RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558300.1

TMOD3-202, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD3, Length 430 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-202ENST00000558300 DEFB131AP59861 70 aa0.12□□□□□ -2.39
TMOD3-202ENST00000558300 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa0.11□□□□□ -2.39
TMOD3-202ENST00000558300 SPTBN4Q9H254 2564 aa0.11□□□□□ -2.39
TMOD3-202ENST00000558300 A8MTW9 85 aa0.11□□□□□ -2.39
TMOD3-202ENST00000558300 TOMM5Q8N4H5 51 aa0.11□□□□□ -2.39
TMOD3-202ENST00000558300 DCHS2Q6V1P9 2916 aa0.11□□□□□ -2.39
TMOD3-202ENST00000558300 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
TMOD3-202ENST00000558300 EPG5Q9HCE0 2579 aa0.1□□□□□ -2.39
TMOD3-202ENST00000558300 PKHD1P08F94 4074 aa0.1□□□□□ -2.39
TMOD3-202ENST00000558300 M0QZ58 72 aa0.1□□□□□ -2.39
TMOD3-202ENST00000558300 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
TMOD3-202ENST00000558300 ALS2Q96Q42 1657 aa0.1□□□□□ -2.39
TMOD3-202ENST00000558300 TGP01266 2768 aa0.1□□□□□ -2.39
TMOD3-202ENST00000558300 TENM2Q9NT68 2774 aa0.1□□□□□ -2.39
TMOD3-202ENST00000558300 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa0.1□□□□□ -2.39
TMOD3-202ENST00000558300 ZANQ9Y493 2812 aa0.09□□□□□ -2.39
TMOD3-202ENST00000558300 STAB2Q8WWQ8 2551 aa0.09□□□□□ -2.39
TMOD3-202ENST00000558300 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.39
TMOD3-202ENST00000558300 SYCP2Q9BX26 1530 aa0.09□□□□□ -2.39
TMOD3-202ENST00000558300 LRP1BQ9NZR2 4599 aa0.09□□□□□ -2.39
TMOD3-202ENST00000558300 PKD1P98161 4303 aa0.09□□□□□ -2.39
TMOD3-202ENST00000558300 ITSN2Q9NZM3 1697 aa0.09□□□□□ -2.39
TMOD3-202ENST00000558300 ITPR3Q14573 2671 aa0.09□□□□□ -2.39
TMOD3-202ENST00000558300 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa0.09□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 LRRK2Q5S007 2527 aa0.09□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 CROCC2H7BZ55 1655 aa0.08□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 NBASA2RRP1 2371 aa0.08□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 DSPP15924 2871 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 HIVEP1P15822 2718 aa0.08□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 SPG11Q96JI7 2443 aa0.08□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 TEX15Q9BXT5 2789 aa0.08□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa0.08□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 PDZD2O15018 2839 aa0.08□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 NF1P21359 2839 aa0.08□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 FASNP49327 2511 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 PKD1L2Q7Z442 2459 aa0.07□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 CCDC168Q8NDH2 2452 aa0.07□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 ADCY10Q96PN6 1610 aa0.07□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 SPRR2EP22531 72 aa0.07□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 STAB1Q9NY15 2570 aa0.07□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 COL6A3P12111 3177 aa0.07□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 COL6A5A8TX70 2615 aa0.07□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP0.07□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 CEP290O15078 2479 aa0.07□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa0.07□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 ABCC8Q09428 1581 aa0.06□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 MXRA5Q9NR99 2828 aa0.06□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 MTORP42345 2549 aa0.06□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 FANCD2Q9BXW9 1451 aa0.06□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa0.06□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 MYO18BQ8IUG5 2567 aa0.06□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 AGLP35573 1532 aa0.06□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa0.06□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 CEP295Q9C0D2 2601 aa0.05□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 LY75O60449 1722 aa0.05□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 CFAP46Q8IYW2 2715 aa0.05□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 KALRNO60229 2985 aa0.05□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 LINC01546A6NGU7 62 aa0.05□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 DEFB1P60022 68 aa0.05□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa0.05□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 ACACAQ13085 2346 aa0.05□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 MAST1Q9Y2H9 1570 aa0.05□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 ZZEF1O43149 2961 aa0.05□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 TACC2O95359 2948 aa0.04□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 ITPR1Q14643 2758 aa0.04□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 NDUFA1O15239 70 aa0.04□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 PREX2Q70Z35 1606 aa0.04□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 NBEAQ8NFP9 2946 aa0.04□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 TLN2Q9Y4G6 2542 aa0.04□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 DMXL1Q9Y485 3027 aa0.03□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 SONP18583 2426 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa0.03□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 MYO9AB2RTY4 2548 aa0.03□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 MT1AP04731 61 aa0.03□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa0.03□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 A0A1B0GUL6 1792 aa0.03□□□□□ -2.4
TMOD3-202ENST00000558300 FAM186AA6NE01 2351 aa0.03□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 MGAM2Q2M2H8 2515 aa0.03□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 LMO7Q8WWI1 1683 aa0.02□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 C5orf42Q9H799 3197 aa0.02□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 SPRR2FQ96RM1 72 aa0.02□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP0.01□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa0.01□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 MUC2Q02817 5179 aa0.01□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 LRBAP50851 2863 aa0.01□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 A0A0C4DFX4 3053 aa0.01□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 HTTP42858 3142 aa0.01□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 KIF21BO75037 1637 aa0.01□□□□□ -2.41
TMOD3-202ENST00000558300 ACACBO00763 2458 aa0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms