RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559257.5

USP3-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5

Gene USP3, Length 2,217 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-211ENST00000559257 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
USP3-211ENST00000559257 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.1□□□□□ -1.75
USP3-211ENST00000559257 TGP01266 2768 aa4.1□□□□□ -1.75
USP3-211ENST00000559257 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
USP3-211ENST00000559257 DNHD1Q96M86 4753 aa4.1□□□□□ -1.75
USP3-211ENST00000559257 M0QZ58 72 aa4.1□□□□□ -1.75
USP3-211ENST00000559257 STAB1Q9NY15 2570 aa4.1□□□□□ -1.75
USP3-211ENST00000559257 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.09□□□□□ -1.75
USP3-211ENST00000559257 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.09□□□□□ -1.75
USP3-211ENST00000559257 DNAH10Q8IVF4 4471 aa4.07□□□□□ -1.76
USP3-211ENST00000559257 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
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USP3-211ENST00000559257 DNAH17Q9UFH2 4485 aa4.06□□□□□ -1.76
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USP3-211ENST00000559257 COL7A1Q02388 2944 aa4.04□□□□□ -1.76
USP3-211ENST00000559257 DNAH9Q9NYC9 4486 aa4.04□□□□□ -1.76
USP3-211ENST00000559257 STAB2Q8WWQ8 2551 aa4.02□□□□□ -1.77
USP3-211ENST00000559257 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.02□□□□□ -1.77
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USP3-211ENST00000559257 KRTAP10-2P60368 255 aa3.96□□□□□ -1.78
USP3-211ENST00000559257 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
USP3-211ENST00000559257 KRTAP10-1P60331 282 aa3.94□□□□□ -1.78
USP3-211ENST00000559257 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa3.94□□□□□ -1.78
USP3-211ENST00000559257 DNAH7Q8WXX0 4024 aa3.93□□□□□ -1.78
USP3-211ENST00000559257 MYCBP2O75592 4640 aa3.92□□□□□ -1.78
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USP3-211ENST00000559257 FBN3Q75N90 2809 aa3.9□□□□□ -1.79
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USP3-211ENST00000559257 STARD9Q9P2P6 4700 aa3.88□□□□□ -1.79
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USP3-211ENST00000559257 Q5VSD8 79 aa3.87□□□□□ -1.79
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USP3-211ENST00000559257 DNAH2Q9P225 4427 aa3.84□□□□□ -1.79
USP3-211ENST00000559257 DNAH5Q8TE73 4624 aa3.77□□□□□ -1.81
USP3-211ENST00000559257 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.76□□□□□ -1.81
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USP3-211ENST00000559257 A0A1B0GVY2 172 aa3.73□□□□□ -1.81
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USP3-211ENST00000559257 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.68□□□□□ -1.82
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USP3-211ENST00000559257 TNP1P09430 55 aa3.64□□□□□ -1.83
USP3-211ENST00000559257 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.64□□□□□ -1.83
USP3-211ENST00000559257 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.64□□□□□ -1.83
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USP3-211ENST00000559257 TNXBP22105 4242 aa3.47□□□□□ -1.85
USP3-211ENST00000559257 MT1HL1P0DM35 61 aa3.44□□□□□ -1.86
USP3-211ENST00000559257 FAT1Q14517 4588 aa3.44□□□□□ -1.86
USP3-211ENST00000559257 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.44□□□□□ -1.86
USP3-211ENST00000559257 RYR2Q92736 4967 aa3.43□□□□□ -1.86
USP3-211ENST00000559257 LCE4AQ5TA78 99 aa3.42□□□□□ -1.86
USP3-211ENST00000559257 HSPG2P98160 4391 aa3.4□□□□□ -1.87
USP3-211ENST00000559257 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
USP3-211ENST00000559257 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.34□□□□□ -1.87
USP3-211ENST00000559257 KRTAP10-12P60413 245 aa3.31□□□□□ -1.88
USP3-211ENST00000559257 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.31□□□□□ -1.88
USP3-211ENST00000559257 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.29□□□□□ -1.88
USP3-211ENST00000559257 PCLOQ9Y6V0 5065 aa3.29□□□□□ -1.88
USP3-211ENST00000559257 LCE3AQ5TA76 89 aa3.29□□□□□ -1.88
USP3-211ENST00000559257 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.28□□□□□ -1.88
USP3-211ENST00000559257 RYR1P21817 5038 aa3.28□□□□□ -1.88
USP3-211ENST00000559257 BIRC6Q9NR09 4857 aa3.26□□□□□ -1.89
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USP3-211ENST00000559257 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.2□□□□□ -1.9
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USP3-211ENST00000559257 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.17□□□□□ -1.9
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USP3-211ENST00000559257 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.17□□□□□ -1.9
USP3-211ENST00000559257 HERC2O95714 4834 aa3.16□□□□□ -1.9
USP3-211ENST00000559257 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.16□□□□□ -1.9
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USP3-211ENST00000559257 HERC1Q15751 4861 aa3.15□□□□□ -1.9
USP3-211ENST00000559257 KRTAP10-5P60370 271 aa3.15□□□□□ -1.9
USP3-211ENST00000559257 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.14□□□□□ -1.91
USP3-211ENST00000559257 KRTAP12-3P60328 96 aa3.13□□□□□ -1.91
USP3-211ENST00000559257 LRP2P98164 4655 aa3.13□□□□□ -1.91
USP3-211ENST00000559257 LPAP08519 4548 aa3.1□□□□□ -1.91
USP3-211ENST00000559257 MUC17Q685J3 4493 aa3.09□□□□□ -1.92
USP3-211ENST00000559257 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
USP3-211ENST00000559257 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.04□□□□□ -1.92
USP3-211ENST00000559257 M0R2T5 61 aa3.03□□□□□ -1.93
USP3-211ENST00000559257 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.02□□□□□ -1.93
USP3-211ENST00000559257 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.01□□□□□ -1.93
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