RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548220.1

PTPRR-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRR, Length 1,374 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-207ENST00000548220 UBL5Q9BZL1 73 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRR-207ENST00000548220 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
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PTPRR-207ENST00000548220 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
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PTPRR-207ENST00000548220 HERC1Q15751 4861 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRR-207ENST00000548220 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
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PTPRR-207ENST00000548220 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.41□□□□□ -1.86
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PTPRR-207ENST00000548220 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRR-207ENST00000548220 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRR-207ENST00000548220 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
PTPRR-207ENST00000548220 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRR-207ENST00000548220 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRR-207ENST00000548220 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.39□□□□□ -1.87
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