RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 LIMD2Q9BT23 127 aa6.49□□□□□ -1.37
UBE2B-208ENST00000511807 LCE1DQ5T752 114 aa6.47□□□□□ -1.37
UBE2B-208ENST00000511807 Q5XG85 94 aa6.46□□□□□ -1.38
UBE2B-208ENST00000511807 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.46□□□□□ -1.38
UBE2B-208ENST00000511807 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.45□□□□□ -1.38
UBE2B-208ENST00000511807 A0A087WSZ3 146 aa6.45□□□□□ -1.38
UBE2B-208ENST00000511807 TPRXLQ17RH7 258 aa6.43□□□□□ -1.38
UBE2B-208ENST00000511807 MUC2Q02817 5179 aa6.42□□□□□ -1.38
UBE2B-208ENST00000511807 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.42□□□□□ -1.38
UBE2B-208ENST00000511807 J3QR89 54 aa6.41□□□□□ -1.38
UBE2B-208ENST00000511807 ACYP1P07311 99 aa6.39□□□□□ -1.39
UBE2B-208ENST00000511807 NREPQ16612 68 aa6.39□□□□□ -1.39
UBE2B-208ENST00000511807 C1orf195Q5TG92 126 aa6.37□□□□□ -1.39
UBE2B-208ENST00000511807 UBL5Q9BZL1 73 aa6.37□□□□□ -1.39
UBE2B-208ENST00000511807 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.36□□□□□ -1.39
UBE2B-208ENST00000511807 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
UBE2B-208ENST00000511807 LINC00846Q9NV44 126 aa6.35□□□□□ -1.39
UBE2B-208ENST00000511807 J3KT08 172 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2B-208ENST00000511807 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.34□□□□□ -1.39
UBE2B-208ENST00000511807 Q6ZVQ6 151 aa6.33□□□□□ -1.4
UBE2B-208ENST00000511807 K7ERU9 68 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2B-208ENST00000511807 IGKV4-1P06312 121 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2B-208ENST00000511807 Q96NJ1 140 aa6.32□□□□□ -1.4
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.31□□□□□ -1.4
UBE2B-208ENST00000511807 BPY2O14599 106 aa6.3□□□□□ -1.4
UBE2B-208ENST00000511807 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.3□□□□□ -1.4
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.3□□□□□ -1.4
UBE2B-208ENST00000511807 SIGMAR1Q99720 223 aa6.3□□□□□ -1.4
UBE2B-208ENST00000511807 NDUFB1O75438 58 aa6.29□□□□□ -1.4
UBE2B-208ENST00000511807 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.28□□□□□ -1.4
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.26□□□□□ -1.41
UBE2B-208ENST00000511807 A8MWP4 228 aa6.25□□□□□ -1.41
UBE2B-208ENST00000511807 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
UBE2B-208ENST00000511807 CXCL6P80162 114 aa6.24□□□□□ -1.41
UBE2B-208ENST00000511807 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.24□□□□□ -1.41
UBE2B-208ENST00000511807 LINC00643Q86TS7 51 aa6.24□□□□□ -1.41
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.24□□□□□ -1.41
UBE2B-208ENST00000511807 A0A1B0GVX0 72 aa6.23□□□□□ -1.41
UBE2B-208ENST00000511807 DSCR10P59022 87 aa6.23□□□□□ -1.41
UBE2B-208ENST00000511807 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.22□□□□□ -1.41
UBE2B-208ENST00000511807 PRR15Q8IV56 129 aa6.22□□□□□ -1.41
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.22□□□□□ -1.41
UBE2B-208ENST00000511807 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.21□□□□□ -1.42
UBE2B-208ENST00000511807 C8orf87E5RJ46 101 aa6.21□□□□□ -1.42
UBE2B-208ENST00000511807 LINC00313P59037 77 aa6.21□□□□□ -1.42
UBE2B-208ENST00000511807 C9orf92A6NGG3 77 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2B-208ENST00000511807 K7EQZ3 153 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2B-208ENST00000511807 MUC17Q685J3 4493 aa6.19□□□□□ -1.42
UBE2B-208ENST00000511807 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.17□□□□□ -1.42
