RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486204.5

SSR4-211, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 3

Gene SSR4, Length 658 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-211ENST00000486204 MT1HP80294 61 aa6.91□□□□□ -1.3
SSR4-211ENST00000486204 SIGMAR1Q99720 223 aa6.91□□□□□ -1.3
SSR4-211ENST00000486204 PDE6GP18545 87 aa6.9□□□□□ -1.3
SSR4-211ENST00000486204 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.9□□□□□ -1.3
SSR4-211ENST00000486204 PCOTHQ58A44 107 aa6.9□□□□□ -1.3
SSR4-211ENST00000486204 PRO0461Q9UI25 63 aa6.9□□□□□ -1.3
SSR4-211ENST00000486204 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.89□□□□□ -1.31
SSR4-211ENST00000486204 A0A1B0GW54 56 aa6.88□□□□□ -1.31
SSR4-211ENST00000486204 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SSR4-211ENST00000486204 DSCR10P59022 87 aa6.86□□□□□ -1.31
SSR4-211ENST00000486204 Q75L30 129 aa6.86□□□□□ -1.31
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.85□□□□□ -1.31
SSR4-211ENST00000486204 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.85□□□□□ -1.31
SSR4-211ENST00000486204 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.84□□□□□ -1.31
SSR4-211ENST00000486204 A8MUU9 505 aa6.83□□□□□ -1.32
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.83□□□□□ -1.32
SSR4-211ENST00000486204 J3KT08 172 aa6.82□□□□□ -1.32
SSR4-211ENST00000486204 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.81□□□□□ -1.32
SSR4-211ENST00000486204 A0A1B0GVX0 72 aa6.81□□□□□ -1.32
SSR4-211ENST00000486204 LINC00313P59037 77 aa6.81□□□□□ -1.32
SSR4-211ENST00000486204 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.81□□□□□ -1.32
SSR4-211ENST00000486204 C8orf87E5RJ46 101 aa6.78□□□□□ -1.32
SSR4-211ENST00000486204 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.76□□□□□ -1.33
SSR4-211ENST00000486204 A8MWP4 228 aa6.76□□□□□ -1.33
SSR4-211ENST00000486204 NREPQ16612 68 aa6.76□□□□□ -1.33
SSR4-211ENST00000486204 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.76□□□□□ -1.33
SSR4-211ENST00000486204 F8W1H4 67 aa6.75□□□□□ -1.33
SSR4-211ENST00000486204 M0R2T5 61 aa6.75□□□□□ -1.33
SSR4-211ENST00000486204 NDUFB1O75438 58 aa6.73□□□□□ -1.33
SSR4-211ENST00000486204 Q6ZVQ6 151 aa6.73□□□□□ -1.33
SSR4-211ENST00000486204 ETDBQ3ZM63 59 aa6.72□□□□□ -1.33
SSR4-211ENST00000486204 SSPOA2VEC9 5147 aa6.71□□□□□ -1.33
SSR4-211ENST00000486204 PRR15Q8IV56 129 aa6.71□□□□□ -1.34
SSR4-211ENST00000486204 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.71□□□□□ -1.34
SSR4-211ENST00000486204 LINC00846Q9NV44 126 aa6.7□□□□□ -1.34
SSR4-211ENST00000486204 K7EQZ3 153 aa6.69□□□□□ -1.34
SSR4-211ENST00000486204 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SSR4-211ENST00000486204 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.68□□□□□ -1.34
SSR4-211ENST00000486204 USH2AO75445 5202 aa6.67□□□□□ -1.34
SSR4-211ENST00000486204 BPY2O14599 106 aa6.67□□□□□ -1.34
SSR4-211ENST00000486204 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SSR4-211ENST00000486204 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SSR4-211ENST00000486204 A0A1B0GV90 55 aa6.64□□□□□ -1.35
SSR4-211ENST00000486204 UBL5Q9BZL1 73 aa6.64□□□□□ -1.35
SSR4-211ENST00000486204 Q8N9L7 120 aa6.63□□□□□ -1.35
SSR4-211ENST00000486204 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.63□□□□□ -1.35
SSR4-211ENST00000486204 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SSR4-211ENST00000486204 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SSR4-211ENST00000486204 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SSR4-211ENST00000486204 hDV103S1A0JD37 113 aa6.6□□□□□ -1.35
