aa7.07□□□□□ -1.28
CXXC1-211ENST00000589548 M0QZ58 72 aa7.05□□□□□ -1.28
CXXC1-211ENST00000589548 ACYP1P07311 99 aa7.02□□□□□ -1.29
CXXC1-211ENST00000589548 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.99□□□□□ -1.29
CXXC1-211ENST00000589548 LINC01554Q52M75 96 aa6.98□□□□□ -1.29
CXXC1-211ENST00000589548 F8W1H4 67 aa6.94□□□□□ -1.3
CXXC1-211ENST00000589548 C20orf197Q8N268 126 aa6.94□□□□□ -1.3
CXXC1-211ENST00000589548 H0Y9P7 68 aa6.93□□□□□ -1.3
CXXC1-211ENST00000589548 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.93□□□□□ -1.3
CXXC1-211ENST00000589548 ETDBQ3ZM63 59 aa6.9□□□□□ -1.3
CXXC1-211ENST00000589548 ATOX1O00244 68 aa6.88□□□□□ -1.31
CXXC1-211ENST00000589548 UQCRQO14949 82 aa6.88□□□□□ -1.31
CXXC1-211ENST00000589548 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.86□□□□□ -1.31
CXXC1-211ENST00000589548 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.85□□□□□ -1.31
CXXC1-211ENST00000589548 LCE1DQ5T752 114 aa6.84□□□□□ -1.31
CXXC1-211ENST00000589548 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.82□□□□□ -1.32
CXXC1-211ENST00000589548 A0A1B0GV90 55 aa6.8□□□□□ -1.32
CXXC1-211ENST00000589548 LINC00208Q96KT6 92 aa6.77□□□□□ -1.33
CXXC1-211ENST00000589548 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.76□□□□□ -1.33
CXXC1-211ENST00000589548 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.75□□□□□ -1.33
CXXC1-211ENST00000589548 MT1EP04732 61 aa6.72□□□□□ -1.33
CXXC1-211ENST00000589548 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.71□□□□□ -1.34
CXXC1-211ENST00000589548 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CXXC1-211ENST00000589548 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.7□□□□□ -1.34
CXXC1-211ENST00000589548 MT-ATP8P03928 68 aa6.68□□□□□ -1.34
CXXC1-211ENST00000589548 MT4P47944 62 aa6.68□□□□□ -1.34
CXXC1-211ENST00000589548 LCE4AQ5TA78 99 aa6.66□□□□□ -1.34
CXXC1-211ENST00000589548 DMAC1Q96GE9 116 aa6.66□□□□□ -1.34
CXXC1-211ENST00000589548 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.64□□□□□ -1.35
CXXC1-211ENST00000589548 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.63□□□□□ -1.35
CXXC1-211ENST00000589548 MP68P56378 58 aa6.59□□□□□ -1.35
CXXC1-211ENST00000589548 OCR1Q9BZK8 76 aa6.58□□□□□ -1.36
CXXC1-211ENST00000589548 LINC00643Q86TS7 51 aa6.57□□□□□ -1.36
CXXC1-211ENST00000589548 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.54□□□□□ -1.36
CXXC1-211ENST00000589548 J3QR89 54 aa6.51□□□□□ -1.37
CXXC1-211ENST00000589548 MT1GP13640 62 aa6.51□□□□□ -1.37
CXXC1-211ENST00000589548 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.46□□□□□ -1.38
CXXC1-211ENST00000589548 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.45□□□□□ -1.38
CXXC1-211ENST00000589548 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.45□□□□□ -1.38
CXXC1-211ENST00000589548 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.44□□□□□ -1.38
CXXC1-211ENST00000589548 MT1MQ8N339 61 aa6.44□□□□□ -1.38
CXXC1-211ENST00000589548 H3BPC8 53 aa6.43□□□□□ -1.38
CXXC1-211ENST00000589548 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.43□□□□□ -1.38
CXXC1-211ENST00000589548 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.42□□□□□ -1.38
CXXC1-211ENST00000589548 PP632Q6XCG6 107 aa6.42□□□□□ -1.38
CXXC1-211ENST00000589548 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.39□□□□□ -1.39
CXXC1-211ENST00000589548 K7ERU9 68 aa6.37□□□□□ -1.39
CXXC1-211ENST00000589548 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.35□□□□□ -1.39
CXXC1-211ENST00000589548 A0A0D9SG42 100 aa6.33□□□□□ -1.4
CXXC1-211ENST00000589548 ACYP2P14621 99 aa6.33□□□□□ -1.4
CXXC1-211ENST00000589548 MT1LQ93083 61 aa6.33□□□□□ -1.4
CXXC1-211ENST00000589548 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.32□□□□□ -1.4
CXXC1-211ENST00000589548 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.32□□□□□ -1.4
CXXC1-211ENST00000589548 SCGB1A1P11684 91 aa6.25□□□□□ -1.41
CXXC1-211ENST00000589548 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.2□□□□□ -1.42
CXXC1-211ENST00000589548 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.15□□□□□ -1.42
CXXC1-211ENST00000589548 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.13□□□□□ -1.43
CXXC1-211ENST00000589548 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.06□□□□□ -1.44
CXXC1-211ENST00000589548 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.04□□□□□ -1.44
CXXC1-211ENST00000589548 LCE3AQ5TA76 89 aa6.02□□□□□ -1.45
CXXC1-211ENST00000589548 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.02□□□□□ -1.45
CXXC1-211ENST00000589548 SERP2Q8N6R1 65 aa6.02□□□□□ -1.45
CXXC1-211ENST00000589548 SNURFQ9Y675 71 aa6.01□□□□□ -1.45
CXXC1-211ENST00000589548 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.99□□□□□ -1.45
CXXC1-211ENST00000589548 PCP4P48539 62 aa5.98□□□□□ -1.45
CXXC1-211ENST00000589548 KRTAP12-1P59990 96 aa5.98□□□□□ -1.45
CXXC1-211ENST00000589548 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
CXXC1-211ENST00000589548 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 272.7 ms