RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306117.5

KCNS1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 4,538 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-201ENST00000306117 DNHD1Q96M86 4753 aa7.53□□□□□ -1.2
KCNS1-201ENST00000306117 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.51□□□□□ -1.21
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.48□□□□□ -1.21
KCNS1-201ENST00000306117 FAT1Q14517 4588 aa7.48□□□□□ -1.21
KCNS1-201ENST00000306117 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.47□□□□□ -1.21
KCNS1-201ENST00000306117 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.47□□□□□ -1.21
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP10-10P60014 251 aa7.46□□□□□ -1.21
KCNS1-201ENST00000306117 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.45□□□□□ -1.22
KCNS1-201ENST00000306117 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7.45□□□□□ -1.22
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.44□□□□□ -1.22
KCNS1-201ENST00000306117 DNAH2Q9P225 4427 aa7.39□□□□□ -1.23
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
KCNS1-201ENST00000306117 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.37□□□□□ -1.23
KCNS1-201ENST00000306117 MYCBP2O75592 4640 aa7.31□□□□□ -1.24
KCNS1-201ENST00000306117 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.31□□□□□ -1.24
KCNS1-201ENST00000306117 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.29□□□□□ -1.24
KCNS1-201ENST00000306117 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.25□□□□□ -1.25
KCNS1-201ENST00000306117 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.24□□□□□ -1.25
KCNS1-201ENST00000306117 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
KCNS1-201ENST00000306117 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.2□□□□□ -1.26
KCNS1-201ENST00000306117 MT1HL1P0DM35 61 aa7.19□□□□□ -1.26
KCNS1-201ENST00000306117 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.19□□□□□ -1.26
KCNS1-201ENST00000306117 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
KCNS1-201ENST00000306117 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.06□□□□□ -1.28
KCNS1-201ENST00000306117 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
KCNS1-201ENST00000306117 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
KCNS1-201ENST00000306117 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.04□□□□□ -1.28
KCNS1-201ENST00000306117 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.04□□□□□ -1.28
KCNS1-201ENST00000306117 INE1O15225 51 aa7.04□□□□□ -1.28
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.03□□□□□ -1.28
KCNS1-201ENST00000306117 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
KCNS1-201ENST00000306117 RYR1P21817 5038 aa6.98□□□□□ -1.29
KCNS1-201ENST00000306117 PKHD1P08F94 4074 aa6.96□□□□□ -1.3
KCNS1-201ENST00000306117 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.93□□□□□ -1.3
KCNS1-201ENST00000306117 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.89□□□□□ -1.31
KCNS1-201ENST00000306117 LRP2P98164 4655 aa6.76□□□□□ -1.33
KCNS1-201ENST00000306117 RYR3Q15413 4870 aa6.74□□□□□ -1.33
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.73□□□□□ -1.33
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.71□□□□□ -1.33
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP10-12P60413 245 aa6.69□□□□□ -1.34
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP12-3P60328 96 aa6.66□□□□□ -1.34
KCNS1-201ENST00000306117 LCE3AQ5TA76 89 aa6.64□□□□□ -1.35
KCNS1-201ENST00000306117 PKD1P98161 4303 aa6.62□□□□□ -1.35
KCNS1-201ENST00000306117 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.59□□□□□ -1.35
KCNS1-201ENST00000306117 HSPG2P98160 4391 aa6.58□□□□□ -1.36
KCNS1-201ENST00000306117 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.56□□□□□ -1.36
KCNS1-201ENST00000306117 RYR2Q92736 4967 aa6.52□□□□□ -1.37
KCNS1-201ENST00000306117 LPAP08519 4548 aa6.5□□□□□ -1.37
KCNS1-201ENST00000306117 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.34□□□□□ -1.39
KCNS1-201ENST00000306117 HERC2O95714 4834 aa6.28□□□□□ -1.4
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP10-5P60370 271 aa6.26□□□□□ -1.41
KCNS1-201ENST00000306117 TNXBP22105 4242 aa6.24□□□□□ -1.41
KCNS1-201ENST00000306117 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
KCNS1-201ENST00000306117 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.12□□□□□ -1.43
KCNS1-201ENST00000306117 MT1HP80294 61 aa6.1□□□□□ -1.43
KCNS1-201ENST00000306117 MUC2Q02817 5179 aa6.1□□□□□ -1.43
KCNS1-201ENST00000306117 MT2AP02795 61 aa6.1□□□□□ -1.43
KCNS1-201ENST00000306117 MT1FP04733 61 aa6.1□□□□□ -1.43
KCNS1-201ENST00000306117 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.09□□□□□ -1.43
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.04□□□□□ -1.44
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.95□□□□□ -1.46
KCNS1-201ENST00000306117 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.91□□□□□ -1.46
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.9□□□□□ -1.47
KCNS1-201ENST00000306117 MUC17Q685J3 4493 aa5.88□□□□□ -1.47
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.84□□□□□ -1.47
KCNS1-201ENST00000306117 RNF213Q63HN8 5207 aa5.83□□□□□ -1.48
KCNS1-201ENST00000306117 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.83□□□□□ -1.48
KCNS1-201ENST00000306117 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.83□□□□□ -1.48
KCNS1-201ENST00000306117 LCE2CQ5TA81 110 aa5.82□□□□□ -1.48
KCNS1-201ENST00000306117 HERC1Q15751 4861 aa5.8□□□□□ -1.48
KCNS1-201ENST00000306117 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.79□□□□□ -1.48
KCNS1-201ENST00000306117 MT1XP80297 61 aa5.76□□□□□ -1.49
KCNS1-201ENST00000306117 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
KCNS1-201ENST00000306117 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.73□□□□□ -1.49
KCNS1-201ENST00000306117 MT1BP07438 61 aa5.72□□□□□ -1.49
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.71□□□□□ -1.49
KCNS1-201ENST00000306117 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.71□□□□□ -1.5
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.68□□□□□ -1.5
KCNS1-201ENST00000306117 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
KCNS1-201ENST00000306117 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.63□□□□□ -1.51
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.6□□□□□ -1.51
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.6□□□□□ -1.51
KCNS1-201ENST00000306117 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.58□□□□□ -1.52
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP12-4P60329 112 aa5.56□□□□□ -1.52
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.47□□□□□ -1.53
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.45□□□□□ -1.54
KCNS1-201ENST00000306117 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.42□□□□□ -1.54
KCNS1-201ENST00000306117 LCE3BQ5TA77 95 aa5.4□□□□□ -1.55
KCNS1-201ENST00000306117 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.37□□□□□ -1.55
KCNS1-201ENST00000306117 LCE2BO14633 110 aa5.34□□□□□ -1.55
KCNS1-201ENST00000306117 MT1GP13640 62 aa5.32□□□□□ -1.56
KCNS1-201ENST00000306117 USH2AO75445 5202 aa5.28□□□□□ -1.56
KCNS1-201ENST00000306117 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.27□□□□□ -1.57
KCNS1-201ENST00000306117 KMT2DO14686 5537 aa5.26□□□□□ -1.57
KCNS1-201ENST00000306117 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.15□□□□□ -1.59
KCNS1-201ENST00000306117 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
KCNS1-201ENST00000306117 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.7 ms