RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP-1.75□□□□□ -2.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 TOMM20LQ6UXN7 152 aa-1.75□□□□□ -2.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPRMQ9NS64 109 aa-1.75□□□□□ -2.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 IQCF6A8MYZ5 107 aa-1.76□□□□□ -2.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP-1.76□□□□□ -2.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 IFI6P09912 130 aa-1.76□□□□□ -2.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-1.76□□□□□ -2.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-1.76□□□□□ -2.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 TOMM7Q9P0U1 55 aa-1.76□□□□□ -2.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 GCC2Q8IWJ2 1684 aa-1.77□□□□□ -2.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa-1.77□□□□□ -2.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMIM24O75264 130 aa-1.77□□□□□ -2.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 S100A8P05109 93 aa-1.77□□□□□ -2.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGLC6P0CF74 106 aa-1.77□□□□□ -2.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 COX7BP24311 80 aa-1.77□□□□□ -2.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa-1.77□□□□□ -2.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 SERP2Q8N6R1 65 aa-1.77□□□□□ -2.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-1.77□□□□□ -2.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC00470Q9BZP3 86 aa-1.77□□□□□ -2.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP-1.77□□□□□ -2.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 H3BUT2 72 aa-1.78□□□□□ -2.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 NDUFB1O75438 58 aa-1.78□□□□□ -2.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 DPM2O94777 84 aa-1.78□□□□□ -2.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP-1.78□□□□□ -2.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP-1.78□□□□□ -2.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP-1.78□□□□□ -2.69
CACNA2D1-211ENST00000486539 hADV29S1A0JD25 119 aa-1.79□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP-1.79□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 S100A12P80511 92 aa-1.79□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 SARNPP82979 210 aaKnown RBP-1.79□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 COX17Q14061 63 aa-1.79□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 PLGLAQ15195 96 aa-1.79□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLLU1Q5K131 121 aa-1.79□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP-1.8□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 TSTD3H0UI37 97 aa-1.8□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP-1.8□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 CKS1BP61024 79 aa-1.8□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 CHMP6Q96FZ7 201 aa-1.8□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP-1.8□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 BANF2Q9H503 90 aa-1.8□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP-1.8□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC00312Q9Y6C7 94 aa-1.8□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 R4GMQ9 66 aa-1.8□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARPC5O15511 151 aa-1.81□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 MT-ND4LP03901 98 aa-1.81□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 PAEPP09466 180 aa-1.81□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 FCER1GP30273 86 aa-1.81□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM128Q5BJH2 165 aa-1.81□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 MGST2Q99735 147 aa-1.81□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 CALML5Q9NZT1 146 aa-1.81□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 ABRACLQ9P1F3 81 aa-1.81□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 GNG10P50151 68 aa-1.82□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 S100A10P60903 97 aa-1.82□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 UBE2G1P62253 170 aa-1.82□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM244Q5VVB8 128 aa-1.82□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 BAGE2Q86Y30 109 aa-1.82□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 TCTE3Q8IZS6 198 aa-1.82□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 SERP1Q9Y6X1 66 aa-1.82□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 NCS1P62166 190 aa-1.83□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 Q56UQ5 140 aa-1.83□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRIQKQ629K1 86 aa-1.83□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 C1orf54Q8WWF1 131 aa-1.83□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 CGREF1Q99674 301 aa-1.83□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 K7EIM0 57 aa-1.84□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 TSPAN19P0C672 248 aa-1.84□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM170BQ5T4T1 132 aa-1.84□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM35BQ8NCS4 154 aa-1.84□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 SAR1AQ9NR31 198 aa-1.84□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 COPZ2Q9P299 210 aa-1.84□□□□□ -2.7
CACNA2D1-211ENST00000486539 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa-1.85□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa-1.85□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa-1.85□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 A6NIN4 97 aa-1.85□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 SNAPC5O75971 98 aa-1.85□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa-1.85□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP-1.85□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 LCN9Q8WX39 176 aa-1.85□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 PCBD2Q9H0N5 130 aa-1.85□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 TPT1P8Q9HAU6 139 aa-1.85□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 LENEPQ9Y5L5 61 aa-1.85□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa-1.86□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 GID8Q9NWU2 228 aa-1.86□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGLC7A0M8Q6 106 aa-1.87□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa-1.87□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 PDCD5O14737 125 aa-1.87□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 GNG7O60262 68 aa-1.87□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMIM21Q3B7S5 101 aa-1.87□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 C10orf113Q5VZT2 155 aa-1.87□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 PSENENQ9NZ42 101 aa-1.87□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 UQCR11O14957 56 aa-1.88□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 S100A7L2Q5SY68 101 aa-1.88□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 PYDC1Q8WXC3 89 aa-1.88□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARL11Q969Q4 196 aa-1.88□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 NMES1Q9C002 83 aa-1.88□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 HIGD1AQ9Y241 93 aa-1.88□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 CTAGE3PQ8IX95 158 aa-1.89□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 SNHG12Q9BXW3 62 aa-1.89□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 V9GYH0 126 aa-1.89□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 E5RI56 91 aa-1.9□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 LEPROTL1O95214 131 aa-1.9□□□□□ -2.71
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