RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 LINC00208Q96KT6 92 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP5-208ENST00000459627 KLKP1Q107X0 134 aa10.75□□□□□ -0.69
SH3BP5-208ENST00000459627 OCR1Q9BZK8 76 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP5-208ENST00000459627 MT1BP07438 61 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP5-208ENST00000459627 SPRR2GQ9BYE4 73 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP5-208ENST00000459627 Q5VV11 94 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP5-208ENST00000459627 J3QR89 54 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP5-208ENST00000459627 MP68P56378 58 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP5-208ENST00000459627 NDUFC1O43677 76 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP5-208ENST00000459627 IMUPQ9GZP8 106 aa10.57□□□□□ -0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 A8MUN3 132 aa10.56□□□□□ -0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa10.56□□□□□ -0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 A6NN06 94 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 SCGB1A1P11684 91 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP5-208ENST00000459627 ADM2Q7Z4H4 148 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP5-208ENST00000459627 CRIPTQ9P021 101 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP5-208ENST00000459627 H0YAA0 97 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP5-208ENST00000459627 H3BPC8 53 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP5-208ENST00000459627 MT-ATP8P03928 68 aa10.43□□□□□ -0.74
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP10-5P60370 271 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP5-208ENST00000459627 DMAC1Q96GE9 116 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP5-208ENST00000459627 P0C880 135 aa10.29□□□□□ -0.76
SH3BP5-208ENST00000459627 K7ERU9 68 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP5-208ENST00000459627 NEBP20929 6669 aa10.23□□□□□ -0.77
SH3BP5-208ENST00000459627 TRAV7A0A075B6U4 112 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP5-208ENST00000459627 R4GN34 69 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP5-208ENST00000459627 SMIM20Q8N5G0 67 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP5-208ENST00000459627 M0QZ58 72 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP5-208ENST00000459627 SNURFQ9Y675 71 aa10.11□□□□□ -0.79
SH3BP5-208ENST00000459627 MUC12Q9UKN1 5478 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP5-208ENST00000459627 ACYP2P14621 99 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP5-208ENST00000459627 C20orf197Q8N268 126 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP5-208ENST00000459627 PLAC4Q8WY50 150 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP5-208ENST00000459627 MT1XP80297 61 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP5-208ENST00000459627 LINC01554Q52M75 96 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP5-208ENST00000459627 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 PRO2289Q9P1D8 64 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP5-9P26371 169 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 SPTSSBQ8NFR3 76 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 KMT2DO14686 5537 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP5-208ENST00000459627 SERP2Q8N6R1 65 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP5-208ENST00000459627 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa9.82□□□□□ -0.84
SH3BP5-208ENST00000459627 MDN1Q9NU22 5596 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP5-208ENST00000459627 SPRR2FQ96RM1 72 aa9.73□□□□□ -0.85
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP12-2P59991 146 aa9.7□□□□□ -0.86
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP5-208ENST00000459627 COA5Q86WW8 74 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
SH3BP5-208ENST00000459627 COX7CP15954 63 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP5-208ENST00000459627 SPRR2EP22531 72 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP5-208ENST00000459627 SPRR2BP35325 72 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP5-208ENST00000459627 SPRR2AP35326 72 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP5-208ENST00000459627 CYSTM1Q9H1C7 97 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP10-12P60413 245 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP5-208ENST00000459627 H7BZZ5 65 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP5-208ENST00000459627 LCE1AQ5T7P2 110 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A0D9SG42 100 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP5-208ENST00000459627 SERP1Q9Y6X1 66 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP5-208ENST00000459627 SEC61GP60059 68 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP5-208ENST00000459627 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa9.37□□□□□ -0.91
SH3BP5-208ENST00000459627 SPATA8Q6RVD6 105 aa9.35□□□□□ -0.91
SH3BP5-208ENST00000459627 ANAPC13Q9BS18 74 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A1B0GU33 70 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BP5-208ENST00000459627 SPRR2DP22532 72 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC179H3BU77 68 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP5-208ENST00000459627 SPINT4Q6UDR6 99 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP12-1P59990 96 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP5-208ENST00000459627 A0A1B0GU69 56 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP5-208ENST00000459627 A8MU10 97 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP5-208ENST00000459627 LCE3BQ5TA77 95 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP5-208ENST00000459627 SMIM26A0A096LP01 95 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP5-208ENST00000459627 MT1EP04732 61 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP5-208ENST00000459627 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa8.81□□□□□ -1
SH3BP5-208ENST00000459627 LCE5AQ5TCM9 118 aa8.79□□□□□ -1
SH3BP5-208ENST00000459627 PRR15LQ9BU68 103 aa8.79□□□□□ -1
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa8.78□□□□□ -1
SH3BP5-208ENST00000459627 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.78□□□□□ -1
SH3BP5-208ENST00000459627 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM258P61165 79 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP5-208ENST00000459627 LCE3AQ5TA76 89 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP5-208ENST00000459627 TNP1P09430 55 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP5-208ENST00000459627 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SH3BP5-208ENST00000459627 MT1GP13640 62 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP5-208ENST00000459627 UQCR11O14957 56 aa8.53□□□□□ -1.04
SH3BP5-208ENST00000459627 MT1LQ93083 61 aa8.52□□□□□ -1.05
SH3BP5-208ENST00000459627 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa8.51□□□□□ -1.05
SH3BP5-208ENST00000459627 MT1MQ8N339 61 aa8.48□□□□□ -1.05
SH3BP5-208ENST00000459627 GPR98Q8WXG9 6306 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.8 ms