RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP10-8P60410 259 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-211ENST00000503687 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1-211ENST00000503687 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-211ENST00000503687 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1-211ENST00000503687 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1-211ENST00000503687 PKHD1P08F94 4074 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1-211ENST00000503687 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-211ENST00000503687 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-211ENST00000503687 MYCBP2O75592 4640 aa6.43□□□□□ -1.38
RABGEF1-211ENST00000503687 M0R2T5 61 aa6.42□□□□□ -1.38
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.4□□□□□ -1.38
RABGEF1-211ENST00000503687 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
RABGEF1-211ENST00000503687 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGEF1-211ENST00000503687 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RABGEF1-211ENST00000503687 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-211ENST00000503687 RYR1P21817 5038 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGEF1-211ENST00000503687 MT1HL1P0DM35 61 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-211ENST00000503687 TPRXLQ17RH7 258 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGEF1-211ENST00000503687 RYR3Q15413 4870 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP12-2P59991 146 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-211ENST00000503687 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.3□□□□□ -1.4
RABGEF1-211ENST00000503687 NDUFAF8A1L188 74 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-211ENST00000503687 RYR2Q92736 4967 aa6.27□□□□□ -1.4
RABGEF1-211ENST00000503687 PKD1P98161 4303 aa6.27□□□□□ -1.4
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.24□□□□□ -1.41
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.23□□□□□ -1.41
RABGEF1-211ENST00000503687 LUZP6Q538Z0 58 aa6.22□□□□□ -1.41
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP12-1P59990 96 aa6.21□□□□□ -1.42
RABGEF1-211ENST00000503687 HSPG2P98160 4391 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-211ENST00000503687 PLAC4Q8WY50 150 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGEF1-211ENST00000503687 LRP2P98164 4655 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-211ENST00000503687 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-211ENST00000503687 TNP1P09430 55 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGEF1-211ENST00000503687 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-211ENST00000503687 HERC2O95714 4834 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGEF1-211ENST00000503687 LPAP08519 4548 aa5.9□□□□□ -1.46
RABGEF1-211ENST00000503687 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP10-10P60014 251 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A0A0MQY5 61 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-211ENST00000503687 PP632Q6XCG6 107 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-211ENST00000503687 TNXBP22105 4242 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-211ENST00000503687 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGEF1-211ENST00000503687 MUC2Q02817 5179 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGEF1-211ENST00000503687 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGEF1-211ENST00000503687 HERC1Q15751 4861 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGEF1-211ENST00000503687 RNF213Q63HN8 5207 aa5.48□□□□□ -1.53
RABGEF1-211ENST00000503687 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-211ENST00000503687 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-211ENST00000503687 MT1HP80294 61 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-211ENST00000503687 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-211ENST00000503687 LCE3AQ5TA76 89 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-211ENST00000503687 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-211ENST00000503687 MT2AP02795 61 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-211ENST00000503687 MT1FP04733 61 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.27□□□□□ -1.57
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP10-12P60413 245 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-211ENST00000503687 LCE2CQ5TA81 110 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-211ENST00000503687 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-211ENST00000503687 MUC17Q685J3 4493 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-211ENST00000503687 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-211ENST00000503687 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP12-3P60328 96 aa5.2□□□□□ -1.58
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-211ENST00000503687 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-211ENST00000503687 MT1BP07438 61 aa4.95□□□□□ -1.62
RABGEF1-211ENST00000503687 MT1XP80297 61 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP10-5P60370 271 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGEF1-211ENST00000503687 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1-211ENST00000503687 USH2AO75445 5202 aa4.83□□□□□ -1.64
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.81□□□□□ -1.64
RABGEF1-211ENST00000503687 LCE2BO14633 110 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGEF1-211ENST00000503687 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGEF1-211ENST00000503687 INE1O15225 51 aa4.73□□□□□ -1.65
RABGEF1-211ENST00000503687 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1-211ENST00000503687 KMT2DO14686 5537 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-211ENST00000503687 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1-211ENST00000503687 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1-211ENST00000503687 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1-211ENST00000503687 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1-211ENST00000503687 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1-211ENST00000503687 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGEF1-211ENST00000503687 MT1GP13640 62 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1-211ENST00000503687 MT1LQ93083 61 aa4.32□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms