RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591709.1

POLR2E-208, Transcript of RNA polymerase II subunit E, humanhuman

TSL 2

Gene POLR2E, Length 685 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2E-208ENST00000591709 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR2E-208ENST00000591709 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR2E-208ENST00000591709 C9JAW5 83 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR2E-208ENST00000591709 LCE2BO14633 110 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR2E-208ENST00000591709 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.69□□□□□ -1.02
POLR2E-208ENST00000591709 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR2E-208ENST00000591709 LINC00313P59037 77 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR2E-208ENST00000591709 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR2E-208ENST00000591709 A8MUU9 505 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR2E-208ENST00000591709 MT2AP02795 61 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR2E-208ENST00000591709 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR2E-208ENST00000591709 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.64□□□□□ -1.03
POLR2E-208ENST00000591709 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR2E-208ENST00000591709 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.63□□□□□ -1.03
POLR2E-208ENST00000591709 C9orf118A6NHY6 69 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR2E-208ENST00000591709 Q6ZQT0 140 aa8.62□□□□□ -1.03
POLR2E-208ENST00000591709 MT1FP04733 61 aa8.61□□□□□ -1.03
POLR2E-208ENST00000591709 TAX1BP3O14907 124 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR2E-208ENST00000591709 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR2E-208ENST00000591709 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.6□□□□□ -1.03
POLR2E-208ENST00000591709 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR2E-208ENST00000591709 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.59□□□□□ -1.03
POLR2E-208ENST00000591709 A0A1W2PPM0 123 aa8.58□□□□□ -1.04
POLR2E-208ENST00000591709 A0A1B0GVX0 72 aa8.57□□□□□ -1.04
POLR2E-208ENST00000591709 PDE6GP18545 87 aa8.57□□□□□ -1.04
POLR2E-208ENST00000591709 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa8.57□□□□□ -1.04
POLR2E-208ENST00000591709 J3KT08 172 aa8.56□□□□□ -1.04
POLR2E-208ENST00000591709 MTURNQ8N3F0 131 aa8.55□□□□□ -1.04
POLR2E-208ENST00000591709 C8orf87E5RJ46 101 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR2E-208ENST00000591709 A0A1B0GW54 56 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR2E-208ENST00000591709 H3BT86 120 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR2E-208ENST00000591709 KRTAP10-10P60014 251 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR2E-208ENST00000591709 NDUFB1O75438 58 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR2E-208ENST00000591709 LINC00846Q9NV44 126 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR2E-208ENST00000591709 NREPQ16612 68 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR2E-208ENST00000591709 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR2E-208ENST00000591709 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.47□□□□□ -1.05
POLR2E-208ENST00000591709 A8MWP4 228 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR2E-208ENST00000591709 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR2E-208ENST00000591709 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR2E-208ENST00000591709 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR2E-208ENST00000591709 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR2E-208ENST00000591709 FAM236CP0DP71 79 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR2E-208ENST00000591709 C8orf17Q9NRJ1 99 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR2E-208ENST00000591709 PRR15Q8IV56 129 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR2E-208ENST00000591709 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
POLR2E-208ENST00000591709 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
POLR2E-208ENST00000591709 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
POLR2E-208ENST00000591709 Q6ZVQ6 151 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR2E-208ENST00000591709 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR2E-208ENST00000591709 HRES1P13985 223 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR2E-208ENST00000591709 K7EP34 96 aa8.34□□□□□ -1.07
POLR2E-208ENST00000591709 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.34□□□□□ -1.07
POLR2E-208ENST00000591709 K7EQZ3 153 aa8.33□□□□□ -1.08
POLR2E-208ENST00000591709 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR2E-208ENST00000591709 BPY2O14599 106 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR2E-208ENST00000591709 PRO0461Q9UI25 63 aa8.32□□□□□ -1.08
POLR2E-208ENST00000591709 SPINK7P58062 85 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR2E-208ENST00000591709 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR2E-208ENST00000591709 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.3□□□□□ -1.08
POLR2E-208ENST00000591709 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
POLR2E-208ENST00000591709 hDV103S1A0JD37 113 aa8.28□□□□□ -1.08
POLR2E-208ENST00000591709 NDUFS5O43920 106 aa8.26□□□□□ -1.09
POLR2E-208ENST00000591709 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR2E-208ENST00000591709 Q8N9L7 120 aa8.25□□□□□ -1.09
POLR2E-208ENST00000591709 NEBP20929 6669 aa8.24□□□□□ -1.09
POLR2E-208ENST00000591709 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR2E-208ENST00000591709 UBL5Q9BZL1 73 aa8.21□□□□□ -1.1
POLR2E-208ENST00000591709 F8W1H4 67 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR2E-208ENST00000591709 CASC2Q6XLA1 102 aa8.18□□□□□ -1.1
POLR2E-208ENST00000591709 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR2E-208ENST00000591709 ETDBQ3ZM63 59 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR2E-208ENST00000591709 HCG22E2RYF7 251 aa8.13□□□□□ -1.11
POLR2E-208ENST00000591709 Q5W150 140 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR2E-208ENST00000591709 MUC12Q9UKN1 5478 aa8.12□□□□□ -1.11
POLR2E-208ENST00000591709 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR2E-208ENST00000591709 IGKV2-30P06310 120 aa8.11□□□□□ -1.11
POLR2E-208ENST00000591709 CXCL6P80162 114 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR2E-208ENST00000591709 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.05□□□□□ -1.12
POLR2E-208ENST00000591709 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.99□□□□□ -1.13
POLR2E-208ENST00000591709 C4orf26Q17RF5 130 aa7.95□□□□□ -1.14
POLR2E-208ENST00000591709 ACYP1P07311 99 aa7.94□□□□□ -1.14
POLR2E-208ENST00000591709 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.92□□□□□ -1.14
POLR2E-208ENST00000591709 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.89□□□□□ -1.15
POLR2E-208ENST00000591709 A6NN06 94 aa7.88□□□□□ -1.15
POLR2E-208ENST00000591709 A0A1B0GV90 55 aa7.87□□□□□ -1.15
POLR2E-208ENST00000591709 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
POLR2E-208ENST00000591709 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.85□□□□□ -1.15
POLR2E-208ENST00000591709 KRTAP5-9P26371 169 aa7.82□□□□□ -1.16
POLR2E-208ENST00000591709 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.81□□□□□ -1.16
POLR2E-208ENST00000591709 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.8□□□□□ -1.16
POLR2E-208ENST00000591709 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.77□□□□□ -1.17
POLR2E-208ENST00000591709 C5orf47Q569G3 176 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR2E-208ENST00000591709 LINC00643Q86TS7 51 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR2E-208ENST00000591709 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR2E-208ENST00000591709 KMT2DO14686 5537 aa7.76□□□□□ -1.17
POLR2E-208ENST00000591709 MDN1Q9NU22 5596 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR2E-208ENST00000591709 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR2E-208ENST00000591709 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.75□□□□□ -1.17
POLR2E-208ENST00000591709 S4R3F8 94 aa7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms