RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 PRO0628Q9UI54 55 aa1.7□□□□□ -2.14
TMOD3-210ENST00000561408 K7EMI3 77 aa1.69□□□□□ -2.14
TMOD3-210ENST00000561408 LCA10Q71F78 164 aa1.69□□□□□ -2.14
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa1.69□□□□□ -2.14
TMOD3-210ENST00000561408 SIGMAR1Q99720 223 aa1.69□□□□□ -2.14
TMOD3-210ENST00000561408 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa1.69□□□□□ -2.14
TMOD3-210ENST00000561408 F8WEM9 126 aa1.68□□□□□ -2.14
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM250H0YL14 139 aa1.68□□□□□ -2.14
TMOD3-210ENST00000561408 NDUFC2O95298 119 aa1.68□□□□□ -2.14
TMOD3-210ENST00000561408 S100A8P05109 93 aa1.68□□□□□ -2.14
TMOD3-210ENST00000561408 G0S2P27469 103 aa1.68□□□□□ -2.14
TMOD3-210ENST00000561408 MIEN1Q9BRT3 115 aa1.68□□□□□ -2.14
TMOD3-210ENST00000561408 ADIRFQ15847 76 aa1.67□□□□□ -2.14
TMOD3-210ENST00000561408 HSBP1L1C9JCN9 74 aa1.66□□□□□ -2.14
TMOD3-210ENST00000561408 H3BUT2 72 aa1.66□□□□□ -2.14
TMOD3-210ENST00000561408 TSPEAR-AS2P59090 65 aa1.66□□□□□ -2.14
TMOD3-210ENST00000561408 RHEBQ15382 184 aa1.66□□□□□ -2.14
TMOD3-210ENST00000561408 Q6JHZ5 121 aa1.66□□□□□ -2.14
TMOD3-210ENST00000561408 SPINT4Q6UDR6 99 aa1.66□□□□□ -2.14
TMOD3-210ENST00000561408 COMMD7Q86VX2 200 aa1.66□□□□□ -2.14
TMOD3-210ENST00000561408 A0A087WSZ3 146 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 LINC00587B1AMM8 73 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 C9JQL5 133 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 HBDP02042 147 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 OCIAD2Q56VL3 154 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 BAGE3Q86Y29 109 aa1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 IGKV4-1P06312 121 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 PRR15Q8IV56 129 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 SS18L2Q9UHA2 77 aa1.64□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa1.63□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 H0YAA0 97 aa1.63□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 SRP19P09132 144 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 PMCHL1Q16048 86 aa1.63□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa1.63□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 YPEL4Q96NS1 127 aa1.63□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 LINC01546A6NGU7 62 aa1.62□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 MT1EP04732 61 aa1.62□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa1.62□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 PLAC4Q8WY50 150 aa1.62□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 CSAG1Q6PB30 78 aa1.61□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 ANAPC13Q9BS18 74 aa1.61□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa1.6□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 LINC01549A6NIU2 74 aa1.6□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF815PA8K554 130 aa1.6□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 LYRM7Q5U5X0 104 aa1.6□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 Q6ZQY7 126 aa1.6□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 C1orf64Q8NEQ6 169 aa1.6□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 SPANXDQ9BXN6 97 aa1.6□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 SCGB1C2P0DMR2 95 aa1.59□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 TEN1Q86WV5 123 aa1.59□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 LINC00308Q8TCZ7 52 aa1.59□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 S100ZQ8WXG8 99 aa1.59□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 SMCO4Q9NRQ5 59 aa1.59□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 SPANXCQ9NY87 97 aa1.59□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 CRIPTQ9P021 101 aa1.59□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 NAT8Q9UHE5 227 aa1.59□□□□□ -2.15
TMOD3-210ENST00000561408 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa1.58□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 C4orf26Q17RF5 130 aa1.58□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 MT1MQ8N339 61 aa1.58□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 S4R3F8 94 aa1.58□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 C8orf87E5RJ46 101 aa1.57□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 J3QQQ9 107 aa1.57□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 LEPROTO15243 131 aa1.57□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 C3orf79P0CE67 100 aa1.57□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 MT1GP13640 62 aa1.57□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 PDE6GP18545 87 aa1.57□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 R4GN34 69 aa1.57□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 A8MUN3 132 aa1.56□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 K7ERS5 55 aa1.56□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 IFITM2Q01629 132 aa1.56□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.56□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 ADM2Q7Z4H4 148 aa1.56□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 SNHG12Q9BXW3 62 aa1.56□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 H3BQ85 93 aa1.55□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 S100A2P29034 98 aa1.55□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 MP68P56378 58 aa1.55□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 hADV29S1A0JD25 119 aa1.54□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa1.54□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 LINC00575Q6W349 94 aa1.54□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 SMIM11BQ8TCY0 68 aa1.54□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 DSCR8Q96T75 97 aa1.54□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 LINC00472Q9H8W2 130 aa1.54□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa1.54□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa1.53□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP12-4P60329 112 aa1.53□□□□□ -2.16
TMOD3-210ENST00000561408 A0A0B4J2C4 111 aa1.52□□□□□ -2.17
TMOD3-210ENST00000561408 A6NED7 52 aa1.52□□□□□ -2.17
TMOD3-210ENST00000561408 LINC00614P0C842 121 aa1.52□□□□□ -2.17
TMOD3-210ENST00000561408 RAB37Q96AX2 223 aa1.52□□□□□ -2.17
TMOD3-210ENST00000561408 SLC51BQ86UW2 128 aa1.51□□□□□ -2.17
TMOD3-210ENST00000561408 IFI27L1Q96BM0 104 aa1.51□□□□□ -2.17
TMOD3-210ENST00000561408 PMCHL2Q9BQD1 86 aa1.51□□□□□ -2.17
TMOD3-210ENST00000561408 A0A1B0GU33 70 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-210ENST00000561408 FABP9Q0Z7S8 132 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-210ENST00000561408 C18orf32Q8TCD1 76 aa1.49□□□□□ -2.17
TMOD3-210ENST00000561408 HSPB8Q9UJY1 196 aa1.49□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms