RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550078.2

ZBED6-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED6, Length 12,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6-202ENST00000550078 FAM229BQ4G0N7 80 aa3.09□□□□□ -1.92
ZBED6-202ENST00000550078 CNFNQ9BYD5 112 aa3.08□□□□□ -1.92
ZBED6-202ENST00000550078 H3BS24 57 aa3.08□□□□□ -1.92
ZBED6-202ENST00000550078 A0A087X002 238 aa3.07□□□□□ -1.92
ZBED6-202ENST00000550078 Q75L30 129 aa3.06□□□□□ -1.92
ZBED6-202ENST00000550078 A8MU10 97 aa3.05□□□□□ -1.92
ZBED6-202ENST00000550078 FBN3Q75N90 2809 aa3.03□□□□□ -1.92
ZBED6-202ENST00000550078 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa3.03□□□□□ -1.92
ZBED6-202ENST00000550078 PRR34Q9NV39 138 aa3.03□□□□□ -1.92
ZBED6-202ENST00000550078 A0A1B0GW54 56 aa3.03□□□□□ -1.92
ZBED6-202ENST00000550078 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.03□□□□□ -1.92
ZBED6-202ENST00000550078 COL7A1Q02388 2944 aa3.03□□□□□ -1.92
ZBED6-202ENST00000550078 PANO1I0J062 215 aa3.03□□□□□ -1.92
ZBED6-202ENST00000550078 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa3.02□□□□□ -1.93
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.02□□□□□ -1.93
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP1-1Q07627 177 aa3.01□□□□□ -1.93
ZBED6-202ENST00000550078 A0A096LNJ9 63 aa3□□□□□ -1.93
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
ZBED6-202ENST00000550078 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa2.97□□□□□ -1.93
ZBED6-202ENST00000550078 TGP01266 2768 aa2.97□□□□□ -1.93
ZBED6-202ENST00000550078 NDUFAF8A1L188 74 aa2.96□□□□□ -1.94
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa2.96□□□□□ -1.94
ZBED6-202ENST00000550078 LORP23490 312 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
ZBED6-202ENST00000550078 ZFHX3Q15911 3703 aa2.94□□□□□ -1.94
ZBED6-202ENST00000550078 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
ZBED6-202ENST00000550078 LINC00310P59036 64 aa2.94□□□□□ -1.94
ZBED6-202ENST00000550078 LOC400499M0QZD8 3231 aa2.93□□□□□ -1.94
ZBED6-202ENST00000550078 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa2.92□□□□□ -1.94
ZBED6-202ENST00000550078 A0A096LNT2 108 aa2.91□□□□□ -1.94
ZBED6-202ENST00000550078 BRCA2P51587 3418 aa2.9□□□□□ -1.94
ZBED6-202ENST00000550078 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa2.9□□□□□ -1.94
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
ZBED6-202ENST00000550078 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa2.9□□□□□ -1.95
ZBED6-202ENST00000550078 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa2.89□□□□□ -1.95
ZBED6-202ENST00000550078 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa2.88□□□□□ -1.95
ZBED6-202ENST00000550078 H0YAA0 97 aa2.88□□□□□ -1.95
ZBED6-202ENST00000550078 A6NN06 94 aa2.88□□□□□ -1.95
ZBED6-202ENST00000550078 RPS29P62273 56 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
ZBED6-202ENST00000550078 ASPMQ8IZT6 3477 aa2.86□□□□□ -1.95
ZBED6-202ENST00000550078 COX8CQ7Z4L0 72 aa2.86□□□□□ -1.95
ZBED6-202ENST00000550078 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
ZBED6-202ENST00000550078 Q5VV11 94 aa2.84□□□□□ -1.95
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa2.83□□□□□ -1.96
ZBED6-202ENST00000550078 OTOGQ6ZRI0 2925 aa2.82□□□□□ -1.96
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa2.82□□□□□ -1.96
ZBED6-202ENST00000550078 CDH23Q9H251 3354 aa2.82□□□□□ -1.96
ZBED6-202ENST00000550078 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
