RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101395.2

Hoxa4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa4, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Them7Q9DCP4 223 aa21.49■■□□□ 1.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 SelenokQ9JLJ1 94 aa21.49■■□□□ 1.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cd81P35762 236 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 F2rl1P55086 399 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cdx4Q07424 282 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trdv2-2Q5R1A4 116 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Defb10Q8R2I8 73 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rhox7bA6PW38 321 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm15056F6ZR08 88 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm21874J3QNZ6 232 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Muc15Q8C6Z1 331 aa21.48■■□□□ 1.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rbmxl1Q91VM5 388 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trav7-4A0A075B6C1 113 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm7075D3Z497 112 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Smim9Q3V0X1 137 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trav7d-4Q5R1H9 113 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Arl11Q6P3A9 176 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Il22ra1Q80XZ4 581 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 A930004D18RikQ8C8W7 157 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mpv17lQ99MS3 194 aa21.47■■□□□ 1.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vmn1r1E9PVR6 306 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm94Q3V2D2 93 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fa2hQ5MPP0 372 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr1381Q7TQT4 311 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tmed6Q9CQG0 239 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Plekhb2Q9QZC7 221 aa21.46■■□□□ 1.03
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc17a2Q5SZA1 478 aa21.45■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ighv3-8A0A075B5T0 131 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ly6c2P0CW03 131 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Psmb11Q8BG41 302 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rasl10aQ8K5A4 203 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr1012Q8VFJ7 311 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Smim10l1A0A087WNQ7 89 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vmn1r119E9Q4H3 307 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm4133K9J7G6 307 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Twist1P26687 206 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pfn1P62962 140 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Il19Q8CJ70 176 aa21.44■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 ChtopQ9CY57 249 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1810032O08RikE9PZV8 113 aa21.43■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rhox4eQ504P9 205 aa21.43■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 ManbalQ9D8X0 85 aa21.43■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trbv1A0A0B4J1G7 116 aa21.42■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nit2Q9JHW2 276 aa21.42■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr1116E9PXB8 307 aa21.41■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sub1P11031 127 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hspe1Q64433 102 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Crip3Q6Q6R3 243 aa21.41■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Prss3Q792Z0 246 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 RhohQ9D3G9 191 aa21.41■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 4930564D02RikQ9D4S4 103 aa21.41■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tpt1P63028 172 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rpl19P84099 196 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr317Q5NCD6 327 aa21.4■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr702Q920Z2 318 aa21.4■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ifitm2Q99J93 144 aa21.4■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rab5aQ9CQD1 215 aa21.4■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trav16nA0A075B634 117 aa21.4■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zmat4Q8BZ94 229 aa21.4■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Q9D7E4 109 aa21.4■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 GlmpQ9JHJ3 404 aa21.4■■□□□ 1.02
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Spata3Q9D9T6 193 aa21.39■■□□□ 1.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trav7n-4A0A075B620 113 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm933J3QPC1 141 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rps20P60867 119 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atp5iQ06185 71 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fam110dQ80X91 271 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Psmg3Q9CZH3 122 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Obox1Q9D350 204 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trav14n-3A0A075B645 120 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc16a4Q8R0M8 500 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ube2tQ9CQ37 204 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 AsipQ03288 131 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr312Q7TRZ9 308 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ly6g5bQ8K1T4 194 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nat6Q9R123 314 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nsd1O88491 2588 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rtl10D3YWW5 146 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 P06330 118 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PigyP0C1P0 71 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lyrm9Q3UN90 78 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vsig8Q6P3A4 417 aa21.34■■□□□ 1.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gpr82Q8BZR0 328 aa21.34■■□□□ 1.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Igkv4-62A0A0G2JDW9 117 aa21.33■■□□□ 1.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Smug1Q6P5C5 279 aa21.33■■□□□ 1.01
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ren1P06281 402 aa21.32■■□□□ 1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr311Q5NC59 308 aa21.32■■□□□ 1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr509Q8VF20 321 aa21.32■■□□□ 1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 TroQ6DIC6 2087 aa21.32■■□□□ 1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr1419Q7TQS2 343 aa21.31■■□□□ 1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rps10P63325 165 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ighv1-63A0A075B5X2 117 aa21.3■■□□□ 1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trav19A0A0B4J1K4 119 aa21.3■■□□□ 1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 P01741 114 aa21.3■■□□□ 1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Q3UUX7 111 aa21.3■■□□□ 1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Wfdc17Q5SSJ1 76 aa21.3■■□□□ 1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ndufb4Q9CQC7 129 aa21.3■■□□□ 1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cd164l2Q9D6W7 172 aa21.3■■□□□ 1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cml3Q9JIY8 226 aa21.3■■□□□ 1
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trp53rkaQ5U452 244 aa21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.5 ms