RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	FAT1	Q14517	4588 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ERCC3-208	ENST00000491292		Q5VSD8	79 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC3-208	ENST00000491292	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ERCC3-208	ENST00000491292	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC3-208	ENST00000491292	XP32	Q5T750	250 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ERCC3-208	ENST00000491292	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC3-208	ENST00000491292	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC3-208	ENST00000491292	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP12-1	P59990	96 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ERCC3-208	ENST00000491292		J3QL48	77 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A1B0GVY2	172 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A0A0MQY5	61 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ERCC3-208	ENST00000491292	PLAC4	Q8WY50	150 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ERCC3-208	ENST00000491292	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ERCC3-208	ENST00000491292	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ERCC3-208	ENST00000491292	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ERCC3-208	ENST00000491292	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ERCC3-208	ENST00000491292	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ERCC3-208	ENST00000491292	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ERCC3-208	ENST00000491292	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ERCC3-208	ENST00000491292	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ERCC3-208	ENST00000491292	PKD1	P98161	4303 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ERCC3-208	ENST00000491292	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ERCC3-208	ENST00000491292	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ERCC3-208	ENST00000491292	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ERCC3-208	ENST00000491292	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ERCC3-208	ENST00000491292	HSPG2	P98160	4391 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ERCC3-208	ENST00000491292	RYR2	Q92736	4967 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC3-208	ENST00000491292	LRP2	P98164	4655 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC3-208	ENST00000491292	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ERCC3-208	ENST00000491292	RYR3	Q15413	4870 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ERCC3-208	ENST00000491292	MT1HL1	P0DM35	61 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ERCC3-208	ENST00000491292	TNP1	P09430	55 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ERCC3-208	ENST00000491292	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ERCC3-208	ENST00000491292	RYR1	P21817	5038 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ERCC3-208	ENST00000491292		M0R2T5	61 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ERCC3-208	ENST00000491292	LPA	P08519	4548 aa		4.44	□□□□□ -1.7
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.44	□□□□□ -1.7
ERCC3-208	ENST00000491292	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ERCC3-208	ENST00000491292	TNXB	P22105	4242 aa		4.3	□□□□□ -1.72
ERCC3-208	ENST00000491292	HERC2	O95714	4834 aa		4.29	□□□□□ -1.72
ERCC3-208	ENST00000491292	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ERCC3-208	ENST00000491292	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP10-10	P60014	251 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ERCC3-208	ENST00000491292	MUC2	Q02817	5179 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ERCC3-208	ENST00000491292	LCE3A	Q5TA76	89 aa		4.15	□□□□□ -1.74
ERCC3-208	ENST00000491292	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ERCC3-208	ENST00000491292	HERC1	Q15751	4861 aa		4.03	□□□□□ -1.77
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4	□□□□□ -1.77
ERCC3-208	ENST00000491292	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4	□□□□□ -1.77
ERCC3-208	ENST00000491292	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ERCC3-208	ENST00000491292	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP12-3	P60328	96 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ERCC3-208	ENST00000491292	MUC17	Q685J3	4493 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ERCC3-208	ENST00000491292	INE1	O15225	51 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP10-12	P60413	245 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		3.92	□□□□□ -1.78
ERCC3-208	ENST00000491292	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		3.89	□□□□□ -1.79
ERCC3-208	ENST00000491292	RNF213	Q63HN8	5207 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ERCC3-208	ENST00000491292	MT1F	P04733	61 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ERCC3-208	ENST00000491292	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
ERCC3-208	ENST00000491292	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ERCC3-208	ENST00000491292	MT2A	P02795	61 aa		3.84	□□□□□ -1.8
ERCC3-208	ENST00000491292	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		3.82	□□□□□ -1.8
ERCC3-208	ENST00000491292	MT1H	P80294	61 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ERCC3-208	ENST00000491292	LCE2C	Q5TA81	110 aa		3.77	□□□□□ -1.81
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
ERCC3-208	ENST00000491292	MT1X	P80297	61 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP10-5	P60370	271 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		3.69	□□□□□ -1.82
ERCC3-208	ENST00000491292	MT1B	P07438	61 aa		3.68	□□□□□ -1.82
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ERCC3-208	ENST00000491292	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ERCC3-208	ENST00000491292	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ERCC3-208	ENST00000491292	KMT2D	O14686	5537 aa		3.61	□□□□□ -1.83
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		3.59	□□□□□ -1.83
ERCC3-208	ENST00000491292	USH2A	O75445	5202 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		3.57	□□□□□ -1.84
ERCC3-208	ENST00000491292	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		3.49	□□□□□ -1.85
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.43	□□□□□ -1.86
ERCC3-208	ENST00000491292	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
ERCC3-208	ENST00000491292	LCE2B	O14633	110 aa		3.4	□□□□□ -1.86
ERCC3-208	ENST00000491292	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ERCC3-208	ENST00000491292	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ERCC3-208	ENST00000491292	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
ERCC3-208	ENST00000491292	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
ERCC3-208	ENST00000491292	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ERCC3-208	ENST00000491292	MT1G	P13640	62 aa		3.3	□□□□□ -1.88
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP12-4	P60329	112 aa		3.3	□□□□□ -1.88

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