RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 DSCR8Q96T75 97 aa7.59□□□□□ -1.19
CS-231ENST00000552222 SSPOA2VEC9 5147 aa7.59□□□□□ -1.2
CS-231ENST00000552222 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.58□□□□□ -1.2
CS-231ENST00000552222 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-231ENST00000552222 CCKP06307 115 aa7.57□□□□□ -1.2
CS-231ENST00000552222 A0A087WSZ3 146 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-231ENST00000552222 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-231ENST00000552222 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.56□□□□□ -1.2
CS-231ENST00000552222 USH2AO75445 5202 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-231ENST00000552222 PDE6GP18545 87 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-231ENST00000552222 Q6ZQT0 140 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-231ENST00000552222 M0R2T5 61 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-231ENST00000552222 XP32Q5T750 250 aa7.51□□□□□ -1.21
CS-231ENST00000552222 Q96NJ1 140 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-231ENST00000552222 SIGMAR1Q99720 223 aa7.49□□□□□ -1.21
CS-231ENST00000552222 A0A1B0GW54 56 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-231ENST00000552222 PCOTHQ58A44 107 aa7.48□□□□□ -1.21
CS-231ENST00000552222 LINC00643Q86TS7 51 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-231ENST00000552222 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CS-231ENST00000552222 LINC00846Q9NV44 126 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-231ENST00000552222 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CS-231ENST00000552222 MT-ATP8P03928 68 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-231ENST00000552222 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-231ENST00000552222 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CS-231ENST00000552222 C9orf92A6NGG3 77 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-231ENST00000552222 IGKV4-1P06312 121 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-231ENST00000552222 UBL5Q9BZL1 73 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-231ENST00000552222 SCGB1A1P11684 91 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-231ENST00000552222 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-231ENST00000552222 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-231ENST00000552222 IMUPQ9GZP8 106 aa7.37□□□□□ -1.23
CS-231ENST00000552222 NREPQ16612 68 aa7.36□□□□□ -1.23
CS-231ENST00000552222 Q6ZVQ6 151 aa7.36□□□□□ -1.23
CS-231ENST00000552222 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CS-231ENST00000552222 J3KT08 172 aa7.35□□□□□ -1.23
CS-231ENST00000552222 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-231ENST00000552222 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-231ENST00000552222 A0A1B0GVX0 72 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-231ENST00000552222 DSCR10P59022 87 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-231ENST00000552222 CXCL6P80162 114 aa7.31□□□□□ -1.24
CS-231ENST00000552222 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-231ENST00000552222 LINC00313P59037 77 aa7.3□□□□□ -1.24
CS-231ENST00000552222 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.29□□□□□ -1.24
CS-231ENST00000552222 A8MWP4 228 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-231ENST00000552222 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CS-231ENST00000552222 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.28□□□□□ -1.24
CS-231ENST00000552222 NDUFB1O75438 58 aa7.27□□□□□ -1.25
CS-231ENST00000552222 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-231ENST00000552222 C8orf87E5RJ46 101 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-231ENST00000552222 Q75L30 129 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-231ENST00000552222 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.26□□□□□ -1.25
CS-231ENST00000552222 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-231ENST00000552222 A8MUU9 505 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-231ENST00000552222 BPY2O14599 106 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-231ENST00000552222 PRR15Q8IV56 129 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-231ENST00000552222 PCP4P48539 62 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-231ENST00000552222 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CS-231ENST00000552222 K7EQZ3 153 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-231ENST00000552222 LCE2BO14633 110 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-231ENST00000552222 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-231ENST00000552222 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-231ENST00000552222 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-231ENST00000552222 A0A087WVE0 104 aa7.19□□□□□ -1.26
CS-231ENST00000552222 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.18□□□□□ -1.26
CS-231ENST00000552222 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-231ENST00000552222 Q8N9L7 120 aa7.16□□□□□ -1.26
CS-231ENST00000552222 ATOX1O00244 68 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-231ENST00000552222 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CS-231ENST00000552222 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.14□□□□□ -1.27
CS-231ENST00000552222 hDV103S1A0JD37 113 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-231ENST00000552222 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.11□□□□□ -1.27
CS-231ENST00000552222 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CS-231ENST00000552222 MT2AP02795 61 aa7.09□□□□□ -1.27
CS-231ENST00000552222 CASC2Q6XLA1 102 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-231ENST00000552222 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.07□□□□□ -1.28
CS-231ENST00000552222 MT1FP04733 61 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-231ENST00000552222 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-231ENST00000552222 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CS-231ENST00000552222 HCG22E2RYF7 251 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-231ENST00000552222 SERP2Q8N6R1 65 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-231ENST00000552222 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-231ENST00000552222 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-231ENST00000552222 COX7CP15954 63 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-231ENST00000552222 UQCRQO14949 82 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-231ENST00000552222 NDUFS5O43920 106 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-231ENST00000552222 NEBP20929 6669 aa7□□□□□ -1.29
CS-231ENST00000552222 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7□□□□□ -1.29
CS-231ENST00000552222 OCR1Q9BZK8 76 aa6.98□□□□□ -1.29
CS-231ENST00000552222 CCDC179H3BU77 68 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-231ENST00000552222 Q5W150 140 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-231ENST00000552222 SPINK7P58062 85 aa6.94□□□□□ -1.3
CS-231ENST00000552222 KRTAP10-10P60014 251 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-231ENST00000552222 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.93□□□□□ -1.3
CS-231ENST00000552222 HRES1P13985 223 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-231ENST00000552222 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-231ENST00000552222 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-231ENST00000552222 KLKP1Q107X0 134 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-231ENST00000552222 C5orf47Q569G3 176 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-231ENST00000552222 C20orf197Q8N268 126 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-231ENST00000552222 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.84□□□□□ -1.31
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