RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 CXCL6P80162 114 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP12-2P59991 146 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRU-209ENST00000526080 ATXN8Q156A1 80 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRU-209ENST00000526080 CASC2Q6XLA1 102 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRU-209ENST00000526080 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.77□□□□□ -1.49
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PTPRU-209ENST00000526080 BPY2O14599 106 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRU-209ENST00000526080 Q8N9L7 120 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRU-209ENST00000526080 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa5.72□□□□□ -1.49
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PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRU-209ENST00000526080 A0A087WVE0 104 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRU-209ENST00000526080 K7EP34 96 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRU-209ENST00000526080 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
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PTPRU-209ENST00000526080 H3BT86 120 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PTPRU-209ENST00000526080 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP10-12P60413 245 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRU-209ENST00000526080 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.52□□□□□ -1.53
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PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRU-209ENST00000526080 UBL5Q9BZL1 73 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRU-209ENST00000526080 R4GN34 69 aa5.41□□□□□ -1.54
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PTPRU-209ENST00000526080 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.22□□□□□ -1.57
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PTPRU-209ENST00000526080 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRU-209ENST00000526080 OCR1Q9BZK8 76 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRU-209ENST00000526080 ACYP2P14621 99 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRU-209ENST00000526080 PCP4P48539 62 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRU-209ENST00000526080 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRU-209ENST00000526080 H7BZZ5 65 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRU-209ENST00000526080 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM258P61165 79 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRU-209ENST00000526080 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.62□□□□□ -1.67
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