RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489048.1

NEB-215, Transcript of nebulin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEB, Length 2,738 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEB-215ENST00000489048 FAM229AH3BQW9 127 aa6.52□□□□□ -1.37
NEB-215ENST00000489048 NDUFS5O43920 106 aa6.52□□□□□ -1.37
NEB-215ENST00000489048 HRES1P13985 223 aa6.52□□□□□ -1.37
NEB-215ENST00000489048 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.52□□□□□ -1.37
NEB-215ENST00000489048 A6NED7 52 aa6.52□□□□□ -1.37
NEB-215ENST00000489048 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.52□□□□□ -1.37
NEB-215ENST00000489048 ZNF861PO60384 105 aa6.51□□□□□ -1.37
NEB-215ENST00000489048 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.51□□□□□ -1.37
NEB-215ENST00000489048 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.51□□□□□ -1.37
NEB-215ENST00000489048 A0A087WTM6 91 aa6.5□□□□□ -1.37
NEB-215ENST00000489048 A0A087X002 238 aa6.5□□□□□ -1.37
NEB-215ENST00000489048 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.5□□□□□ -1.37
NEB-215ENST00000489048 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.5□□□□□ -1.37
NEB-215ENST00000489048 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.49□□□□□ -1.37
NEB-215ENST00000489048 DNHD1Q96M86 4753 aa6.49□□□□□ -1.37
NEB-215ENST00000489048 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.49□□□□□ -1.37
NEB-215ENST00000489048 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.49□□□□□ -1.37
NEB-215ENST00000489048 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.48□□□□□ -1.37
NEB-215ENST00000489048 COL6A5A8TX70 2615 aa6.47□□□□□ -1.37
NEB-215ENST00000489048 A6NN06 94 aa6.47□□□□□ -1.37
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NEB-215ENST00000489048 COL7A1Q02388 2944 aa6.46□□□□□ -1.38
NEB-215ENST00000489048 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.46□□□□□ -1.38
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NEB-215ENST00000489048 LCE2CQ5TA81 110 aa6.45□□□□□ -1.38
NEB-215ENST00000489048 Q5W150 140 aa6.45□□□□□ -1.38
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NEB-215ENST00000489048 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
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NEB-215ENST00000489048 IGLV7-43P04211 117 aa6.41□□□□□ -1.38
NEB-215ENST00000489048 ACYP2P14621 99 aa6.4□□□□□ -1.38
NEB-215ENST00000489048 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.4□□□□□ -1.38
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NEB-215ENST00000489048 DNAH2Q9P225 4427 aa6.38□□□□□ -1.39
NEB-215ENST00000489048 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.38□□□□□ -1.39
NEB-215ENST00000489048 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.36□□□□□ -1.39
NEB-215ENST00000489048 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.36□□□□□ -1.39
NEB-215ENST00000489048 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.35□□□□□ -1.39
NEB-215ENST00000489048 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.34□□□□□ -1.39
NEB-215ENST00000489048 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.34□□□□□ -1.4
NEB-215ENST00000489048 KMT2AQ03164 3969 aa6.33□□□□□ -1.4
NEB-215ENST00000489048 LINC00313P59037 77 aa6.33□□□□□ -1.4
NEB-215ENST00000489048 IGKV2-30P06310 120 aa6.33□□□□□ -1.4
NEB-215ENST00000489048 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.3□□□□□ -1.4
NEB-215ENST00000489048 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.3□□□□□ -1.4
NEB-215ENST00000489048 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.29□□□□□ -1.4
NEB-215ENST00000489048 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.29□□□□□ -1.4
NEB-215ENST00000489048 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.27□□□□□ -1.41
NEB-215ENST00000489048 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.27□□□□□ -1.41
NEB-215ENST00000489048 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
NEB-215ENST00000489048 A0A1B0GU69 56 aa6.25□□□□□ -1.41
NEB-215ENST00000489048 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.25□□□□□ -1.41
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NEB-215ENST00000489048 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.19□□□□□ -1.42
NEB-215ENST00000489048 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.18□□□□□ -1.42
NEB-215ENST00000489048 UQCR11O14957 56 aa6.18□□□□□ -1.42
NEB-215ENST00000489048 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.17□□□□□ -1.42
NEB-215ENST00000489048 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.15□□□□□ -1.42
NEB-215ENST00000489048 LY6G6CO95867 125 aa6.14□□□□□ -1.43
NEB-215ENST00000489048 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.13□□□□□ -1.43
NEB-215ENST00000489048 KRTAP10-1P60331 282 aa6.12□□□□□ -1.43
NEB-215ENST00000489048 PKD1P98161 4303 aa6.11□□□□□ -1.43
NEB-215ENST00000489048 SPINK1P00995 79 aa6.11□□□□□ -1.43
NEB-215ENST00000489048 PRAC1Q96KF2 57 aa6.1□□□□□ -1.43
NEB-215ENST00000489048 H3BS24 57 aa6.09□□□□□ -1.43
NEB-215ENST00000489048 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.08□□□□□ -1.44
NEB-215ENST00000489048 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.08□□□□□ -1.44
NEB-215ENST00000489048 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.08□□□□□ -1.44
NEB-215ENST00000489048 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
NEB-215ENST00000489048 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.07□□□□□ -1.44
NEB-215ENST00000489048 TGP01266 2768 aa6.07□□□□□ -1.44
NEB-215ENST00000489048 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.06□□□□□ -1.44
NEB-215ENST00000489048 RYR3Q15413 4870 aa6.05□□□□□ -1.44
NEB-215ENST00000489048 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
NEB-215ENST00000489048 Q8N1X5 172 aa6.01□□□□□ -1.45
NEB-215ENST00000489048 LINC01554Q52M75 96 aa6□□□□□ -1.45
NEB-215ENST00000489048 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.99□□□□□ -1.45
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NEB-215ENST00000489048 HYDINQ4G0P3 5121 aa5.97□□□□□ -1.45
NEB-215ENST00000489048 A8MUU9 505 aa5.97□□□□□ -1.45
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NEB-215ENST00000489048 HERC2O95714 4834 aa5.95□□□□□ -1.46
NEB-215ENST00000489048 H0YAA0 97 aa5.94□□□□□ -1.46
NEB-215ENST00000489048 CSAG1Q6PB30 78 aa5.93□□□□□ -1.46
NEB-215ENST00000489048 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.92□□□□□ -1.46
NEB-215ENST00000489048 A0A1B0GU33 70 aa5.88□□□□□ -1.47
NEB-215ENST00000489048 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.88□□□□□ -1.47
NEB-215ENST00000489048 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
NEB-215ENST00000489048 C9orf92A6NGG3 77 aa5.86□□□□□ -1.47
NEB-215ENST00000489048 PKHD1P08F94 4074 aa5.84□□□□□ -1.47
NEB-215ENST00000489048 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
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