UBE2B-208ENST00000511807 Q8N9L7 120 aa6.16□□□□□ -1.42
UBE2B-208ENST00000511807 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
UBE2B-208ENST00000511807 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.14□□□□□ -1.43
UBE2B-208ENST00000511807 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.12□□□□□ -1.43
UBE2B-208ENST00000511807 hDV103S1A0JD37 113 aa6.12□□□□□ -1.43
UBE2B-208ENST00000511807 HCG22E2RYF7 251 aa6.12□□□□□ -1.43
UBE2B-208ENST00000511807 CASC2Q6XLA1 102 aa6.11□□□□□ -1.43
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.11□□□□□ -1.43
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.1□□□□□ -1.43
UBE2B-208ENST00000511807 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.1□□□□□ -1.43
UBE2B-208ENST00000511807 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
UBE2B-208ENST00000511807 IMUPQ9GZP8 106 aa6.1□□□□□ -1.43
UBE2B-208ENST00000511807 PCOTHQ58A44 107 aa6.09□□□□□ -1.43
UBE2B-208ENST00000511807 MT-ATP8P03928 68 aa6.08□□□□□ -1.44
UBE2B-208ENST00000511807 Q75L30 129 aa6.08□□□□□ -1.44
UBE2B-208ENST00000511807 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.08□□□□□ -1.44
UBE2B-208ENST00000511807 A8MUU9 505 aa6.07□□□□□ -1.44
UBE2B-208ENST00000511807 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
UBE2B-208ENST00000511807 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.06□□□□□ -1.44
UBE2B-208ENST00000511807 A0A087WVE0 104 aa6.05□□□□□ -1.44
UBE2B-208ENST00000511807 NDUFS5O43920 106 aa6.05□□□□□ -1.44
UBE2B-208ENST00000511807 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.05□□□□□ -1.44
UBE2B-208ENST00000511807 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.05□□□□□ -1.44
UBE2B-208ENST00000511807 MT1HP80294 61 aa6.04□□□□□ -1.44
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.04□□□□□ -1.44
UBE2B-208ENST00000511807 LCE4AQ5TA78 99 aa6.03□□□□□ -1.44
UBE2B-208ENST00000511807 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.01□□□□□ -1.45
UBE2B-208ENST00000511807 SCGB1A1P11684 91 aa6□□□□□ -1.45
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.99□□□□□ -1.45
UBE2B-208ENST00000511807 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
UBE2B-208ENST00000511807 M0R2T5 61 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.96□□□□□ -1.46
UBE2B-208ENST00000511807 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2B-208ENST00000511807 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2B-208ENST00000511807 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.95□□□□□ -1.46
UBE2B-208ENST00000511807 UQCRQO14949 82 aa5.94□□□□□ -1.46
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
UBE2B-208ENST00000511807 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.94□□□□□ -1.46
UBE2B-208ENST00000511807 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.93□□□□□ -1.46
UBE2B-208ENST00000511807 Q5W150 140 aa5.91□□□□□ -1.46
UBE2B-208ENST00000511807 OCR1Q9BZK8 76 aa5.91□□□□□ -1.46
UBE2B-208ENST00000511807 ATOX1O00244 68 aa5.9□□□□□ -1.46
UBE2B-208ENST00000511807 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.89□□□□□ -1.47
UBE2B-208ENST00000511807 C5orf47Q569G3 176 aa5.88□□□□□ -1.47
UBE2B-208ENST00000511807 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.87□□□□□ -1.47
UBE2B-208ENST00000511807 SVIPQ8NHG7 77 aa5.87□□□□□ -1.47
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.86□□□□□ -1.47
UBE2B-208ENST00000511807 H0Y9P7 68 aa5.86□□□□□ -1.47
UBE2B-208ENST00000511807 MP68P56378 58 aa5.86□□□□□ -1.47
UBE2B-208ENST00000511807 SPINK7P58062 85 aa5.86□□□□□ -1.47
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