RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa2.04□□□□□ -2.08
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PTPRD-201ENST00000355233 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
PTPRD-201ENST00000355233 ANK2Q01484 3957 aa2.04□□□□□ -2.08
PTPRD-201ENST00000355233 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa2.04□□□□□ -2.08
PTPRD-201ENST00000355233 LAMA3Q16787 3333 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRD-201ENST00000355233 LORP23490 312 aaPredicted RBP2.02□□□□□ -2.09
PTPRD-201ENST00000355233 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
PTPRD-201ENST00000355233 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa2.01□□□□□ -2.09
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PTPRD-201ENST00000355233 DNAH2Q9P225 4427 aa2.01□□□□□ -2.09
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PTPRD-201ENST00000355233 COL7A1Q02388 2944 aa2□□□□□ -2.09
PTPRD-201ENST00000355233 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
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PTPRD-201ENST00000355233 CDH23Q9H251 3354 aa1.99□□□□□ -2.09
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PTPRD-201ENST00000355233 LCE3BQ5TA77 95 aa1.82□□□□□ -2.12
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PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa1.72□□□□□ -2.13
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa1.71□□□□□ -2.13
PTPRD-201ENST00000355233 MT1BP07438 61 aa1.71□□□□□ -2.14
PTPRD-201ENST00000355233 TNXBP22105 4242 aa1.7□□□□□ -2.14
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP12-4P60329 112 aa1.69□□□□□ -2.14
PTPRD-201ENST00000355233 KMT2DO14686 5537 aa1.69□□□□□ -2.14
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