RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRU-201ENST00000345512 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRU-201ENST00000345512 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRU-201ENST00000345512 KMT2AQ03164 3969 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRU-201ENST00000345512 DNAH2Q9P225 4427 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRU-201ENST00000345512 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRU-201ENST00000345512 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRU-201ENST00000345512 TNP1P09430 55 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRU-201ENST00000345512 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRU-201ENST00000345512 PP632Q6XCG6 107 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRU-201ENST00000345512 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRU-201ENST00000345512 DNHD1Q96M86 4753 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRU-201ENST00000345512 FAT1Q14517 4588 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRU-201ENST00000345512 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRU-201ENST00000345512 MT1HL1P0DM35 61 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRU-201ENST00000345512 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRU-201ENST00000345512 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRU-201ENST00000345512 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRU-201ENST00000345512 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRU-201ENST00000345512 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRU-201ENST00000345512 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRU-201ENST00000345512 MYCBP2O75592 4640 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRU-201ENST00000345512 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.06□□□□□ -1.28
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PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP10-10P60014 251 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRU-201ENST00000345512 HYDINQ4G0P3 5121 aa7□□□□□ -1.29
PTPRU-201ENST00000345512 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRU-201ENST00000345512 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
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PTPRU-201ENST00000345512 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRU-201ENST00000345512 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRU-201ENST00000345512 PKD1P98161 4303 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRU-201ENST00000345512 RYR3Q15413 4870 aa6.72□□□□□ -1.33
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PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.6□□□□□ -1.35
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PTPRU-201ENST00000345512 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP10-12P60413 245 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRU-201ENST00000345512 TNXBP22105 4242 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP12-3P60328 96 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRU-201ENST00000345512 LPAP08519 4548 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRU-201ENST00000345512 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRU-201ENST00000345512 INE1O15225 51 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRU-201ENST00000345512 HERC2O95714 4834 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRU-201ENST00000345512 MT1HP80294 61 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRU-201ENST00000345512 MT2AP02795 61 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRU-201ENST00000345512 MT1FP04733 61 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.18□□□□□ -1.42
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PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.09□□□□□ -1.43
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PTPRU-201ENST00000345512 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRU-201ENST00000345512 MUC17Q685J3 4493 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRU-201ENST00000345512 LCE2CQ5TA81 110 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRU-201ENST00000345512 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
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PTPRU-201ENST00000345512 MT1XP80297 61 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRU-201ENST00000345512 HERC1Q15751 4861 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP10-5P60370 271 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRU-201ENST00000345512 MUC2Q02817 5179 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRU-201ENST00000345512 MT1BP07438 61 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRU-201ENST00000345512 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRU-201ENST00000345512 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRU-201ENST00000345512 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRU-201ENST00000345512 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRU-201ENST00000345512 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.66□□□□□ -1.5
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PTPRU-201ENST00000345512 RNF213Q63HN8 5207 aa5.58□□□□□ -1.52
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PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRU-201ENST00000345512 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.53□□□□□ -1.52
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PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRU-201ENST00000345512 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRU-201ENST00000345512 MT1GP13640 62 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRU-201ENST00000345512 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRU-201ENST00000345512 MT1LQ93083 61 aa5.21□□□□□ -1.58
PTPRU-201ENST00000345512 MT1EP04732 61 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP12-4P60329 112 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRU-201ENST00000345512 LCE3BQ5TA77 95 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRU-201ENST00000345512 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRU-201ENST00000345512 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
PTPRU-201ENST00000345512 USH2AO75445 5202 aa5□□□□□ -1.61
PTPRU-201ENST00000345512 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5□□□□□ -1.61
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