RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523555.5

PABPC1-222, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 3

Gene PABPC1, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-222	ENST00000523555	DSCR8	Q96T75	97 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PABPC1-222	ENST00000523555		C9JAW5	83 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-222	ENST00000523555	TAX1BP3	O14907	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-222	ENST00000523555	LINC00313	P59037	77 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PABPC1-222	ENST00000523555	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-222	ENST00000523555	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-222	ENST00000523555		Q6ZQT0	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PABPC1-222	ENST00000523555		A0A1W2PPM0	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PABPC1-222	ENST00000523555	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PABPC1-222	ENST00000523555	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PABPC1-222	ENST00000523555		A0A1B0GVX0	72 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-222	ENST00000523555	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-222	ENST00000523555	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PABPC1-222	ENST00000523555	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-222	ENST00000523555	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PABPC1-222	ENST00000523555	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PABPC1-222	ENST00000523555		M0R2T5	61 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PABPC1-222	ENST00000523555	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PABPC1-222	ENST00000523555	C8orf87	E5RJ46	101 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PABPC1-222	ENST00000523555	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-222	ENST00000523555	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-222	ENST00000523555		F8W1H4	67 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-222	ENST00000523555		H3BT86	120 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-222	ENST00000523555		J3KT08	172 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-222	ENST00000523555		K7EP34	96 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-222	ENST00000523555	HRES1	P13985	223 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-222	ENST00000523555	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PABPC1-222	ENST00000523555		A8MWP4	228 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-222	ENST00000523555	PDE6G	P18545	87 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-222	ENST00000523555	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PABPC1-222	ENST00000523555		A0A1B0GW54	56 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PABPC1-222	ENST00000523555	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PABPC1-222	ENST00000523555		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PABPC1-222	ENST00000523555	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PABPC1-222	ENST00000523555	NDUFB1	O75438	58 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-222	ENST00000523555	NREP	Q16612	68 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PABPC1-222	ENST00000523555	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-222	ENST00000523555	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-222	ENST00000523555	PRR15	Q8IV56	129 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-222	ENST00000523555	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PABPC1-222	ENST00000523555		K7EQZ3	153 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-222	ENST00000523555	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PABPC1-222	ENST00000523555	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-222	ENST00000523555	FAM236C	P0DP71	79 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-222	ENST00000523555		Q6ZVQ6	151 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-222	ENST00000523555	PRO0461	Q9UI25	63 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PABPC1-222	ENST00000523555	SPINK7	P58062	85 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-222	ENST00000523555	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PABPC1-222	ENST00000523555		A0A1B0GV90	55 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PABPC1-222	ENST00000523555		Q8N9L7	120 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PABPC1-222	ENST00000523555	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PABPC1-222	ENST00000523555	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PABPC1-222	ENST00000523555	hDV103S1	A0JD37	113 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PABPC1-222	ENST00000523555	BPY2	O14599	106 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PABPC1-222	ENST00000523555	MT2A	P02795	61 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PABPC1-222	ENST00000523555	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PABPC1-222	ENST00000523555	USH2A	O75445	5202 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PABPC1-222	ENST00000523555		J3QR89	54 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PABPC1-222	ENST00000523555	ACYP1	P07311	99 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PABPC1-222	ENST00000523555	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PABPC1-222	ENST00000523555	NDUFS5	O43920	106 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PABPC1-222	ENST00000523555	MT1F	P04733	61 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PABPC1-222	ENST00000523555	ETDB	Q3ZM63	59 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PABPC1-222	ENST00000523555		Q5W150	140 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PABPC1-222	ENST00000523555	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PABPC1-222	ENST00000523555	SSPO	A2VEC9	5147 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PABPC1-222	ENST00000523555	HCG22	E2RYF7	251 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-222	ENST00000523555	CASC2	Q6XLA1	102 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PABPC1-222	ENST00000523555	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-222	ENST00000523555	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-222	ENST00000523555	UBL5	Q9BZL1	73 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PABPC1-222	ENST00000523555		K7ERU9	68 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-222	ENST00000523555	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PABPC1-222	ENST00000523555	KRTAP10-10	P60014	251 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PABPC1-222	ENST00000523555	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PABPC1-222	ENST00000523555	CXCL6	P80162	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-222	ENST00000523555	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-222	ENST00000523555	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PABPC1-222	ENST00000523555	C4orf26	Q17RF5	130 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PABPC1-222	ENST00000523555	LINC00643	Q86TS7	51 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PABPC1-222	ENST00000523555	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PABPC1-222	ENST00000523555	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
PABPC1-222	ENST00000523555	IMUP	Q9GZP8	106 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PABPC1-222	ENST00000523555	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.47	□□□□□ -1.69
PABPC1-222	ENST00000523555	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PABPC1-222	ENST00000523555	C5orf47	Q569G3	176 aa		4.43	□□□□□ -1.7
PABPC1-222	ENST00000523555	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		4.43	□□□□□ -1.7
PABPC1-222	ENST00000523555	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.42	□□□□□ -1.7
PABPC1-222	ENST00000523555		A0A087WVE0	104 aa		4.41	□□□□□ -1.7
PABPC1-222	ENST00000523555	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
PABPC1-222	ENST00000523555	LCA10	Q71F78	164 aa		4.41	□□□□□ -1.7
PABPC1-222	ENST00000523555	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PABPC1-222	ENST00000523555		S4R3F8	94 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PABPC1-222	ENST00000523555	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PABPC1-222	ENST00000523555	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
PABPC1-222	ENST00000523555	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PABPC1-222	ENST00000523555	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PABPC1-222	ENST00000523555	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PABPC1-222	ENST00000523555	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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