RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
HERC3-201ENST00000264345 P0C880 135 aa4.42□□□□□ -1.7
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
HERC3-201ENST00000264345 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.41□□□□□ -1.7
HERC3-201ENST00000264345 SACSQ9NZJ4 4579 aa4.4□□□□□ -1.7
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.38□□□□□ -1.71
HERC3-201ENST00000264345 LYSTQ99698 3801 aa4.37□□□□□ -1.71
HERC3-201ENST00000264345 KMT2AQ03164 3969 aa4.37□□□□□ -1.71
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.36□□□□□ -1.71
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.34□□□□□ -1.71
HERC3-201ENST00000264345 LRP1BQ9NZR2 4599 aa4.33□□□□□ -1.72
HERC3-201ENST00000264345 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
HERC3-201ENST00000264345 MT1HL1P0DM35 61 aa4.33□□□□□ -1.72
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP12-2P59991 146 aa4.33□□□□□ -1.72
HERC3-201ENST00000264345 FRAS1Q86XX4 4008 aa4.32□□□□□ -1.72
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP12-1P59990 96 aa4.31□□□□□ -1.72
HERC3-201ENST00000264345 FAT2Q9NYQ8 4349 aa4.3□□□□□ -1.72
HERC3-201ENST00000264345 PP632Q6XCG6 107 aa4.29□□□□□ -1.72
HERC3-201ENST00000264345 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.28□□□□□ -1.72
HERC3-201ENST00000264345 PKD1P98161 4303 aa4.23□□□□□ -1.73
HERC3-201ENST00000264345 TNP1P09430 55 aa4.22□□□□□ -1.73
HERC3-201ENST00000264345 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
HERC3-201ENST00000264345 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.18□□□□□ -1.74
HERC3-201ENST00000264345 DNHD1Q96M86 4753 aa4.17□□□□□ -1.74
HERC3-201ENST00000264345 FAT1Q14517 4588 aa4.13□□□□□ -1.75
HERC3-201ENST00000264345 HYDINQ4G0P3 5121 aa4.12□□□□□ -1.75
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.1□□□□□ -1.75
HERC3-201ENST00000264345 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.09□□□□□ -1.75
HERC3-201ENST00000264345 PKHD1P08F94 4074 aa4.07□□□□□ -1.76
HERC3-201ENST00000264345 RYR2Q92736 4967 aa4.04□□□□□ -1.76
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.01□□□□□ -1.77
HERC3-201ENST00000264345 TNXBP22105 4242 aa3.99□□□□□ -1.77
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.98□□□□□ -1.77
HERC3-201ENST00000264345 RYR1P21817 5038 aa3.98□□□□□ -1.77
HERC3-201ENST00000264345 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
HERC3-201ENST00000264345 LORP23490 312 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.94□□□□□ -1.78
HERC3-201ENST00000264345 MYCBP2O75592 4640 aa3.93□□□□□ -1.78
HERC3-201ENST00000264345 HSPG2P98160 4391 aa3.93□□□□□ -1.78
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP10-10P60014 251 aa3.92□□□□□ -1.78
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.91□□□□□ -1.78
HERC3-201ENST00000264345 RYR3Q15413 4870 aa3.83□□□□□ -1.8
HERC3-201ENST00000264345 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.83□□□□□ -1.8
HERC3-201ENST00000264345 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
HERC3-201ENST00000264345 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.76□□□□□ -1.81
HERC3-201ENST00000264345 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.75□□□□□ -1.81
HERC3-201ENST00000264345 MUC17Q685J3 4493 aa3.74□□□□□ -1.81
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.7□□□□□ -1.82
HERC3-201ENST00000264345 LRP2P98164 4655 aa3.66□□□□□ -1.82
HERC3-201ENST00000264345 MT1HP80294 61 aa3.66□□□□□ -1.82
HERC3-201ENST00000264345 LCE3AQ5TA76 89 aa3.66□□□□□ -1.82
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP10-12P60413 245 aa3.64□□□□□ -1.83
HERC3-201ENST00000264345 MT2AP02795 61 aa3.62□□□□□ -1.83
HERC3-201ENST00000264345 HERC1Q15751 4861 aa3.61□□□□□ -1.83
HERC3-201ENST00000264345 INE1O15225 51 aa3.6□□□□□ -1.83
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP12-3P60328 96 aa3.59□□□□□ -1.83
HERC3-201ENST00000264345 LPAP08519 4548 aa3.59□□□□□ -1.83
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.58□□□□□ -1.84
HERC3-201ENST00000264345 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
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HERC3-201ENST00000264345 LCE2CQ5TA81 110 aa3.56□□□□□ -1.84
HERC3-201ENST00000264345 BIRC6Q9NR09 4857 aa3.55□□□□□ -1.84
HERC3-201ENST00000264345 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.55□□□□□ -1.84
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.53□□□□□ -1.84
HERC3-201ENST00000264345 HERC2O95714 4834 aa3.53□□□□□ -1.84
HERC3-201ENST00000264345 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
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HERC3-201ENST00000264345 ABCA13Q86UQ4 5058 aa3.46□□□□□ -1.86
HERC3-201ENST00000264345 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.44□□□□□ -1.86
HERC3-201ENST00000264345 MT1BP07438 61 aa3.42□□□□□ -1.86
HERC3-201ENST00000264345 MT1XP80297 61 aa3.42□□□□□ -1.86
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP10-5P60370 271 aa3.42□□□□□ -1.86
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.39□□□□□ -1.87
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.36□□□□□ -1.87
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.32□□□□□ -1.88
HERC3-201ENST00000264345 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.32□□□□□ -1.88
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HERC3-201ENST00000264345 RNF213Q63HN8 5207 aa3.2□□□□□ -1.9
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HERC3-201ENST00000264345 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.15□□□□□ -1.91
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.07□□□□□ -1.92
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.07□□□□□ -1.92
HERC3-201ENST00000264345 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.03□□□□□ -1.92
HERC3-201ENST00000264345 MT1LQ93083 61 aa3.03□□□□□ -1.93
HERC3-201ENST00000264345 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.02□□□□□ -1.93
HERC3-201ENST00000264345 MT1EP04732 61 aa3.02□□□□□ -1.93
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.98□□□□□ -1.93
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.97□□□□□ -1.93
HERC3-201ENST00000264345 MT1GP13640 62 aa2.96□□□□□ -1.94
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.93□□□□□ -1.94
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.93□□□□□ -1.94
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.93□□□□□ -1.94
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa2.91□□□□□ -1.94
HERC3-201ENST00000264345 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.9□□□□□ -1.95
HERC3-201ENST00000264345 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
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