RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593072.5

EFTUD2-225, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 5

Gene EFTUD2, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-225ENST00000593072 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-225ENST00000593072 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-225ENST00000593072 DNAL4O96015 105 aa3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-225ENST00000593072 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-225ENST00000593072 PCOTHQ58A44 107 aa3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-225ENST00000593072 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-225ENST00000593072 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-225ENST00000593072 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa3.49□□□□□ -1.85
EFTUD2-225ENST00000593072 Q8N377 158 aa3.49□□□□□ -1.85
EFTUD2-225ENST00000593072 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa3.49□□□□□ -1.85
EFTUD2-225ENST00000593072 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
EFTUD2-225ENST00000593072 SPRR1BP22528 89 aa3.48□□□□□ -1.85
EFTUD2-225ENST00000593072 MOBPQ13875 183 aa3.48□□□□□ -1.85
EFTUD2-225ENST00000593072 LINC00483Q53H64 154 aa3.48□□□□□ -1.85
EFTUD2-225ENST00000593072 ORMDL1Q9P0S3 153 aa3.48□□□□□ -1.85
EFTUD2-225ENST00000593072 C9orf92A6NGG3 77 aa3.47□□□□□ -1.85
EFTUD2-225ENST00000593072 SMIM29Q86T20 159 aa3.47□□□□□ -1.85
EFTUD2-225ENST00000593072 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa3.46□□□□□ -1.86
EFTUD2-225ENST00000593072 H3BQ85 93 aa3.46□□□□□ -1.86
EFTUD2-225ENST00000593072 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-225ENST00000593072 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-225ENST00000593072 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-225ENST00000593072 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.45□□□□□ -1.86
EFTUD2-225ENST00000593072 CCKP06307 115 aa3.44□□□□□ -1.86
EFTUD2-225ENST00000593072 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
EFTUD2-225ENST00000593072 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa3.44□□□□□ -1.86
EFTUD2-225ENST00000593072 NDUFC1O43677 76 aa3.43□□□□□ -1.86
EFTUD2-225ENST00000593072 HRCT1Q6UXD1 115 aa3.43□□□□□ -1.86
EFTUD2-225ENST00000593072 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.43□□□□□ -1.86
EFTUD2-225ENST00000593072 A0A0G2JQZ4 141 aa3.42□□□□□ -1.86
EFTUD2-225ENST00000593072 F8WEM9 126 aa3.42□□□□□ -1.86
EFTUD2-225ENST00000593072 PDE6GP18545 87 aa3.42□□□□□ -1.86
EFTUD2-225ENST00000593072 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
EFTUD2-225ENST00000593072 PRO0628Q9UI54 55 aa3.42□□□□□ -1.86
EFTUD2-225ENST00000593072 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.41□□□□□ -1.86
EFTUD2-225ENST00000593072 Q5XG85 94 aa3.41□□□□□ -1.86
EFTUD2-225ENST00000593072 UBL5Q9BZL1 73 aa3.41□□□□□ -1.86
EFTUD2-225ENST00000593072 LINC00846Q9NV44 126 aa3.41□□□□□ -1.86
EFTUD2-225ENST00000593072 USH2AO75445 5202 aa3.4□□□□□ -1.86
EFTUD2-225ENST00000593072 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.4□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa3.4□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa3.4□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 FAM236CP0DP71 79 aa3.4□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 RBM3P98179 157 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 KLKP1Q107X0 134 aa3.4□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 IGFL1Q6UW32 110 aa3.4□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.4□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 C14orf132Q9NPU4 83 aa3.4□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 SSPOA2VEC9 5147 aa3.39□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa3.38□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa3.38□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 A0A1W2PNM2 257 aa3.38□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 CXCL6P80162 114 aa3.38□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 Q6ZQT0 140 aa3.38□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 DSCR8Q96T75 97 aa3.38□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 C4orf26Q17RF5 130 aa3.37□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 H7BZZ5 65 aa3.36□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 LIMD2Q9BT23 127 aa3.36□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 A0A087WVE0 104 aa3.35□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 CD164Q04900 197 aa3.35□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 C20orf197Q8N268 126 aa3.35□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.35□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 A0A087WSZ3 146 aa3.34□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
EFTUD2-225ENST00000593072 A0A1B0GW54 56 aa3.33□□□□□ -1.88
EFTUD2-225ENST00000593072 LCE3BQ5TA77 95 aa3.33□□□□□ -1.88
EFTUD2-225ENST00000593072 C1orf195Q5TG92 126 aa3.31□□□□□ -1.88
EFTUD2-225ENST00000593072 Q6ZVQ6 151 aa3.31□□□□□ -1.88
EFTUD2-225ENST00000593072 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
EFTUD2-225ENST00000593072 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.3□□□□□ -1.88
EFTUD2-225ENST00000593072 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.29□□□□□ -1.88
EFTUD2-225ENST00000593072 Q96NJ1 140 aa3.29□□□□□ -1.88
EFTUD2-225ENST00000593072 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.29□□□□□ -1.88
EFTUD2-225ENST00000593072 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.29□□□□□ -1.88
EFTUD2-225ENST00000593072 V9GYY9 64 aa3.29□□□□□ -1.88
EFTUD2-225ENST00000593072 NREPQ16612 68 aa3.28□□□□□ -1.88
EFTUD2-225ENST00000593072 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.28□□□□□ -1.88
EFTUD2-225ENST00000593072 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.28□□□□□ -1.88
EFTUD2-225ENST00000593072 BPY2O14599 106 aa3.27□□□□□ -1.89
EFTUD2-225ENST00000593072 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.27□□□□□ -1.89
EFTUD2-225ENST00000593072 IGKV4-1P06312 121 aa3.26□□□□□ -1.89
EFTUD2-225ENST00000593072 PRR15Q8IV56 129 aa3.26□□□□□ -1.89
EFTUD2-225ENST00000593072 MT2AP02795 61 aa3.25□□□□□ -1.89
EFTUD2-225ENST00000593072 DSCR10P59022 87 aa3.25□□□□□ -1.89
EFTUD2-225ENST00000593072 Q1T7F1 81 aa3.25□□□□□ -1.89
EFTUD2-225ENST00000593072 OCR1Q9BZK8 76 aa3.25□□□□□ -1.89
EFTUD2-225ENST00000593072 SNURFQ9Y675 71 aa3.25□□□□□ -1.89
EFTUD2-225ENST00000593072 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.24□□□□□ -1.89
EFTUD2-225ENST00000593072 KRTAP10-10P60014 251 aa3.24□□□□□ -1.89
EFTUD2-225ENST00000593072 SEC61GP60059 68 aa3.24□□□□□ -1.89
EFTUD2-225ENST00000593072 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.24□□□□□ -1.89
EFTUD2-225ENST00000593072 BRK1Q8WUW1 75 aa3.24□□□□□ -1.89
EFTUD2-225ENST00000593072 A8MWP4 228 aa3.23□□□□□ -1.89
EFTUD2-225ENST00000593072 NDUFB1O75438 58 aa3.23□□□□□ -1.89
EFTUD2-225ENST00000593072 Q8N9L7 120 aa3.23□□□□□ -1.89
EFTUD2-225ENST00000593072 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.23□□□□□ -1.89
EFTUD2-225ENST00000593072 A0A1B0GVX0 72 aa3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms