RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD1-201ENST00000259365 S4R3F8 94 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD1-201ENST00000259365 P0C880 135 aa6.9□□□□□ -1.31
TMOD1-201ENST00000259365 H3BS24 57 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD1-201ENST00000259365 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.89□□□□□ -1.31
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.88□□□□□ -1.31
TMOD1-201ENST00000259365 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TMOD1-201ENST00000259365 XP32Q5T750 250 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD1-201ENST00000259365 HSPG2P98160 4391 aa6.87□□□□□ -1.31
TMOD1-201ENST00000259365 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.85□□□□□ -1.31
TMOD1-201ENST00000259365 ROMO1P60602 79 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD1-201ENST00000259365 RYR2Q92736 4967 aa6.77□□□□□ -1.32
TMOD1-201ENST00000259365 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.77□□□□□ -1.33
TMOD1-201ENST00000259365 LRP2P98164 4655 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD1-201ENST00000259365 RYR1P21817 5038 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD1-201ENST00000259365 RYR3Q15413 4870 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD1-201ENST00000259365 LPAP08519 4548 aa6.72□□□□□ -1.33
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.71□□□□□ -1.33
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP12-2P59991 146 aa6.7□□□□□ -1.34
TMOD1-201ENST00000259365 TPRXLQ17RH7 258 aa6.69□□□□□ -1.34
TMOD1-201ENST00000259365 M0QZ58 72 aa6.63□□□□□ -1.35
TMOD1-201ENST00000259365 TNXBP22105 4242 aa6.6□□□□□ -1.35
TMOD1-201ENST00000259365 MT1HL1P0DM35 61 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD1-201ENST00000259365 R4GN34 69 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD1-201ENST00000259365 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.54□□□□□ -1.36
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP12-1P59990 96 aa6.54□□□□□ -1.36
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.54□□□□□ -1.36
TMOD1-201ENST00000259365 J3QL48 77 aa6.52□□□□□ -1.37
TMOD1-201ENST00000259365 NDUFAF8A1L188 74 aa6.51□□□□□ -1.37
TMOD1-201ENST00000259365 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TMOD1-201ENST00000259365 MUC2Q02817 5179 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD1-201ENST00000259365 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
TMOD1-201ENST00000259365 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD1-201ENST00000259365 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.28□□□□□ -1.4
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.23□□□□□ -1.41
TMOD1-201ENST00000259365 HERC2O95714 4834 aa6.21□□□□□ -1.42
TMOD1-201ENST00000259365 PLAC4Q8WY50 150 aa6.15□□□□□ -1.42
TMOD1-201ENST00000259365 M0R2T5 61 aa6.1□□□□□ -1.43
TMOD1-201ENST00000259365 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.09□□□□□ -1.43
TMOD1-201ENST00000259365 HERC1Q15751 4861 aa6.06□□□□□ -1.44
TMOD1-201ENST00000259365 RNF213Q63HN8 5207 aa6.04□□□□□ -1.44
TMOD1-201ENST00000259365 LUZP6Q538Z0 58 aa6.02□□□□□ -1.45
TMOD1-201ENST00000259365 MUC17Q685J3 4493 aa5.98□□□□□ -1.45
TMOD1-201ENST00000259365 TNP1P09430 55 aa5.92□□□□□ -1.46
TMOD1-201ENST00000259365 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.9□□□□□ -1.47
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.83□□□□□ -1.48
TMOD1-201ENST00000259365 PP632Q6XCG6 107 aa5.82□□□□□ -1.48
TMOD1-201ENST00000259365 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.8□□□□□ -1.48
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP10-10P60014 251 aa5.79□□□□□ -1.48
TMOD1-201ENST00000259365 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
TMOD1-201ENST00000259365 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.75□□□□□ -1.49
TMOD1-201ENST00000259365 A0A0A0MQY5 61 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD1-201ENST00000259365 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.68□□□□□ -1.5
TMOD1-201ENST00000259365 LCE3AQ5TA76 89 aa5.6□□□□□ -1.51
TMOD1-201ENST00000259365 LCE2CQ5TA81 110 aa5.58□□□□□ -1.52
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.58□□□□□ -1.52
TMOD1-201ENST00000259365 MT1FP04733 61 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD1-201ENST00000259365 MT1HP80294 61 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD1-201ENST00000259365 MT2AP02795 61 aa5.49□□□□□ -1.53
TMOD1-201ENST00000259365 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.48□□□□□ -1.53
TMOD1-201ENST00000259365 USH2AO75445 5202 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD1-201ENST00000259365 KMT2DO14686 5537 aa5.37□□□□□ -1.55
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.35□□□□□ -1.55
TMOD1-201ENST00000259365 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.34□□□□□ -1.55
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP10-12P60413 245 aa5.31□□□□□ -1.56
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.31□□□□□ -1.56
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP12-3P60328 96 aa5.3□□□□□ -1.56
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
TMOD1-201ENST00000259365 MT1BP07438 61 aa5.26□□□□□ -1.57
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP10-5P60370 271 aa5.26□□□□□ -1.57
TMOD1-201ENST00000259365 MT1XP80297 61 aa5.26□□□□□ -1.57
TMOD1-201ENST00000259365 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.25□□□□□ -1.57
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.15□□□□□ -1.58
TMOD1-201ENST00000259365 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.15□□□□□ -1.59
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.1□□□□□ -1.59
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.09□□□□□ -1.59
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.09□□□□□ -1.59
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD1-201ENST00000259365 LCE2BO14633 110 aa5.01□□□□□ -1.61
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.96□□□□□ -1.62
TMOD1-201ENST00000259365 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
TMOD1-201ENST00000259365 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.9□□□□□ -1.62
TMOD1-201ENST00000259365 INE1O15225 51 aa4.81□□□□□ -1.64
TMOD1-201ENST00000259365 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.81□□□□□ -1.64
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.77□□□□□ -1.65
TMOD1-201ENST00000259365 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
TMOD1-201ENST00000259365 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.74□□□□□ -1.65
TMOD1-201ENST00000259365 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.72□□□□□ -1.65
TMOD1-201ENST00000259365 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
TMOD1-201ENST00000259365 SSPOA2VEC9 5147 aa4.68□□□□□ -1.66
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.66□□□□□ -1.66
TMOD1-201ENST00000259365 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms