RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498534.5

CNOT4-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene CNOT4, Length 481 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP10-10P60014 251 aa6□□□□□ -1.45
CNOT4-211ENST00000498534 H3BQ85 93 aa5.99□□□□□ -1.45
CNOT4-211ENST00000498534 MTURNQ8N3F0 131 aa5.98□□□□□ -1.45
CNOT4-211ENST00000498534 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.98□□□□□ -1.45
CNOT4-211ENST00000498534 DNAL4O96015 105 aa5.97□□□□□ -1.45
CNOT4-211ENST00000498534 HRES1P13985 223 aa5.97□□□□□ -1.45
CNOT4-211ENST00000498534 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.97□□□□□ -1.45
CNOT4-211ENST00000498534 CEND1Q8N111 149 aa5.97□□□□□ -1.45
CNOT4-211ENST00000498534 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.96□□□□□ -1.46
CNOT4-211ENST00000498534 MT1FP04733 61 aa5.96□□□□□ -1.46
CNOT4-211ENST00000498534 S100A1P23297 94 aa5.96□□□□□ -1.46
CNOT4-211ENST00000498534 SPATA45Q537H7 98 aa5.96□□□□□ -1.46
CNOT4-211ENST00000498534 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.96□□□□□ -1.46
CNOT4-211ENST00000498534 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.96□□□□□ -1.46
CNOT4-211ENST00000498534 PAM16Q9Y3D7 125 aa5.96□□□□□ -1.46
CNOT4-211ENST00000498534 A0A1B0GV72 72 aa5.95□□□□□ -1.46
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.95□□□□□ -1.46
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.95□□□□□ -1.46
CNOT4-211ENST00000498534 TRIAP1O43715 76 aa5.94□□□□□ -1.46
CNOT4-211ENST00000498534 TRACP01848 142 aa5.94□□□□□ -1.46
CNOT4-211ENST00000498534 CCKP06307 115 aa5.94□□□□□ -1.46
CNOT4-211ENST00000498534 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.94□□□□□ -1.46
CNOT4-211ENST00000498534 VAMP8Q9BV40 100 aa5.93□□□□□ -1.46
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00846Q9NV44 126 aa5.93□□□□□ -1.46
CNOT4-211ENST00000498534 PSMB2P49721 201 aa5.92□□□□□ -1.46
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.92□□□□□ -1.46
CNOT4-211ENST00000498534 C8orf87E5RJ46 101 aa5.91□□□□□ -1.46
CNOT4-211ENST00000498534 COX6CP09669 75 aa5.91□□□□□ -1.46
CNOT4-211ENST00000498534 FXYD2P54710 66 aa5.9□□□□□ -1.46
CNOT4-211ENST00000498534 A0A1B0GVX0 72 aa5.89□□□□□ -1.47
CNOT4-211ENST00000498534 UBE2V1Q13404 147 aa5.88□□□□□ -1.47
CNOT4-211ENST00000498534 VPS25Q9BRG1 176 aa5.88□□□□□ -1.47
CNOT4-211ENST00000498534 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CNOT4-211ENST00000498534 SPINK7P58062 85 aa5.87□□□□□ -1.47
CNOT4-211ENST00000498534 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CNOT4-211ENST00000498534 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CNOT4-211ENST00000498534 J3KT08 172 aa5.85□□□□□ -1.47
CNOT4-211ENST00000498534 DSCR8Q96T75 97 aa5.85□□□□□ -1.47
CNOT4-211ENST00000498534 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CNOT4-211ENST00000498534 NDUFB1O75438 58 aa5.83□□□□□ -1.48
CNOT4-211ENST00000498534 HSD52Q0P140 79 aa5.83□□□□□ -1.48
CNOT4-211ENST00000498534 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.83□□□□□ -1.48
CNOT4-211ENST00000498534 A8MWP4 228 aa5.82□□□□□ -1.48
CNOT4-211ENST00000498534 K7ERJ3 54 aa5.82□□□□□ -1.48
CNOT4-211ENST00000498534 C9JAW5 83 aa5.81□□□□□ -1.48
CNOT4-211ENST00000498534 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.81□□□□□ -1.48
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.8□□□□□ -1.48
CNOT4-211ENST00000498534 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.79□□□□□ -1.48
CNOT4-211ENST00000498534 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CNOT4-211ENST00000498534 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.78□□□□□ -1.48