ZBED6-202ENST00000550078 FBN2P35556 2912 aa2.81□□□□□ -1.96
ZBED6-202ENST00000550078 CYSTM1Q9H1C7 97 aa2.81□□□□□ -1.96
ZBED6-202ENST00000550078 OCR1Q9BZK8 76 aa2.81□□□□□ -1.96
ZBED6-202ENST00000550078 MYO15AQ9UKN7 3530 aa2.8□□□□□ -1.96
ZBED6-202ENST00000550078 Q5XG85 94 aa2.8□□□□□ -1.96
ZBED6-202ENST00000550078 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
ZBED6-202ENST00000550078 LINC00472Q9H8W2 130 aa2.79□□□□□ -1.96
ZBED6-202ENST00000550078 SPRR1AP35321 89 aa2.79□□□□□ -1.96
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa2.76□□□□□ -1.97
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa2.76□□□□□ -1.97
ZBED6-202ENST00000550078 XP32Q5T750 250 aa2.76□□□□□ -1.97
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP12-2P59991 146 aa2.76□□□□□ -1.97
ZBED6-202ENST00000550078 DCHS1Q96JQ0 3298 aa2.74□□□□□ -1.97
ZBED6-202ENST00000550078 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa2.72□□□□□ -1.97
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.71□□□□□ -1.98
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
ZBED6-202ENST00000550078 RELNP78509 3460 aa2.68□□□□□ -1.98
ZBED6-202ENST00000550078 PP632Q6XCG6 107 aa2.67□□□□□ -1.98
ZBED6-202ENST00000550078 TPRXLQ17RH7 258 aa2.64□□□□□ -1.99
ZBED6-202ENST00000550078 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa2.63□□□□□ -1.99
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP10-5P60370 271 aa2.63□□□□□ -1.99
ZBED6-202ENST00000550078 DMDP11532 3685 aa2.62□□□□□ -1.99
ZBED6-202ENST00000550078 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.62□□□□□ -1.99
ZBED6-202ENST00000550078 LAMA5O15230 3695 aa2.59□□□□□ -1.99
ZBED6-202ENST00000550078 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
ZBED6-202ENST00000550078 MUC3AQ02505 3323 aa2.57□□□□□ -2
ZBED6-202ENST00000550078 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa2.56□□□□□ -2
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.54□□□□□ -2
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa2.54□□□□□ -2
ZBED6-202ENST00000550078 CSMD2Q7Z408 3487 aa2.54□□□□□ -2
ZBED6-202ENST00000550078 CUBNO60494 3623 aa2.52□□□□□ -2.01
ZBED6-202ENST00000550078 CSMD1Q96PZ7 3565 aa2.51□□□□□ -2.01
ZBED6-202ENST00000550078 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa2.47□□□□□ -2.01
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP10-12P60413 245 aa2.46□□□□□ -2.02
ZBED6-202ENST00000550078 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.45□□□□□ -2.02
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa2.45□□□□□ -2.02
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa2.45□□□□□ -2.02
ZBED6-202ENST00000550078 CSMD3Q7Z407 3707 aa2.44□□□□□ -2.02
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa2.38□□□□□ -2.03
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.38□□□□□ -2.03
ZBED6-202ENST00000550078 SPRR2EP22531 72 aa2.37□□□□□ -2.03
ZBED6-202ENST00000550078 SPRR2BP35325 72 aa2.37□□□□□ -2.03
ZBED6-202ENST00000550078 SPRR2AP35326 72 aa2.37□□□□□ -2.03
ZBED6-202ENST00000550078 AKAP9Q99996 3911 aa2.34□□□□□ -2.04
ZBED6-202ENST00000550078 VPS13CQ709C8 3753 aa2.33□□□□□ -2.04
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP12-3P60328 96 aa2.3□□□□□ -2.04
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
ZBED6-202ENST00000550078 BSNQ9UPA5 3926 aa2.3□□□□□ -2.04
ZBED6-202ENST00000550078 KRTAP12-1P59990 96 aa2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 150.6 ms