RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

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Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP10-8P60410 259 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD1-202ENST00000375175 Q5VSD8 79 aa6.86□□□□□ -1.31
TMOD1-202ENST00000375175 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TMOD1-202ENST00000375175 RYR3Q15413 4870 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD1-202ENST00000375175 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD1-202ENST00000375175 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD1-202ENST00000375175 TNXBP22105 4242 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD1-202ENST00000375175 TPRXLQ17RH7 258 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD1-202ENST00000375175 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
TMOD1-202ENST00000375175 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TMOD1-202ENST00000375175 XP32Q5T750 250 aa6.78□□□□□ -1.32
TMOD1-202ENST00000375175 A0A0D9SG42 100 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD1-202ENST00000375175 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.76□□□□□ -1.33
TMOD1-202ENST00000375175 HSPG2P98160 4391 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
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TMOD1-202ENST00000375175 S4R3F8 94 aa6.71□□□□□ -1.34
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TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.68□□□□□ -1.34
TMOD1-202ENST00000375175 MYCBP2O75592 4640 aa6.68□□□□□ -1.34
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TMOD1-202ENST00000375175 MT1HL1P0DM35 61 aa6.64□□□□□ -1.35
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.64□□□□□ -1.35
TMOD1-202ENST00000375175 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.62□□□□□ -1.35
TMOD1-202ENST00000375175 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP12-2P59991 146 aa6.56□□□□□ -1.36
TMOD1-202ENST00000375175 LPAP08519 4548 aa6.49□□□□□ -1.37
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP12-1P59990 96 aa6.46□□□□□ -1.37
TMOD1-202ENST00000375175 LRP2P98164 4655 aa6.46□□□□□ -1.37
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.37□□□□□ -1.39
TMOD1-202ENST00000375175 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.35□□□□□ -1.39
TMOD1-202ENST00000375175 M0QZ58 72 aa6.35□□□□□ -1.39
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TMOD1-202ENST00000375175 A0A0A0MQY5 61 aa6.27□□□□□ -1.41
TMOD1-202ENST00000375175 R4GN34 69 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD1-202ENST00000375175 J3QL48 77 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD1-202ENST00000375175 PLAC4Q8WY50 150 aa6.19□□□□□ -1.42
TMOD1-202ENST00000375175 HERC2O95714 4834 aa6.18□□□□□ -1.42
TMOD1-202ENST00000375175 MUC17Q685J3 4493 aa6.17□□□□□ -1.42
TMOD1-202ENST00000375175 LUZP6Q538Z0 58 aa6.17□□□□□ -1.42
TMOD1-202ENST00000375175 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.14□□□□□ -1.43
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TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.03□□□□□ -1.44
TMOD1-202ENST00000375175 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.03□□□□□ -1.44
TMOD1-202ENST00000375175 HERC1Q15751 4861 aa5.96□□□□□ -1.46
TMOD1-202ENST00000375175 MUC2Q02817 5179 aa5.95□□□□□ -1.46
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TMOD1-202ENST00000375175 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
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TMOD1-202ENST00000375175 TNP1P09430 55 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD1-202ENST00000375175 LCE2CQ5TA81 110 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD1-202ENST00000375175 M0R2T5 61 aa5.67□□□□□ -1.5
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TMOD1-202ENST00000375175 MT1HP80294 61 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP10-10P60014 251 aa5.52□□□□□ -1.53
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TMOD1-202ENST00000375175 MT1FP04733 61 aa5.47□□□□□ -1.53
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TMOD1-202ENST00000375175 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.42□□□□□ -1.54
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TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.33□□□□□ -1.56
TMOD1-202ENST00000375175 MT1BP07438 61 aa5.28□□□□□ -1.56
TMOD1-202ENST00000375175 INE1O15225 51 aa5.27□□□□□ -1.57
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP10-5P60370 271 aa5.26□□□□□ -1.57
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TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.21□□□□□ -1.58
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.19□□□□□ -1.58
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TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP12-3P60328 96 aa5.13□□□□□ -1.59
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TMOD1-202ENST00000375175 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.82□□□□□ -1.64
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.82□□□□□ -1.64
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TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.67□□□□□ -1.66
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.62□□□□□ -1.67
TMOD1-202ENST00000375175 SSPOA2VEC9 5147 aa4.6□□□□□ -1.67
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.58□□□□□ -1.68
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.58□□□□□ -1.68
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.58□□□□□ -1.68
TMOD1-202ENST00000375175 MT1LQ93083 61 aa4.54□□□□□ -1.68
TMOD1-202ENST00000375175 MT1EP04732 61 aa4.54□□□□□ -1.68
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.5□□□□□ -1.69
TMOD1-202ENST00000375175 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.46□□□□□ -1.7
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