RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa4.08□□□□□ -1.76
CS-212ENST00000548567 MUC17Q685J3 4493 aa4.08□□□□□ -1.76
CS-212ENST00000548567 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.08□□□□□ -1.76
CS-212ENST00000548567 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
CS-212ENST00000548567 PRAC1Q96KF2 57 aa4.08□□□□□ -1.76
CS-212ENST00000548567 LINC00472Q9H8W2 130 aa4.08□□□□□ -1.76
CS-212ENST00000548567 HRES1P13985 223 aa4.07□□□□□ -1.76
CS-212ENST00000548567 LINC00483Q53H64 154 aa4.07□□□□□ -1.76
CS-212ENST00000548567 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.07□□□□□ -1.76
CS-212ENST00000548567 SPRR1BP22528 89 aa4.04□□□□□ -1.76
CS-212ENST00000548567 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-212ENST00000548567 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-212ENST00000548567 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4□□□□□ -1.77
CS-212ENST00000548567 ACYP2P14621 99 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-212ENST00000548567 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.77
CS-212ENST00000548567 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
CS-212ENST00000548567 SSPOA2VEC9 5147 aa3.95□□□□□ -1.78
CS-212ENST00000548567 A0A1B0GVX0 72 aa3.95□□□□□ -1.78
CS-212ENST00000548567 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.95□□□□□ -1.78
CS-212ENST00000548567 A0A1B0GU69 56 aa3.95□□□□□ -1.78
CS-212ENST00000548567 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-212ENST00000548567 CSAG1Q6PB30 78 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-212ENST00000548567 UQCR11O14957 56 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-212ENST00000548567 MT1HP80294 61 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-212ENST00000548567 DMAC1Q96GE9 116 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-212ENST00000548567 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
CS-212ENST00000548567 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
CS-212ENST00000548567 LCE2CQ5TA81 110 aa3.91□□□□□ -1.78
CS-212ENST00000548567 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.9□□□□□ -1.78
CS-212ENST00000548567 IGKV2-30P06310 120 aa3.9□□□□□ -1.78
CS-212ENST00000548567 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.89□□□□□ -1.79
CS-212ENST00000548567 Q5W150 140 aa3.87□□□□□ -1.79
CS-212ENST00000548567 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.86□□□□□ -1.79
CS-212ENST00000548567 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.85□□□□□ -1.79
CS-212ENST00000548567 KRTAP10-10P60014 251 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-212ENST00000548567 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.8
CS-212ENST00000548567 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.8
CS-212ENST00000548567 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-212ENST00000548567 ROMO1P60602 79 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-212ENST00000548567 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-212ENST00000548567 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
CS-212ENST00000548567 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
CS-212ENST00000548567 A8MUU9 505 aa3.78□□□□□ -1.8
CS-212ENST00000548567 LORP23490 312 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
CS-212ENST00000548567 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
CS-212ENST00000548567 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa3.74□□□□□ -1.81
CS-212ENST00000548567 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa3.74□□□□□ -1.81
CS-212ENST00000548567 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
CS-212ENST00000548567 H0YAA0 97 aa3.71□□□□□ -1.82
CS-212ENST00000548567 KMT2DO14686 5537 aa3.71□□□□□ -1.82
CS-212ENST00000548567 MT1FP04733 61 aa3.71□□□□□ -1.82
CS-212ENST00000548567 P0C880 135 aa3.7□□□□□ -1.82
CS-212ENST00000548567 MT2AP02795 61 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-212ENST00000548567 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.67□□□□□ -1.82
CS-212ENST00000548567 A0A1B0GU33 70 aa3.66□□□□□ -1.82
CS-212ENST00000548567 K7ERS5 55 aa3.65□□□□□ -1.82
CS-212ENST00000548567 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.65□□□□□ -1.82
CS-212ENST00000548567 LCE2BO14633 110 aa3.65□□□□□ -1.83
CS-212ENST00000548567 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-212ENST00000548567 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.59□□□□□ -1.84
CS-212ENST00000548567 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.59□□□□□ -1.84
CS-212ENST00000548567 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
CS-212ENST00000548567 CRIPTQ9P021 101 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-212ENST00000548567 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.56□□□□□ -1.84
CS-212ENST00000548567 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-212ENST00000548567 NDUFAF8A1L188 74 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-212ENST00000548567 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
CS-212ENST00000548567 A0A0A0MQY5 61 aa3.53□□□□□ -1.84
CS-212ENST00000548567 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.53□□□□□ -1.84
CS-212ENST00000548567 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.52□□□□□ -1.85
CS-212ENST00000548567 MDN1Q9NU22 5596 aa3.52□□□□□ -1.85
CS-212ENST00000548567 S4R3F8 94 aa3.51□□□□□ -1.85
CS-212ENST00000548567 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.44□□□□□ -1.86
CS-212ENST00000548567 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.43□□□□□ -1.86
CS-212ENST00000548567 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.4□□□□□ -1.86
CS-212ENST00000548567 A0A0D9SG42 100 aa3.39□□□□□ -1.87
CS-212ENST00000548567 LUZP6Q538Z0 58 aa3.37□□□□□ -1.87
CS-212ENST00000548567 R4GN34 69 aa3.35□□□□□ -1.87
CS-212ENST00000548567 M0QZ58 72 aa3.34□□□□□ -1.87
CS-212ENST00000548567 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.34□□□□□ -1.88
CS-212ENST00000548567 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.34□□□□□ -1.88
CS-212ENST00000548567 KRTAP12-2P59991 146 aa3.32□□□□□ -1.88
CS-212ENST00000548567 KRTAP12-1P59990 96 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-212ENST00000548567 MT1BP07438 61 aa3.3□□□□□ -1.88
CS-212ENST00000548567 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.28□□□□□ -1.88
CS-212ENST00000548567 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.28□□□□□ -1.88
CS-212ENST00000548567 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.27□□□□□ -1.89
CS-212ENST00000548567 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.26□□□□□ -1.89
CS-212ENST00000548567 PLAC4Q8WY50 150 aa3.25□□□□□ -1.89
CS-212ENST00000548567 NEBP20929 6669 aa3.21□□□□□ -1.9
CS-212ENST00000548567 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
CS-212ENST00000548567 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.18□□□□□ -1.9
CS-212ENST00000548567 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.17□□□□□ -1.9
CS-212ENST00000548567 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.15□□□□□ -1.91
CS-212ENST00000548567 KRTAP10-5P60370 271 aa3.14□□□□□ -1.91
CS-212ENST00000548567 SPRR2EP22531 72 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-212ENST00000548567 SPRR2BP35325 72 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-212ENST00000548567 SPRR2AP35326 72 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-212ENST00000548567 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CS-212ENST00000548567 PP632Q6XCG6 107 aa3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms