RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640501.1

PNKP-231, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 5

Gene PNKP, Length 151 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-231	ENST00000640501	LINC00208	Q96KT6	92 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PNKP-231	ENST00000640501	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PNKP-231	ENST00000640501	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNKP-231	ENST00000640501	LINC00313	P59037	77 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNKP-231	ENST00000640501	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PNKP-231	ENST00000640501	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PNKP-231	ENST00000640501	PKD1	P98161	4303 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNKP-231	ENST00000640501	FAM229A	H3BQW9	127 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNKP-231	ENST00000640501	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNKP-231	ENST00000640501	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PNKP-231	ENST00000640501	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PNKP-231	ENST00000640501	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PNKP-231	ENST00000640501	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PNKP-231	ENST00000640501	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PNKP-231	ENST00000640501	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PNKP-231	ENST00000640501	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PNKP-231	ENST00000640501	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PNKP-231	ENST00000640501	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PNKP-231	ENST00000640501	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PNKP-231	ENST00000640501	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PNKP-231	ENST00000640501	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PNKP-231	ENST00000640501		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PNKP-231	ENST00000640501	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PNKP-231	ENST00000640501	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PNKP-231	ENST00000640501		V9GYY9	64 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PNKP-231	ENST00000640501	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PNKP-231	ENST00000640501	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PNKP-231	ENST00000640501	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PNKP-231	ENST00000640501	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PNKP-231	ENST00000640501	OXT	P01178	125 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PNKP-231	ENST00000640501	PCOTH	Q58A44	107 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PNKP-231	ENST00000640501	PRR4	Q16378	134 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PNKP-231	ENST00000640501		Q5VSD8	79 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PNKP-231	ENST00000640501	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PNKP-231	ENST00000640501	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PNKP-231	ENST00000640501		Q5W150	140 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PNKP-231	ENST00000640501	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PNKP-231	ENST00000640501	ACYP2	P14621	99 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PNKP-231	ENST00000640501	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PNKP-231	ENST00000640501	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PNKP-231	ENST00000640501	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PNKP-231	ENST00000640501		Q1T7F1	81 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PNKP-231	ENST00000640501	COA5	Q86WW8	74 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PNKP-231	ENST00000640501	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PNKP-231	ENST00000640501	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PNKP-231	ENST00000640501	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PNKP-231	ENST00000640501	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PNKP-231	ENST00000640501	RYR2	Q92736	4967 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PNKP-231	ENST00000640501	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PNKP-231	ENST00000640501	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PNKP-231	ENST00000640501	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PNKP-231	ENST00000640501	C4orf26	Q17RF5	130 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PNKP-231	ENST00000640501		Q8N1X5	172 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PNKP-231	ENST00000640501	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PNKP-231	ENST00000640501		A8MUU9	505 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PNKP-231	ENST00000640501	HRES1	P13985	223 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PNKP-231	ENST00000640501	DMAC1	Q96GE9	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PNKP-231	ENST00000640501	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PNKP-231	ENST00000640501		A8MUN3	132 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PNKP-231	ENST00000640501	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PNKP-231	ENST00000640501		Q75L30	129 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PNKP-231	ENST00000640501	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PNKP-231	ENST00000640501	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PNKP-231	ENST00000640501	PRR15L	Q9BU68	103 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PNKP-231	ENST00000640501	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PNKP-231	ENST00000640501	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PNKP-231	ENST00000640501	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PNKP-231	ENST00000640501	PSPHP1	O15172	72 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PNKP-231	ENST00000640501	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PNKP-231	ENST00000640501	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PNKP-231	ENST00000640501	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PNKP-231	ENST00000640501	FAT1	Q14517	4588 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PNKP-231	ENST00000640501	SPINK7	P58062	85 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PNKP-231	ENST00000640501	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
PNKP-231	ENST00000640501	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.47	□□□□□ -1.69
PNKP-231	ENST00000640501		A0A1B0GU69	56 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PNKP-231	ENST00000640501	SEC61G	P60059	68 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PNKP-231	ENST00000640501		Q5VV11	94 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PNKP-231	ENST00000640501		A6NED7	52 aa		4.44	□□□□□ -1.7
PNKP-231	ENST00000640501	MT1HL1	P0DM35	61 aa		4.44	□□□□□ -1.7
PNKP-231	ENST00000640501	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.44	□□□□□ -1.7
PNKP-231	ENST00000640501	XP32	Q5T750	250 aa		4.44	□□□□□ -1.7
PNKP-231	ENST00000640501	HSPG2	P98160	4391 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PNKP-231	ENST00000640501	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PNKP-231	ENST00000640501	RYR3	Q15413	4870 aa		4.41	□□□□□ -1.7
PNKP-231	ENST00000640501		J3QL48	77 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PNKP-231	ENST00000640501	RYR1	P21817	5038 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PNKP-231	ENST00000640501	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PNKP-231	ENST00000640501	UQCR11	O14957	56 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PNKP-231	ENST00000640501	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PNKP-231	ENST00000640501	TNXB	P22105	4242 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PNKP-231	ENST00000640501	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PNKP-231	ENST00000640501	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PNKP-231	ENST00000640501	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PNKP-231	ENST00000640501	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
PNKP-231	ENST00000640501	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.32	□□□□□ -1.72
PNKP-231	ENST00000640501	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.3	□□□□□ -1.72
PNKP-231	ENST00000640501	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		4.3	□□□□□ -1.72
PNKP-231	ENST00000640501	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.29	□□□□□ -1.72
PNKP-231	ENST00000640501		S4R3F8	94 aa		4.29	□□□□□ -1.72

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