RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492762.1

TMEM106B-208, Transcript of transmembrane protein 106B, human

TSL 4

Gene TMEM106B, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM106B-208	ENST00000492762	FRYL	O94915	3013 aa		0.3	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		0.3	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	FAM186A	A6NE01	2351 aa		0.3	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		0.3	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	KMT2D	O14686	5537 aa		0.3	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	0.3	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	SPRR2D	P22532	72 aa		0.3	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		0.3	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		0.3	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	0.3	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	FRY	Q5TBA9	3013 aa		0.3	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	HSPG2	P98160	4391 aa		0.29	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	C5orf42	Q9H799	3197 aa		0.29	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	MTOR	P42345	2549 aa		0.29	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	ANK2	Q01484	3957 aa		0.29	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	0.29	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	SPRR2B	P35325	72 aa		0.29	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		0.29	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		0.29	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		0.29	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	LAMA5	O15230	3695 aa		0.29	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	LAMA3	Q16787	3333 aa		0.29	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		0.29	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	KALRN	O60229	2985 aa		0.29	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		0.29	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		0.29	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	DNAH2	Q9P225	4427 aa		0.29	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		0.28	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		0.28	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		0.28	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		0.28	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	0.28	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		0.28	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	SPRR2A	P35326	72 aa		0.28	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		0.28	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	LAMA1	P25391	3075 aa		0.28	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		0.28	□□□□□ -2.36
TMEM106B-208	ENST00000492762	HTT	P42858	3142 aa		0.28	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		0.28	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		0.28	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	CENPE	Q02224	2701 aa		0.28	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	TG	P01266	2768 aa		0.28	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	ITPR1	Q14643	2758 aa		0.28	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		0.28	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	0.28	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		0.27	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		0.27	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		0.27	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		0.27	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	HIVEP1	P15822	2718 aa		0.27	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	FLNC	Q14315	2725 aa		0.27	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	ZZEF1	O43149	2961 aa		0.27	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	MT1A	P04731	61 aa		0.27	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		0.27	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	VCAN	P13611	3396 aa		0.27	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	UTRN	P46939	3433 aa		0.27	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		0.27	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		0.27	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	DMD	P11532	3685 aa		0.27	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	COL12A1	Q99715	3063 aa		0.27	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	PKD1	P98161	4303 aa		0.27	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		0.26	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		0.26	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	0.26	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	TRIO	O75962	3097 aa		0.26	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	SPRR2E	P22531	72 aa		0.26	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		0.26	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		0.26	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		0.26	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	0.26	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	HERC1	Q15751	4861 aa		0.25	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	FAT1	Q14517	4588 aa		0.25	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	PKHD1	P08F94	4074 aa		0.25	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	0.25	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	LRBA	P50851	2863 aa		0.25	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	ZAN	Q9Y493	2812 aa		0.25	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		0.25	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		0.25	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		0.25	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		0.25	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	EP400	Q96L91	3159 aa		0.25	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		0.25	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	TACC2	O95359	2948 aa		0.25	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		0.25	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	USP34	Q70CQ2	3546 aa		0.25	□□□□□ -2.37
TMEM106B-208	ENST00000492762	ATM	Q13315	3056 aa		0.24	□□□□□ -2.37

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