RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 ETDBQ3ZM63 59 aa4.66□□□□□ -1.66
TMOD3-211ENST00000561438 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa4.65□□□□□ -1.67
TMOD3-211ENST00000561438 SNCGO76070 127 aa4.65□□□□□ -1.67
TMOD3-211ENST00000561438 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
TMOD3-211ENST00000561438 Q6JHZ5 121 aa4.65□□□□□ -1.67
TMOD3-211ENST00000561438 Q6Q795 121 aa4.65□□□□□ -1.67
TMOD3-211ENST00000561438 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa4.65□□□□□ -1.67
TMOD3-211ENST00000561438 CD164Q04900 197 aa4.64□□□□□ -1.67
TMOD3-211ENST00000561438 TEN1Q86WV5 123 aa4.64□□□□□ -1.67
TMOD3-211ENST00000561438 A0A087WSZ3 146 aa4.63□□□□□ -1.67
TMOD3-211ENST00000561438 F8W1H4 67 aa4.63□□□□□ -1.67
TMOD3-211ENST00000561438 CCKP06307 115 aa4.63□□□□□ -1.67
TMOD3-211ENST00000561438 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.63□□□□□ -1.67
TMOD3-211ENST00000561438 C1orf195Q5TG92 126 aa4.63□□□□□ -1.67
TMOD3-211ENST00000561438 H3BQ85 93 aa4.62□□□□□ -1.67
TMOD3-211ENST00000561438 SPINK1P00995 79 aa4.62□□□□□ -1.67
TMOD3-211ENST00000561438 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
TMOD3-211ENST00000561438 VPS25Q9BRG1 176 aa4.62□□□□□ -1.67
TMOD3-211ENST00000561438 MUC17Q685J3 4493 aa4.62□□□□□ -1.67
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TMOD3-211ENST00000561438 Q5XG85 94 aa4.61□□□□□ -1.67
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TMOD3-211ENST00000561438 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.59□□□□□ -1.67
TMOD3-211ENST00000561438 LINC00472Q9H8W2 130 aa4.59□□□□□ -1.67
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TMOD3-211ENST00000561438 LINC00846Q9NV44 126 aa4.57□□□□□ -1.68
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TMOD3-211ENST00000561438 LIMD2Q9BT23 127 aa4.55□□□□□ -1.68
TMOD3-211ENST00000561438 MUC2Q02817 5179 aa4.53□□□□□ -1.68
TMOD3-211ENST00000561438 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.53□□□□□ -1.68
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TMOD3-211ENST00000561438 DSCR10P59022 87 aa4.53□□□□□ -1.68
TMOD3-211ENST00000561438 Q6ZVQ6 151 aa4.53□□□□□ -1.68
TMOD3-211ENST00000561438 C9orf92A6NGG3 77 aa4.52□□□□□ -1.69
TMOD3-211ENST00000561438 RNF213Q63HN8 5207 aa4.52□□□□□ -1.69
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TMOD3-211ENST00000561438 SIGMAR1Q99720 223 aa4.49□□□□□ -1.69
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TMOD3-211ENST00000561438 K7EQZ3 153 aa4.48□□□□□ -1.69
TMOD3-211ENST00000561438 BPY2O14599 106 aa4.48□□□□□ -1.69
TMOD3-211ENST00000561438 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.47□□□□□ -1.69
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TMOD3-211ENST00000561438 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.38□□□□□ -1.71
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TMOD3-211ENST00000561438 PCOTHQ58A44 107 aa4.37□□□□□ -1.71
TMOD3-211ENST00000561438 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.37□□□□□ -1.71
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TMOD3-211ENST00000561438 HCG22E2RYF7 251 aa4.33□□□□□ -1.72
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TMOD3-211ENST00000561438 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.33□□□□□ -1.72
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TMOD3-211ENST00000561438 J3QR89 54 aa4.32□□□□□ -1.72
TMOD3-211ENST00000561438 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.32□□□□□ -1.72
TMOD3-211ENST00000561438 CASC2Q6XLA1 102 aa4.32□□□□□ -1.72
TMOD3-211ENST00000561438 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
TMOD3-211ENST00000561438 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
TMOD3-211ENST00000561438 HRES1P13985 223 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-211ENST00000561438 OCR1Q9BZK8 76 aa4.25□□□□□ -1.73
TMOD3-211ENST00000561438 NDUFS5O43920 106 aa4.24□□□□□ -1.73
TMOD3-211ENST00000561438 NDUFAF8A1L188 74 aa4.23□□□□□ -1.73
TMOD3-211ENST00000561438 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.23□□□□□ -1.73
TMOD3-211ENST00000561438 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.22□□□□□ -1.73
TMOD3-211ENST00000561438 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4.21□□□□□ -1.74
TMOD3-211ENST00000561438 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.21□□□□□ -1.74
TMOD3-211ENST00000561438 IMUPQ9GZP8 106 aa4.21□□□□□ -1.74
TMOD3-211ENST00000561438 SPINK7P58062 85 aa4.2□□□□□ -1.74
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