RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529045.1

PTPN22-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22, human

TSL 4

Gene PTPN22, Length 527 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN22-208	ENST00000529045		Q5VV11	94 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN22-208	ENST00000529045	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN22-208	ENST00000529045	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN22-208	ENST00000529045	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PTPN22-208	ENST00000529045	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045		A8MUN3	132 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045		H0Y9P7	68 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045	IGFL1	Q6UW32	110 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045	CASC2	Q6XLA1	102 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045		A8MWP4	228 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045	SPRR1B	P22528	89 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045		H0Y9J4	135 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045	PRR15L	Q9BU68	103 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PTPN22-208	ENST00000529045		A0A087WSZ3	146 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045	LY6G6C	O95867	125 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045	PRR4	Q16378	134 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045		A6NN06	94 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045	COA5	Q86WW8	74 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045		A6NED7	52 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045	MOBP	Q13875	183 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045		A0A087X002	238 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045	NUPR2	A6NF83	97 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045		Q6ZR54	194 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045	LCA10	Q71F78	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PTPN22-208	ENST00000529045	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN22-208	ENST00000529045	HSPG2	P98160	4391 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PTPN22-208	ENST00000529045	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PTPN22-208	ENST00000529045	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PTPN22-208	ENST00000529045	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PTPN22-208	ENST00000529045	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PTPN22-208	ENST00000529045	RETN	Q9HD89	108 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PTPN22-208	ENST00000529045	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PTPN22-208	ENST00000529045		A0A1B0GVY2	172 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PTPN22-208	ENST00000529045	PRLH	P81277	87 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PTPN22-208	ENST00000529045		A8MU10	97 aa		4.47	□□□□□ -1.69
PTPN22-208	ENST00000529045	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		4.47	□□□□□ -1.69
PTPN22-208	ENST00000529045		A0A096LNI7	61 aa		4.46	□□□□□ -1.7
PTPN22-208	ENST00000529045	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.46	□□□□□ -1.7
PTPN22-208	ENST00000529045	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.46	□□□□□ -1.7
PTPN22-208	ENST00000529045	PKD1	P98161	4303 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PTPN22-208	ENST00000529045		A0A0G2JQZ4	141 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PTPN22-208	ENST00000529045		A0A1W2PNN7	141 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PTPN22-208	ENST00000529045		A0A1B0GVX0	72 aa		4.44	□□□□□ -1.7
PTPN22-208	ENST00000529045	HRES1	P13985	223 aa		4.44	□□□□□ -1.7
PTPN22-208	ENST00000529045	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.44	□□□□□ -1.7
PTPN22-208	ENST00000529045		Q96NJ1	140 aa		4.44	□□□□□ -1.7
PTPN22-208	ENST00000529045	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
PTPN22-208	ENST00000529045	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.43	□□□□□ -1.7
PTPN22-208	ENST00000529045	PCOTH	Q58A44	107 aa		4.43	□□□□□ -1.7
PTPN22-208	ENST00000529045	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.43	□□□□□ -1.7
PTPN22-208	ENST00000529045	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.43	□□□□□ -1.7
PTPN22-208	ENST00000529045	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.42	□□□□□ -1.7
PTPN22-208	ENST00000529045	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
PTPN22-208	ENST00000529045	ACYP2	P14621	99 aa		4.41	□□□□□ -1.7
PTPN22-208	ENST00000529045	SPINK7	P58062	85 aa		4.41	□□□□□ -1.7
PTPN22-208	ENST00000529045	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.7
PTPN22-208	ENST00000529045	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PTPN22-208	ENST00000529045	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PTPN22-208	ENST00000529045	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PTPN22-208	ENST00000529045	C8orf87	E5RJ46	101 aa		4.38	□□□□□ -1.71
PTPN22-208	ENST00000529045	DMAC1	Q96GE9	116 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPN22-208	ENST00000529045	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN22-208	ENST00000529045	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN22-208	ENST00000529045	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PTPN22-208	ENST00000529045	RTL8C	O15255	209 aa		4.35	□□□□□ -1.71

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