RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 Q5XG85 94 aa5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-222ENST00000592408 H0Y9P7 68 aa5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-222ENST00000592408 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-222ENST00000592408 VPS13DQ5THJ4 4388 aa5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-222ENST00000592408 LY6G6CO95867 125 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-222ENST00000592408 COL7A1Q02388 2944 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-222ENST00000592408 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-222ENST00000592408 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLV7-43P04211 117 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-222ENST00000592408 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-222ENST00000592408 CD164Q04900 197 aa5.53□□□□□ -1.52
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1B0GVX0 72 aa5.52□□□□□ -1.53
EFTUD2-222ENST00000592408 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.52□□□□□ -1.53
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00208Q96KT6 92 aa5.52□□□□□ -1.53
EFTUD2-222ENST00000592408 C4orf26Q17RF5 130 aa5.51□□□□□ -1.53
EFTUD2-222ENST00000592408 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.51□□□□□ -1.53
EFTUD2-222ENST00000592408 Q96NJ1 140 aa5.51□□□□□ -1.53
EFTUD2-222ENST00000592408 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.51□□□□□ -1.53
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAH7Q8WXX0 4024 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-222ENST00000592408 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-222ENST00000592408 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-222ENST00000592408 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-222ENST00000592408 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-222ENST00000592408 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAH17Q9UFH2 4485 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-222ENST00000592408 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-222ENST00000592408 V9GYY9 64 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAH6Q9C0G6 4158 aa5.46□□□□□ -1.53
EFTUD2-222ENST00000592408 LYSTQ99698 3801 aa5.46□□□□□ -1.53
EFTUD2-222ENST00000592408 C8orf87E5RJ46 101 aa5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-222ENST00000592408 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
EFTUD2-222ENST00000592408 NDUFS5O43920 106 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-222ENST00000592408 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-222ENST00000592408 CSMD3Q7Z407 3707 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-222ENST00000592408 Q6ZSA8 131 aa5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-222ENST00000592408 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-222ENST00000592408 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-222ENST00000592408 PRR4Q16378 134 aa5.42□□□□□ -1.54
EFTUD2-222ENST00000592408 Q1T7F1 81 aa5.42□□□□□ -1.54
EFTUD2-222ENST00000592408 LIMD2Q9BT23 127 aa5.42□□□□□ -1.54
EFTUD2-222ENST00000592408 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.41□□□□□ -1.54
EFTUD2-222ENST00000592408 PRO0628Q9UI54 55 aa5.41□□□□□ -1.54
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.4□□□□□ -1.54
EFTUD2-222ENST00000592408 C1orf195Q5TG92 126 aa5.4□□□□□ -1.54
EFTUD2-222ENST00000592408 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.4□□□□□ -1.54
EFTUD2-222ENST00000592408 TENM2Q9NT68 2774 aa5.39□□□□□ -1.55
EFTUD2-222ENST00000592408 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.39□□□□□ -1.55
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAH2Q9P225 4427 aa5.38□□□□□ -1.55
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP10-1P60331 282 aa5.37□□□□□ -1.55
EFTUD2-222ENST00000592408 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa5.37□□□□□ -1.55
EFTUD2-222ENST00000592408 PCOTHQ58A44 107 aa5.36□□□□□ -1.55
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.36□□□□□ -1.55
EFTUD2-222ENST00000592408 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-222ENST00000592408 BRK1Q8WUW1 75 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00313P59037 77 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-222ENST00000592408 COA5Q86WW8 74 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.33□□□□□ -1.56
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A087X002 238 aa5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-222ENST00000592408 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-222ENST00000592408 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
EFTUD2-222ENST00000592408 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
EFTUD2-222ENST00000592408 SPINK1P00995 79 aa5.3□□□□□ -1.56
EFTUD2-222ENST00000592408 SACSQ9NZJ4 4579 aa5.3□□□□□ -1.56
EFTUD2-222ENST00000592408 PSPHP1O15172 72 aa5.29□□□□□ -1.56
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.29□□□□□ -1.56
EFTUD2-222ENST00000592408 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.29□□□□□ -1.56
EFTUD2-222ENST00000592408 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
EFTUD2-222ENST00000592408 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.29□□□□□ -1.56
EFTUD2-222ENST00000592408 KMT2AQ03164 3969 aa5.27□□□□□ -1.57
EFTUD2-222ENST00000592408 SEC61GP60059 68 aa5.27□□□□□ -1.57
EFTUD2-222ENST00000592408 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.27□□□□□ -1.57
EFTUD2-222ENST00000592408 PRR15LQ9BU68 103 aa5.27□□□□□ -1.57
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.27□□□□□ -1.57
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAH11Q96DT5 4516 aa5.26□□□□□ -1.57
EFTUD2-222ENST00000592408 A8MUN3 132 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-222ENST00000592408 ACYP2P14621 99 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-222ENST00000592408 Q5W150 140 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-222ENST00000592408 RYR3Q15413 4870 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-222ENST00000592408 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.25□□□□□ -1.57
EFTUD2-222ENST00000592408 IGKV2-30P06310 120 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-222ENST00000592408 HRES1P13985 223 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.24□□□□□ -1.57
EFTUD2-222ENST00000592408 RYR2Q92736 4967 aa5.23□□□□□ -1.57
EFTUD2-222ENST00000592408 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.23□□□□□ -1.57
EFTUD2-222ENST00000592408 Q5VV11 94 aa5.23□□□□□ -1.57
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.23□□□□□ -1.57
EFTUD2-222ENST00000592408 HYDINQ4G0P3 5121 aa5.22□□□□□ -1.57
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.22□□□□□ -1.57
EFTUD2-222ENST00000592408 DMAC1Q96GE9 116 aa5.22□□□□□ -1.57
EFTUD2-222ENST00000592408 A6NED7 52 aa5.18□□□□□ -1.58
EFTUD2-222ENST00000592408 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.18□□□□□ -1.58
EFTUD2-222ENST00000592408 PKD1P98161 4303 aa5.17□□□□□ -1.58
EFTUD2-222ENST00000592408 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.17□□□□□ -1.58
EFTUD2-222ENST00000592408 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 142.8 ms