RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-209ENST00000547449 hDV103S1A0JD37 113 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-209ENST00000547449 C8orf87E5RJ46 101 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-209ENST00000547449 PKHD1P08F94 4074 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-209ENST00000547449 RYR3Q15413 4870 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-209ENST00000547449 Q8N1X5 172 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-209ENST00000547449 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-209ENST00000547449 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-209ENST00000547449 FAT1Q14517 4588 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-209ENST00000547449 KRTAP10-8P60410 259 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-209ENST00000547449 C5orf47Q569G3 176 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-209ENST00000547449 C20orf197Q8N268 126 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-209ENST00000547449 KLKP1Q107X0 134 aa5.54□□□□□ -1.52
CS-209ENST00000547449 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.54□□□□□ -1.52
CS-209ENST00000547449 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CS-209ENST00000547449 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.54□□□□□ -1.52
CS-209ENST00000547449 LINC00313P59037 77 aa5.53□□□□□ -1.52
CS-209ENST00000547449 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.53□□□□□ -1.52
CS-209ENST00000547449 A0A0U1RQV1 116 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-209ENST00000547449 J3QL48 77 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-209ENST00000547449 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.5□□□□□ -1.53
CS-209ENST00000547449 H3BPC8 53 aa5.49□□□□□ -1.53
CS-209ENST00000547449 NDUFC1O43677 76 aa5.49□□□□□ -1.53
CS-209ENST00000547449 MP68P56378 58 aa5.49□□□□□ -1.53
CS-209ENST00000547449 SNURFQ9Y675 71 aa5.49□□□□□ -1.53
CS-209ENST00000547449 RYR1P21817 5038 aa5.49□□□□□ -1.53
CS-209ENST00000547449 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CS-209ENST00000547449 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CS-209ENST00000547449 HSPG2P98160 4391 aa5.46□□□□□ -1.53
CS-209ENST00000547449 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.46□□□□□ -1.54
CS-209ENST00000547449 H0Y9P7 68 aa5.46□□□□□ -1.54
CS-209ENST00000547449 H7BZZ5 65 aa5.46□□□□□ -1.54
CS-209ENST00000547449 NDUFS5O43920 106 aa5.46□□□□□ -1.54
CS-209ENST00000547449 TMEM258P61165 79 aa5.46□□□□□ -1.54
CS-209ENST00000547449 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-209ENST00000547449 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-209ENST00000547449 OXTP01178 125 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-209ENST00000547449 LINC00208Q96KT6 92 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-209ENST00000547449 MT1HL1P0DM35 61 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-209ENST00000547449 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-209ENST00000547449 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-209ENST00000547449 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.4□□□□□ -1.54
CS-209ENST00000547449 Q5W150 140 aa5.4□□□□□ -1.54
CS-209ENST00000547449 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
CS-209ENST00000547449 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CS-209ENST00000547449 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-209ENST00000547449 FAM236CP0DP71 79 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-209ENST00000547449 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-209ENST00000547449 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.37□□□□□ -1.55
CS-209ENST00000547449 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CS-209ENST00000547449 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.37□□□□□ -1.55
CS-209ENST00000547449 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CS-209ENST00000547449 A8MUU9 505 aa5.35□□□□□ -1.55
CS-209ENST00000547449 LCE2BO14633 110 aa5.35□□□□□ -1.55
CS-209ENST00000547449 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.35□□□□□ -1.55
CS-209ENST00000547449 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CS-209ENST00000547449 C9orf92A6NGG3 77 aa5.34□□□□□ -1.55
CS-209ENST00000547449 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.34□□□□□ -1.55
CS-209ENST00000547449 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.33□□□□□ -1.56
CS-209ENST00000547449 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-209ENST00000547449 IGKV2-30P06310 120 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-209ENST00000547449 TNXBP22105 4242 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-209ENST00000547449 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-209ENST00000547449 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CS-209ENST00000547449 Q75L30 129 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-209ENST00000547449 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-209ENST00000547449 PCOTHQ58A44 107 aa5.28□□□□□ -1.56
CS-209ENST00000547449 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
CS-209ENST00000547449 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.25□□□□□ -1.57
CS-209ENST00000547449 PRR4Q16378 134 aa5.24□□□□□ -1.57
CS-209ENST00000547449 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.23□□□□□ -1.57
CS-209ENST00000547449 HRES1P13985 223 aa5.23□□□□□ -1.57
CS-209ENST00000547449 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CS-209ENST00000547449 XP32Q5T750 250 aa5.22□□□□□ -1.57
CS-209ENST00000547449 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.22□□□□□ -1.57
CS-209ENST00000547449 TPRXLQ17RH7 258 aa5.21□□□□□ -1.58
CS-209ENST00000547449 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.21□□□□□ -1.58
CS-209ENST00000547449 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.19□□□□□ -1.58
CS-209ENST00000547449 HERC2O95714 4834 aa5.19□□□□□ -1.58
CS-209ENST00000547449 SPINK7P58062 85 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-209ENST00000547449 DMAC1Q96GE9 116 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-209ENST00000547449 ACYP2P14621 99 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-209ENST00000547449 COA5Q86WW8 74 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-209ENST00000547449 MYCBP2O75592 4640 aa5.13□□□□□ -1.59
CS-209ENST00000547449 A8MUN3 132 aa5.12□□□□□ -1.59
CS-209ENST00000547449 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.1□□□□□ -1.59
CS-209ENST00000547449 C4orf26Q17RF5 130 aa5.09□□□□□ -1.59
CS-209ENST00000547449 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.07□□□□□ -1.6
CS-209ENST00000547449 Q1T7F1 81 aa5.06□□□□□ -1.6
CS-209ENST00000547449 LCE2CQ5TA81 110 aa5.06□□□□□ -1.6
CS-209ENST00000547449 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.06□□□□□ -1.6
CS-209ENST00000547449 V9GYY9 64 aa5.05□□□□□ -1.6
CS-209ENST00000547449 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.04□□□□□ -1.6
CS-209ENST00000547449 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CS-209ENST00000547449 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.03□□□□□ -1.6
CS-209ENST00000547449 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CS-209ENST00000547449 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5□□□□□ -1.61
CS-209ENST00000547449 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.97□□□□□ -1.61
CS-209ENST00000547449 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.94□□□□□ -1.62
CS-209ENST00000547449 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.3 ms