RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 VAMP8Q9BV40 100 aa4.09□□□□□ -1.75
USP3-AS1-204ENST00000559861 COX7BP24311 80 aa4.08□□□□□ -1.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPATA45Q537H7 98 aa4.08□□□□□ -1.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPANXDQ9BXN6 97 aa4.08□□□□□ -1.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCP4L1A6NKN8 68 aa4.07□□□□□ -1.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 A8MUU9 505 aa4.07□□□□□ -1.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLNP26678 52 aa4.07□□□□□ -1.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 TAL2Q16559 108 aa4.07□□□□□ -1.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.07□□□□□ -1.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 C14orf144Q96I85 54 aa4.07□□□□□ -1.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.07□□□□□ -1.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 MDN1Q9NU22 5596 aa4.06□□□□□ -1.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.06□□□□□ -1.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 HSBP1L1C9JCN9 74 aa4.06□□□□□ -1.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.06□□□□□ -1.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa4.05□□□□□ -1.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.05□□□□□ -1.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 C5orf47Q569G3 176 aa4.04□□□□□ -1.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGFL1Q6UW32 110 aa4.04□□□□□ -1.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 HRES1P13985 223 aa4.03□□□□□ -1.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.03□□□□□ -1.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR13C6PQ8NH95 151 aa4.03□□□□□ -1.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 CLEC2BQ92478 149 aa4.03□□□□□ -1.76
USP3-AS1-204ENST00000559861 TSTD3H0UI37 97 aa4.02□□□□□ -1.77
USP3-AS1-204ENST00000559861 TIMM17BO60830 172 aa4.02□□□□□ -1.77
USP3-AS1-204ENST00000559861 COX8AP10176 69 aa4.02□□□□□ -1.77
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q96NJ1 140 aa4.02□□□□□ -1.77
USP3-AS1-204ENST00000559861 KMT2DO14686 5537 aa4.02□□□□□ -1.77
USP3-AS1-204ENST00000559861 UQCR10Q9UDW1 63 aa4.01□□□□□ -1.77
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF815PA8K554 130 aa4□□□□□ -1.77
USP3-AS1-204ENST00000559861 C2orf91Q6ZV80 131 aa4□□□□□ -1.77
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa3.99□□□□□ -1.77
USP3-AS1-204ENST00000559861 DLEU1O43261 78 aa3.99□□□□□ -1.77
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM236CP0DP71 79 aa3.99□□□□□ -1.77
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q6JHZ5 121 aa3.99□□□□□ -1.77
USP3-AS1-204ENST00000559861 F8WEM9 126 aa3.97□□□□□ -1.77
USP3-AS1-204ENST00000559861 BATFQ16520 125 aa3.97□□□□□ -1.77
USP3-AS1-204ENST00000559861 SCGB1D4Q6XE38 83 aa3.97□□□□□ -1.77
USP3-AS1-204ENST00000559861 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
USP3-AS1-204ENST00000559861 HIGD1BQ9P298 99 aa3.96□□□□□ -1.78
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A1B0GVX0 72 aa3.95□□□□□ -1.78
USP3-AS1-204ENST00000559861 LST1O00453 97 aa3.95□□□□□ -1.78
USP3-AS1-204ENST00000559861 SNHG12Q9BXW3 62 aa3.95□□□□□ -1.78
USP3-AS1-204ENST00000559861 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa3.95□□□□□ -1.78
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3.94□□□□□ -1.78
USP3-AS1-204ENST00000559861 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa3.94□□□□□ -1.78
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q5W150 140 aa3.94□□□□□ -1.78
USP3-AS1-204ENST00000559861 M0R143 59 aa3.93□□□□□ -1.78
USP3-AS1-204ENST00000559861 FXYD2P54710 66 aa3.93□□□□□ -1.78
USP3-AS1-204ENST00000559861 HSD52Q0P140 79 aa3.93□□□□□ -1.78
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q6ZQY7 126 aa3.93□□□□□ -1.78
USP3-AS1-204ENST00000559861 MUSTN1Q8IVN3 82 aa3.93□□□□□ -1.78
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.93□□□□□ -1.78
USP3-AS1-204ENST00000559861 A8MWP4 228 aa3.92□□□□□ -1.78
USP3-AS1-204ENST00000559861 K7ERJ3 54 aa3.92□□□□□ -1.78
USP3-AS1-204ENST00000559861 OCIAD2Q56VL3 154 aa3.92□□□□□ -1.78
USP3-AS1-204ENST00000559861 SS18L2Q9UHA2 77 aa3.92□□□□□ -1.78
USP3-AS1-204ENST00000559861 A6NDN8 102 aa3.91□□□□□ -1.78
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC00575Q6W349 94 aa3.91□□□□□ -1.78
USP3-AS1-204ENST00000559861 SEC61GP60059 68 aa3.9□□□□□ -1.79
USP3-AS1-204ENST00000559861 H3BUT2 72 aa3.89□□□□□ -1.79
USP3-AS1-204ENST00000559861 IFITM1P13164 125 aa3.89□□□□□ -1.79
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPDPFLQ8WWR9 84 aa3.89□□□□□ -1.79
USP3-AS1-204ENST00000559861 RAB37Q96AX2 223 aa3.89□□□□□ -1.79
USP3-AS1-204ENST00000559861 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
USP3-AS1-204ENST00000559861 TAX1BP3O14907 124 aa3.88□□□□□ -1.79
USP3-AS1-204ENST00000559861 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa3.88□□□□□ -1.79
USP3-AS1-204ENST00000559861 hADV29S1A0JD25 119 aa3.87□□□□□ -1.79
USP3-AS1-204ENST00000559861 COPS9Q8WXC6 57 aa3.87□□□□□ -1.79
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A087WSZ3 146 aa3.86□□□□□ -1.79
USP3-AS1-204ENST00000559861 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A1B0GV90 55 aa3.85□□□□□ -1.79
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.85□□□□□ -1.79
USP3-AS1-204ENST00000559861 TEN1Q86WV5 123 aa3.85□□□□□ -1.79
USP3-AS1-204ENST00000559861 SIGMAR1Q99720 223 aa3.85□□□□□ -1.79
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRO1854Q9UHT4 67 aa3.85□□□□□ -1.79
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A0B4J2C4 111 aa3.84□□□□□ -1.79
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC00313P59037 77 aa3.83□□□□□ -1.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 A6NN06 94 aa3.82□□□□□ -1.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 MT1BP07438 61 aa3.82□□□□□ -1.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 VAMP3Q15836 100 aa3.82□□□□□ -1.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.81□□□□□ -1.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 PSMB2P49721 201 aa3.81□□□□□ -1.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.81□□□□□ -1.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A1W2PPM0 123 aa3.8□□□□□ -1.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 SCGB1C2P0DMR2 95 aa3.8□□□□□ -1.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPINK7P58062 85 aa3.8□□□□□ -1.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A1W2PNM2 257 aa3.79□□□□□ -1.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 FABP2P12104 132 aa3.79□□□□□ -1.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.79□□□□□ -1.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGKV4-1P06312 121 aa3.78□□□□□ -1.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPCS1Q9Y6A9 102 aa3.78□□□□□ -1.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.77□□□□□ -1.81
USP3-AS1-204ENST00000559861 K7EP34 96 aa3.76□□□□□ -1.81
USP3-AS1-204ENST00000559861 H3BMG7 143 aa3.75□□□□□ -1.81
USP3-AS1-204ENST00000559861 COX6CP09669 75 aa3.75□□□□□ -1.81
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.75□□□□□ -1.81
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.74□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.4 ms