RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 ASPMQ8IZT6 3477 aa4.06□□□□□ -1.76
TRPS1-201ENST00000220888 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.05□□□□□ -1.76
TRPS1-201ENST00000220888 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa4.03□□□□□ -1.76
TRPS1-201ENST00000220888 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.01□□□□□ -1.77
TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.97□□□□□ -1.77
TRPS1-201ENST00000220888 DNAH1Q9P2D7 4330 aa3.96□□□□□ -1.78
TRPS1-201ENST00000220888 SPRR2DP22532 72 aa3.96□□□□□ -1.78
TRPS1-201ENST00000220888 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.96□□□□□ -1.78
TRPS1-201ENST00000220888 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.94□□□□□ -1.78
TRPS1-201ENST00000220888 CSMD2Q7Z408 3487 aa3.93□□□□□ -1.78
TRPS1-201ENST00000220888 FAT1Q14517 4588 aa3.92□□□□□ -1.78
TRPS1-201ENST00000220888 DMDP11532 3685 aa3.9□□□□□ -1.79
TRPS1-201ENST00000220888 LCE2BO14633 110 aa3.89□□□□□ -1.79
TRPS1-201ENST00000220888 DNAH10Q8IVF4 4471 aa3.89□□□□□ -1.79
TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP12-4P60329 112 aa3.88□□□□□ -1.79
TRPS1-201ENST00000220888 DNAH2Q9P225 4427 aa3.88□□□□□ -1.79
TRPS1-201ENST00000220888 LAMA5O15230 3695 aa3.87□□□□□ -1.79
TRPS1-201ENST00000220888 CSMD1Q96PZ7 3565 aa3.86□□□□□ -1.79
TRPS1-201ENST00000220888 CUBNO60494 3623 aa3.86□□□□□ -1.79
TRPS1-201ENST00000220888 MUC3AQ02505 3323 aa3.86□□□□□ -1.79
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TRPS1-201ENST00000220888 DNAH9Q9NYC9 4486 aa3.83□□□□□ -1.8
TRPS1-201ENST00000220888 LCE3BQ5TA77 95 aa3.81□□□□□ -1.8
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TRPS1-201ENST00000220888 DNHD1Q96M86 4753 aa3.77□□□□□ -1.81
TRPS1-201ENST00000220888 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.76□□□□□ -1.81
TRPS1-201ENST00000220888 MT1GP13640 62 aa3.73□□□□□ -1.81
TRPS1-201ENST00000220888 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
TRPS1-201ENST00000220888 BSNQ9UPA5 3926 aa3.73□□□□□ -1.81
TRPS1-201ENST00000220888 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
TRPS1-201ENST00000220888 SACSQ9NZJ4 4579 aa3.7□□□□□ -1.82
TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.69□□□□□ -1.82
TRPS1-201ENST00000220888 SVEP1Q4LDE5 3571 aa3.69□□□□□ -1.82
TRPS1-201ENST00000220888 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
TRPS1-201ENST00000220888 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.68□□□□□ -1.82
TRPS1-201ENST00000220888 LCE2CQ5TA81 110 aa3.68□□□□□ -1.82
TRPS1-201ENST00000220888 MT1XP80297 61 aa3.65□□□□□ -1.82
TRPS1-201ENST00000220888 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
TRPS1-201ENST00000220888 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.65□□□□□ -1.83
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TRPS1-201ENST00000220888 RYR3Q15413 4870 aa3.6□□□□□ -1.83
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TRPS1-201ENST00000220888 HERC1Q15751 4861 aa3.6□□□□□ -1.83
TRPS1-201ENST00000220888 CSMD3Q7Z407 3707 aa3.58□□□□□ -1.84
TRPS1-201ENST00000220888 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.58□□□□□ -1.84
TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.58□□□□□ -1.84
TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.58□□□□□ -1.84
TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.58□□□□□ -1.84
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TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.54□□□□□ -1.84
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TRPS1-201ENST00000220888 MT3P25713 68 aa3.41□□□□□ -1.86
TRPS1-201ENST00000220888 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.41□□□□□ -1.86
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TRPS1-201ENST00000220888 STARD9Q9P2P6 4700 aa3.38□□□□□ -1.87
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TRPS1-201ENST00000220888 PKD1P98161 4303 aa3.37□□□□□ -1.87
TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.37□□□□□ -1.87
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TRPS1-201ENST00000220888 MT1EP04732 61 aa3.35□□□□□ -1.87
TRPS1-201ENST00000220888 HSPG2P98160 4391 aa3.35□□□□□ -1.87
TRPS1-201ENST00000220888 LCE1DQ5T752 114 aa3.33□□□□□ -1.88
TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.31□□□□□ -1.88
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TRPS1-201ENST00000220888 MT1MQ8N339 61 aa3.3□□□□□ -1.88
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TRPS1-201ENST00000220888 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
TRPS1-201ENST00000220888 FRAS1Q86XX4 4008 aa3.23□□□□□ -1.89
TRPS1-201ENST00000220888 DNAH7Q8WXX0 4024 aa3.21□□□□□ -1.9
TRPS1-201ENST00000220888 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
TRPS1-201ENST00000220888 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.2□□□□□ -1.9
TRPS1-201ENST00000220888 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.19□□□□□ -1.9
TRPS1-201ENST00000220888 LRP2P98164 4655 aa3.18□□□□□ -1.9
TRPS1-201ENST00000220888 LYSTQ99698 3801 aa3.17□□□□□ -1.9
TRPS1-201ENST00000220888 DNAH6Q9C0G6 4158 aa3.17□□□□□ -1.9
TRPS1-201ENST00000220888 PRM1P04553 51 aa3.15□□□□□ -1.91
TRPS1-201ENST00000220888 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.14□□□□□ -1.91
TRPS1-201ENST00000220888 KMT2AQ03164 3969 aa3.14□□□□□ -1.91
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