RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 A0A0D9SG42 100 aa7.19□□□□□ -1.26
NISCH-212ENST00000488380 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
NISCH-212ENST00000488380 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
NISCH-212ENST00000488380 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
NISCH-212ENST00000488380 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.09□□□□□ -1.27
NISCH-212ENST00000488380 TPRXLQ17RH7 258 aa7.08□□□□□ -1.28
NISCH-212ENST00000488380 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.08□□□□□ -1.28
NISCH-212ENST00000488380 NDUFAF8A1L188 74 aa7.07□□□□□ -1.28
NISCH-212ENST00000488380 TNXBP22105 4242 aa7.07□□□□□ -1.28
NISCH-212ENST00000488380 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.05□□□□□ -1.28
NISCH-212ENST00000488380 HSPG2P98160 4391 aa7.04□□□□□ -1.28
NISCH-212ENST00000488380 RYR3Q15413 4870 aa7.03□□□□□ -1.28
NISCH-212ENST00000488380 MYCBP2O75592 4640 aa7.02□□□□□ -1.29
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.01□□□□□ -1.29
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.96□□□□□ -1.3
NISCH-212ENST00000488380 Q5VSD8 79 aa6.92□□□□□ -1.3
NISCH-212ENST00000488380 RYR1P21817 5038 aa6.91□□□□□ -1.3
NISCH-212ENST00000488380 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.91□□□□□ -1.3
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.9□□□□□ -1.31
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP10-8P60410 259 aa6.9□□□□□ -1.31
NISCH-212ENST00000488380 S4R3F8 94 aa6.88□□□□□ -1.31
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.87□□□□□ -1.31
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.86□□□□□ -1.31
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP12-2P59991 146 aa6.84□□□□□ -1.31
NISCH-212ENST00000488380 LPAP08519 4548 aa6.84□□□□□ -1.32
NISCH-212ENST00000488380 XP32Q5T750 250 aa6.8□□□□□ -1.32
NISCH-212ENST00000488380 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
NISCH-212ENST00000488380 A0A0A0MQY5 61 aa6.76□□□□□ -1.33
NISCH-212ENST00000488380 LRP2P98164 4655 aa6.74□□□□□ -1.33
NISCH-212ENST00000488380 MT1HL1P0DM35 61 aa6.74□□□□□ -1.33
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP12-1P59990 96 aa6.72□□□□□ -1.33
NISCH-212ENST00000488380 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.71□□□□□ -1.34
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.58□□□□□ -1.36
NISCH-212ENST00000488380 M0QZ58 72 aa6.56□□□□□ -1.36
NISCH-212ENST00000488380 LUZP6Q538Z0 58 aa6.51□□□□□ -1.37
NISCH-212ENST00000488380 PLAC4Q8WY50 150 aa6.51□□□□□ -1.37
NISCH-212ENST00000488380 R4GN34 69 aa6.46□□□□□ -1.38
NISCH-212ENST00000488380 MUC17Q685J3 4493 aa6.39□□□□□ -1.39
NISCH-212ENST00000488380 HERC2O95714 4834 aa6.35□□□□□ -1.39
NISCH-212ENST00000488380 MUC2Q02817 5179 aa6.33□□□□□ -1.4
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.33□□□□□ -1.4
NISCH-212ENST00000488380 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.32□□□□□ -1.4
NISCH-212ENST00000488380 J3QL48 77 aa6.24□□□□□ -1.41
NISCH-212ENST00000488380 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.23□□□□□ -1.41
NISCH-212ENST00000488380 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
NISCH-212ENST00000488380 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.15□□□□□ -1.42
NISCH-212ENST00000488380 PP632Q6XCG6 107 aa6.15□□□□□ -1.43
NISCH-212ENST00000488380 HERC1Q15751 4861 aa6.14□□□□□ -1.43
NISCH-212ENST00000488380 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.09□□□□□ -1.43
NISCH-212ENST00000488380 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
NISCH-212ENST00000488380 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.01□□□□□ -1.45
NISCH-212ENST00000488380 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.99□□□□□ -1.45
NISCH-212ENST00000488380 TNP1P09430 55 aa5.94□□□□□ -1.46
NISCH-212ENST00000488380 RNF213Q63HN8 5207 aa5.89□□□□□ -1.47
NISCH-212ENST00000488380 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.84□□□□□ -1.47
NISCH-212ENST00000488380 LCE2CQ5TA81 110 aa5.81□□□□□ -1.48
NISCH-212ENST00000488380 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.79□□□□□ -1.48
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.71□□□□□ -1.5
NISCH-212ENST00000488380 M0R2T5 61 aa5.66□□□□□ -1.5
NISCH-212ENST00000488380 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.65□□□□□ -1.5
NISCH-212ENST00000488380 MT1HP80294 61 aa5.65□□□□□ -1.51
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.64□□□□□ -1.51
NISCH-212ENST00000488380 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.59□□□□□ -1.51
NISCH-212ENST00000488380 MT1FP04733 61 aa5.57□□□□□ -1.52
NISCH-212ENST00000488380 LCE3AQ5TA76 89 aa5.56□□□□□ -1.52
NISCH-212ENST00000488380 MT2AP02795 61 aa5.55□□□□□ -1.52
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP10-10P60014 251 aa5.53□□□□□ -1.52
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.51□□□□□ -1.53
NISCH-212ENST00000488380 INE1O15225 51 aa5.49□□□□□ -1.53
NISCH-212ENST00000488380 MT1BP07438 61 aa5.35□□□□□ -1.55
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.34□□□□□ -1.55
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP10-5P60370 271 aa5.31□□□□□ -1.56
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.31□□□□□ -1.56
NISCH-212ENST00000488380 MT1XP80297 61 aa5.3□□□□□ -1.56
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP12-3P60328 96 aa5.28□□□□□ -1.56
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.27□□□□□ -1.57
NISCH-212ENST00000488380 USH2AO75445 5202 aa5.26□□□□□ -1.57
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP10-12P60413 245 aa5.19□□□□□ -1.58
NISCH-212ENST00000488380 KMT2DO14686 5537 aa5.14□□□□□ -1.59
NISCH-212ENST00000488380 LCE2BO14633 110 aa5.12□□□□□ -1.59
NISCH-212ENST00000488380 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
NISCH-212ENST00000488380 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.95□□□□□ -1.62
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.94□□□□□ -1.62
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.93□□□□□ -1.62
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.93□□□□□ -1.62
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.82□□□□□ -1.64
NISCH-212ENST00000488380 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.8□□□□□ -1.64
NISCH-212ENST00000488380 SSPOA2VEC9 5147 aa4.77□□□□□ -1.65
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.73□□□□□ -1.65
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.73□□□□□ -1.65
NISCH-212ENST00000488380 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.69□□□□□ -1.66
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.69□□□□□ -1.66
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.69□□□□□ -1.66
NISCH-212ENST00000488380 MT1EP04732 61 aa4.57□□□□□ -1.68
NISCH-212ENST00000488380 MT1LQ93083 61 aa4.57□□□□□ -1.68
NISCH-212ENST00000488380 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
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