SSR4-211ENST00000486204 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SSR4-211ENST00000486204 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.58□□□□□ -1.36
SSR4-211ENST00000486204 HRES1P13985 223 aa6.56□□□□□ -1.36
SSR4-211ENST00000486204 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.56□□□□□ -1.36
SSR4-211ENST00000486204 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.55□□□□□ -1.36
SSR4-211ENST00000486204 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.55□□□□□ -1.36
SSR4-211ENST00000486204 CXCL6P80162 114 aa6.54□□□□□ -1.36
SSR4-211ENST00000486204 CASC2Q6XLA1 102 aa6.54□□□□□ -1.36
SSR4-211ENST00000486204 ACYP1P07311 99 aa6.52□□□□□ -1.37
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.52□□□□□ -1.37
SSR4-211ENST00000486204 HCG22E2RYF7 251 aa6.51□□□□□ -1.37
SSR4-211ENST00000486204 NDUFS5O43920 106 aa6.51□□□□□ -1.37
SSR4-211ENST00000486204 SPINK7P58062 85 aa6.51□□□□□ -1.37
SSR4-211ENST00000486204 Q5W150 140 aa6.49□□□□□ -1.37
SSR4-211ENST00000486204 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.45□□□□□ -1.38
SSR4-211ENST00000486204 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.44□□□□□ -1.38
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.43□□□□□ -1.38
SSR4-211ENST00000486204 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.42□□□□□ -1.38
SSR4-211ENST00000486204 FAM236CP0DP71 79 aa6.42□□□□□ -1.38
SSR4-211ENST00000486204 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.39□□□□□ -1.39
SSR4-211ENST00000486204 LINC00643Q86TS7 51 aa6.39□□□□□ -1.39
SSR4-211ENST00000486204 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.38□□□□□ -1.39
SSR4-211ENST00000486204 IGKV2-30P06310 120 aa6.38□□□□□ -1.39
SSR4-211ENST00000486204 LCE2BO14633 110 aa6.36□□□□□ -1.39
SSR4-211ENST00000486204 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.36□□□□□ -1.39
SSR4-211ENST00000486204 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.35□□□□□ -1.39
SSR4-211ENST00000486204 A0A087WVE0 104 aa6.33□□□□□ -1.4
SSR4-211ENST00000486204 J3QR89 54 aa6.33□□□□□ -1.4
SSR4-211ENST00000486204 NEBP20929 6669 aa6.3□□□□□ -1.4
SSR4-211ENST00000486204 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.27□□□□□ -1.41
SSR4-211ENST00000486204 MT2AP02795 61 aa6.27□□□□□ -1.41
SSR4-211ENST00000486204 C4orf26Q17RF5 130 aa6.27□□□□□ -1.41
SSR4-211ENST00000486204 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.25□□□□□ -1.41
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.25□□□□□ -1.41
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.24□□□□□ -1.41
SSR4-211ENST00000486204 UQCRQO14949 82 aa6.23□□□□□ -1.41
SSR4-211ENST00000486204 MT1FP04733 61 aa6.23□□□□□ -1.41
SSR4-211ENST00000486204 K7ERU9 68 aa6.22□□□□□ -1.41
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.22□□□□□ -1.41
SSR4-211ENST00000486204 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.22□□□□□ -1.41
SSR4-211ENST00000486204 OCR1Q9BZK8 76 aa6.21□□□□□ -1.42
SSR4-211ENST00000486204 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.2□□□□□ -1.42
SSR4-211ENST00000486204 H0Y9P7 68 aa6.2□□□□□ -1.42
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP10-10P60014 251 aa6.2□□□□□ -1.42
SSR4-211ENST00000486204 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.18□□□□□ -1.42
SSR4-211ENST00000486204 ATOX1O00244 68 aa6.17□□□□□ -1.42
SSR4-211ENST00000486204 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.17□□□□□ -1.42
SSR4-211ENST00000486204 MT-ATP8P03928 68 aa6.16□□□□□ -1.42
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