RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-201ENST00000389413 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRN2-201ENST00000389413 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRN2-201ENST00000389413 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRN2-201ENST00000389413 DNHD1Q96M86 4753 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRN2-201ENST00000389413 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRN2-201ENST00000389413 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRN2-201ENST00000389413 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRN2-201ENST00000389413 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRN2-201ENST00000389413 KMT2AQ03164 3969 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRN2-201ENST00000389413 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRN2-201ENST00000389413 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRN2-201ENST00000389413 DNAH2Q9P225 4427 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRN2-201ENST00000389413 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRN2-201ENST00000389413 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRN2-201ENST00000389413 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRN2-201ENST00000389413 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
PTPRN2-201ENST00000389413 FAT1Q14517 4588 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRN2-201ENST00000389413 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRN2-201ENST00000389413 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRN2-201ENST00000389413 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRN2-201ENST00000389413 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRN2-201ENST00000389413 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRN2-201ENST00000389413 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRN2-201ENST00000389413 MYCBP2O75592 4640 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRN2-201ENST00000389413 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP10-12P60413 245 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRN2-201ENST00000389413 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRN2-201ENST00000389413 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRN2-201ENST00000389413 LCE3AQ5TA76 89 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRN2-201ENST00000389413 RYR1P21817 5038 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRN2-201ENST00000389413 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP12-3P60328 96 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRN2-201ENST00000389413 PKHD1P08F94 4074 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRN2-201ENST00000389413 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRN2-201ENST00000389413 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRN2-201ENST00000389413 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRN2-201ENST00000389413 INE1O15225 51 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRN2-201ENST00000389413 RYR3Q15413 4870 aa6.59□□□□□ -1.36
PTPRN2-201ENST00000389413 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRN2-201ENST00000389413 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRN2-201ENST00000389413 MT1HP80294 61 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRN2-201ENST00000389413 MT2AP02795 61 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRN2-201ENST00000389413 RYR2Q92736 4967 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRN2-201ENST00000389413 MT1FP04733 61 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRN2-201ENST00000389413 LRP2P98164 4655 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRN2-201ENST00000389413 PKD1P98161 4303 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRN2-201ENST00000389413 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRN2-201ENST00000389413 HSPG2P98160 4391 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRN2-201ENST00000389413 LPAP08519 4548 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRN2-201ENST00000389413 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRN2-201ENST00000389413 HERC2O95714 4834 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRN2-201ENST00000389413 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRN2-201ENST00000389413 TNXBP22105 4242 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRN2-201ENST00000389413 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRN2-201ENST00000389413 LCE2CQ5TA81 110 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRN2-201ENST00000389413 MT1XP80297 61 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRN2-201ENST00000389413 MUC2Q02817 5179 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRN2-201ENST00000389413 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6□□□□□ -1.45
PTPRN2-201ENST00000389413 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6□□□□□ -1.45
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6□□□□□ -1.45
PTPRN2-201ENST00000389413 MT1BP07438 61 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP10-5P60370 271 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRN2-201ENST00000389413 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRN2-201ENST00000389413 HERC1Q15751 4861 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRN2-201ENST00000389413 MUC17Q685J3 4493 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRN2-201ENST00000389413 RNF213Q63HN8 5207 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRN2-201ENST00000389413 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRN2-201ENST00000389413 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRN2-201ENST00000389413 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRN2-201ENST00000389413 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRN2-201ENST00000389413 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRN2-201ENST00000389413 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRN2-201ENST00000389413 LCE2BO14633 110 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRN2-201ENST00000389413 MT1GP13640 62 aa5.46□□□□□ -1.53
PTPRN2-201ENST00000389413 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRN2-201ENST00000389413 MT1LQ93083 61 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP12-4P60329 112 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRN2-201ENST00000389413 LCE3BQ5TA77 95 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRN2-201ENST00000389413 MT1EP04732 61 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRN2-201ENST00000389413 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRN2-201ENST00000389413 SPRR2EP22531 72 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRN2-201ENST00000389413 SPRR2BP35325 72 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRN2-201ENST00000389413 SPRR2AP35326 72 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRN2-201ENST00000389413 USH2AO75445 5202 aa5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.2 ms