CNOT4-211ENST00000498534 Q6ZQT0 140 aa5.78□□□□□ -1.48
CNOT4-211ENST00000498534 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CNOT4-211ENST00000498534 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.75□□□□□ -1.49
CNOT4-211ENST00000498534 A0A1B0GW54 56 aa5.73□□□□□ -1.49
CNOT4-211ENST00000498534 Q6ZVQ6 151 aa5.72□□□□□ -1.49
CNOT4-211ENST00000498534 UQCR10Q9UDW1 63 aa5.72□□□□□ -1.49
CNOT4-211ENST00000498534 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.71□□□□□ -1.5
CNOT4-211ENST00000498534 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.71□□□□□ -1.5
CNOT4-211ENST00000498534 PDE6GP18545 87 aa5.7□□□□□ -1.5
CNOT4-211ENST00000498534 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.7□□□□□ -1.5
CNOT4-211ENST00000498534 PYY3Q5JQD4 70 aa5.7□□□□□ -1.5
CNOT4-211ENST00000498534 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.68□□□□□ -1.5
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.67□□□□□ -1.5
CNOT4-211ENST00000498534 PRR15Q8IV56 129 aa5.67□□□□□ -1.5
CNOT4-211ENST00000498534 ATXN8Q156A1 80 aa5.66□□□□□ -1.5
CNOT4-211ENST00000498534 NREPQ16612 68 aa5.66□□□□□ -1.5
CNOT4-211ENST00000498534 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CNOT4-211ENST00000498534 NDUFS5O43920 106 aa5.64□□□□□ -1.51
CNOT4-211ENST00000498534 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.64□□□□□ -1.51
CNOT4-211ENST00000498534 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.62□□□□□ -1.51
CNOT4-211ENST00000498534 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.61□□□□□ -1.51
CNOT4-211ENST00000498534 hDV103S1A0JD37 113 aa5.61□□□□□ -1.51
CNOT4-211ENST00000498534 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.6□□□□□ -1.51
CNOT4-211ENST00000498534 IGKV2-30P06310 120 aa5.6□□□□□ -1.51
CNOT4-211ENST00000498534 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
CNOT4-211ENST00000498534 M0R143 59 aa5.57□□□□□ -1.52
CNOT4-211ENST00000498534 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.57□□□□□ -1.52
CNOT4-211ENST00000498534 K7EQZ3 153 aa5.56□□□□□ -1.52
CNOT4-211ENST00000498534 Q5W150 140 aa5.53□□□□□ -1.52
CNOT4-211ENST00000498534 BPY2O14599 106 aa5.52□□□□□ -1.53
CNOT4-211ENST00000498534 C4orf26Q17RF5 130 aa5.52□□□□□ -1.53
CNOT4-211ENST00000498534 NEBP20929 6669 aa5.51□□□□□ -1.53
CNOT4-211ENST00000498534 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.51□□□□□ -1.53
CNOT4-211ENST00000498534 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.51□□□□□ -1.53
CNOT4-211ENST00000498534 A6NN06 94 aa5.5□□□□□ -1.53
CNOT4-211ENST00000498534 C5orf47Q569G3 176 aa5.49□□□□□ -1.53
CNOT4-211ENST00000498534 CASC2Q6XLA1 102 aa5.49□□□□□ -1.53
CNOT4-211ENST00000498534 HCG22E2RYF7 251 aa5.48□□□□□ -1.53
CNOT4-211ENST00000498534 CXCL6P80162 114 aa5.47□□□□□ -1.53
CNOT4-211ENST00000498534 Q5VV11 94 aa5.46□□□□□ -1.54
CNOT4-211ENST00000498534 CSAG1Q6PB30 78 aa5.46□□□□□ -1.54
CNOT4-211ENST00000498534 TSTD3H0UI37 97 aa5.45□□□□□ -1.54
CNOT4-211ENST00000498534 H3BT86 120 aa5.45□□□□□ -1.54
CNOT4-211ENST00000498534 Q8N9L7 120 aa5.44□□□□□ -1.54
CNOT4-211ENST00000498534 S4R3F8 94 aa5.43□□□□□ -1.54
CNOT4-211ENST00000498534 MT1BP07438 61 aa5.42□□□□□ -1.54
CNOT4-211ENST00000498534 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.41□□□□□ -1.54
CNOT4-211ENST00000498534 BATFQ16520 125 aa5.41□□□□□ -1.54
CNOT4-211ENST00000498534 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.41□□□□□ -1.54
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.4□□□□□ -1.54
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