RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 CRCT1Q9UGL9 99 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRB-210ENST00000551525 ANK2Q01484 3957 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRB-210ENST00000551525 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa2.94□□□□□ -1.94
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
PTPRB-210ENST00000551525 COL7A1Q02388 2944 aa2.93□□□□□ -1.94
PTPRB-210ENST00000551525 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
PTPRB-210ENST00000551525 CMYA5Q8N3K9 4069 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
PTPRB-210ENST00000551525 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRB-210ENST00000551525 DNAH9Q9NYC9 4486 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRB-210ENST00000551525 DNAH3Q8TD57 4116 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRB-210ENST00000551525 DNAH1Q9P2D7 4330 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRB-210ENST00000551525 STARD9Q9P2P6 4700 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRB-210ENST00000551525 BIRC6Q9NR09 4857 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRB-210ENST00000551525 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRB-210ENST00000551525 CSMD3Q7Z407 3707 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRB-210ENST00000551525 LYSTQ99698 3801 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRB-210ENST00000551525 DNAH10Q8IVF4 4471 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP10-12P60413 245 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRB-210ENST00000551525 DNAH11Q96DT5 4516 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRB-210ENST00000551525 DNAH7Q8WXX0 4024 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRB-210ENST00000551525 SPRR2EP22531 72 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRB-210ENST00000551525 SPRR2BP35325 72 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRB-210ENST00000551525 SPRR2AP35326 72 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRB-210ENST00000551525 DNAH5Q8TE73 4624 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRB-210ENST00000551525 KMT2AQ03164 3969 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRB-210ENST00000551525 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
PTPRB-210ENST00000551525 HYDINQ4G0P3 5121 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRB-210ENST00000551525 VPS13DQ5THJ4 4388 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRB-210ENST00000551525 SACSQ9NZJ4 4579 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRB-210ENST00000551525 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRB-210ENST00000551525 MT1HP80294 61 aa2.65□□□□□ -1.98
PTPRB-210ENST00000551525 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRB-210ENST00000551525 SPRR2DP22532 72 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRB-210ENST00000551525 RYR2Q92736 4967 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRB-210ENST00000551525 DNAH2Q9P225 4427 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRB-210ENST00000551525 RYR3Q15413 4870 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRB-210ENST00000551525 PCLOQ9Y6V0 5065 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRB-210ENST00000551525 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRB-210ENST00000551525 LRP1BQ9NZR2 4599 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRB-210ENST00000551525 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRB-210ENST00000551525 DNAH17Q9UFH2 4485 aa2.59□□□□□ -2
PTPRB-210ENST00000551525 HERC1Q15751 4861 aa2.58□□□□□ -2
PTPRB-210ENST00000551525 FRAS1Q86XX4 4008 aa2.58□□□□□ -2
PTPRB-210ENST00000551525 HERC2O95714 4834 aa2.58□□□□□ -2
PTPRB-210ENST00000551525 MYCBP2O75592 4640 aa2.57□□□□□ -2
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
PTPRB-210ENST00000551525 MT2AP02795 61 aa2.56□□□□□ -2
PTPRB-210ENST00000551525 RYR1P21817 5038 aa2.56□□□□□ -2
PTPRB-210ENST00000551525 DNAH6Q9C0G6 4158 aa2.56□□□□□ -2
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.55□□□□□ -2
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP12-3P60328 96 aa2.55□□□□□ -2
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.55□□□□□ -2
PTPRB-210ENST00000551525 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PTPRB-210ENST00000551525 FAT2Q9NYQ8 4349 aa2.55□□□□□ -2
PTPRB-210ENST00000551525 SPRR2GQ9BYE4 73 aa2.55□□□□□ -2
PTPRB-210ENST00000551525 FAT1Q14517 4588 aa2.54□□□□□ -2
PTPRB-210ENST00000551525 PKHD1P08F94 4074 aa2.54□□□□□ -2
PTPRB-210ENST00000551525 MT3P25713 68 aa2.54□□□□□ -2
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA1109Q2LD37 5005 aa2.53□□□□□ -2
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRB-210ENST00000551525 PKD1P98161 4303 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRB-210ENST00000551525 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
PTPRB-210ENST00000551525 APOBP04114 4563 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
PTPRB-210ENST00000551525 FAT3Q8TDW7 4589 aa2.48□□□□□ -2.01
PTPRB-210ENST00000551525 HSPG2P98160 4391 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRB-210ENST00000551525 LCE3AQ5TA76 89 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRB-210ENST00000551525 DNAH8Q96JB1 4490 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRB-210ENST00000551525 MT1FP04733 61 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP12-4P60329 112 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRB-210ENST00000551525 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP10-5P60370 271 aa2.4□□□□□ -2.02
PTPRB-210ENST00000551525 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
PTPRB-210ENST00000551525 ABCA13Q86UQ4 5058 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRB-210ENST00000551525 LCE3BQ5TA77 95 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRB-210ENST00000551525 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa2.29□□□□□ -2.04
PTPRB-210ENST00000551525 TNXBP22105 4242 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa2.28□□□□□ -2.04
PTPRB-210ENST00000551525 MT1GP13640 62 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRB-210ENST00000551525 LCE4AQ5TA78 99 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRB-210ENST00000551525 LPAP08519 4548 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRB-210ENST00000551525 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRB-210ENST00000551525 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRB-210ENST00000551525 LRP2P98164 4655 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRB-210ENST00000551525 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.9 ms