RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483973.5

TRAPPC10-210, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 3

Gene TRAPPC10, Length 579 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-210ENST00000483973 CCKP06307 115 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC10-210ENST00000483973 KRTAP10-10P60014 251 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC10-210ENST00000483973 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC10-210ENST00000483973 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.67□□□□□ -1.34
TRAPPC10-210ENST00000483973 A0A1B0GV72 72 aa6.66□□□□□ -1.34
TRAPPC10-210ENST00000483973 BATFQ16520 125 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC10-210ENST00000483973 DSCR8Q96T75 97 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC10-210ENST00000483973 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.64□□□□□ -1.35
TRAPPC10-210ENST00000483973 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC10-210ENST00000483973 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TRAPPC10-210ENST00000483973 C9orf118A6NHY6 69 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC10-210ENST00000483973 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC10-210ENST00000483973 DSCR10P59022 87 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC10-210ENST00000483973 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.62□□□□□ -1.35
TRAPPC10-210ENST00000483973 C9JAW5 83 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC10-210ENST00000483973 TAX1BP3O14907 124 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC10-210ENST00000483973 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC10-210ENST00000483973 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC10-210ENST00000483973 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC10-210ENST00000483973 A0A1B0GW54 56 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC10-210ENST00000483973 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC10-210ENST00000483973 IGKV4-1P06312 121 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC10-210ENST00000483973 Q6ZQT0 140 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC10-210ENST00000483973 SIGMAR1Q99720 223 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC10-210ENST00000483973 LINC00846Q9NV44 126 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC10-210ENST00000483973 A0A1W2PPM0 123 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC10-210ENST00000483973 PDE6GP18545 87 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC10-210ENST00000483973 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC10-210ENST00000483973 VPS25Q9BRG1 176 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC10-210ENST00000483973 H3BT86 120 aa6.55□□□□□ -1.36
TRAPPC10-210ENST00000483973 HRES1P13985 223 aa6.54□□□□□ -1.36
TRAPPC10-210ENST00000483973 LINC00313P59037 77 aa6.54□□□□□ -1.36
TRAPPC10-210ENST00000483973 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.54□□□□□ -1.36
TRAPPC10-210ENST00000483973 J3KT08 172 aa6.53□□□□□ -1.36
TRAPPC10-210ENST00000483973 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.53□□□□□ -1.36
TRAPPC10-210ENST00000483973 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.53□□□□□ -1.36
TRAPPC10-210ENST00000483973 A0A1B0GVX0 72 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC10-210ENST00000483973 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.51□□□□□ -1.37
TRAPPC10-210ENST00000483973 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC10-210ENST00000483973 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC10-210ENST00000483973 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC10-210ENST00000483973 C8orf87E5RJ46 101 aa6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC10-210ENST00000483973 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC10-210ENST00000483973 MTURNQ8N3F0 131 aa6.47□□□□□ -1.37
TRAPPC10-210ENST00000483973 A8MWP4 228 aa6.44□□□□□ -1.38
TRAPPC10-210ENST00000483973 NDUFB1O75438 58 aa6.44□□□□□ -1.38
TRAPPC10-210ENST00000483973 NREPQ16612 68 aa6.42□□□□□ -1.38
TRAPPC10-210ENST00000483973 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.42□□□□□ -1.38
TRAPPC10-210ENST00000483973 PRO0461Q9UI25 63 aa6.42□□□□□ -1.38
TRAPPC10-210ENST00000483973 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.41□□□□□ -1.38
TRAPPC10-210ENST00000483973 K7EP34 96 aa6.41□□□□□ -1.38
TRAPPC10-210ENST00000483973 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
TRAPPC10-210ENST00000483973 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.4□□□□□ -1.38
TRAPPC10-210ENST00000483973 PRR15Q8IV56 129 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAPPC10-210ENST00000483973 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC10-210ENST00000483973 SPINK7P58062 85 aa6.36□□□□□ -1.39
TRAPPC10-210ENST00000483973 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TRAPPC10-210ENST00000483973 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.34□□□□□ -1.39
TRAPPC10-210ENST00000483973 Q6ZVQ6 151 aa6.34□□□□□ -1.39
TRAPPC10-210ENST00000483973 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.34□□□□□ -1.39
TRAPPC10-210ENST00000483973 K7EQZ3 153 aa6.33□□□□□ -1.4
TRAPPC10-210ENST00000483973 BPY2O14599 106 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC10-210ENST00000483973 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.32□□□□□ -1.4
TRAPPC10-210ENST00000483973 F8W1H4 67 aa6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC10-210ENST00000483973 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC10-210ENST00000483973 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC10-210ENST00000483973 hDV103S1A0JD37 113 aa6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC10-210ENST00000483973 UBL5Q9BZL1 73 aa6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC10-210ENST00000483973 ETDBQ3ZM63 59 aa6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC10-210ENST00000483973 NEBP20929 6669 aa6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC10-210ENST00000483973 Q8N9L7 120 aa6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC10-210ENST00000483973 CASC2Q6XLA1 102 aa6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC10-210ENST00000483973 NDUFS5O43920 106 aa6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC10-210ENST00000483973 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.18□□□□□ -1.42
TRAPPC10-210ENST00000483973 CXCL6P80162 114 aa6.17□□□□□ -1.42
TRAPPC10-210ENST00000483973 HCG22E2RYF7 251 aa6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC10-210ENST00000483973 Q5W150 140 aa6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC10-210ENST00000483973 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC10-210ENST00000483973 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC10-210ENST00000483973 A6NN06 94 aa6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC10-210ENST00000483973 ACYP1P07311 99 aa6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC10-210ENST00000483973 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC10-210ENST00000483973 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC10-210ENST00000483973 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC10-210ENST00000483973 IGKV2-30P06310 120 aa6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC10-210ENST00000483973 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC10-210ENST00000483973 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.06□□□□□ -1.44
TRAPPC10-210ENST00000483973 A0A1B0GV90 55 aa6.05□□□□□ -1.44
TRAPPC10-210ENST00000483973 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC10-210ENST00000483973 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.04□□□□□ -1.44
TRAPPC10-210ENST00000483973 MT1BP07438 61 aa6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC10-210ENST00000483973 Q5VV11 94 aa6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC10-210ENST00000483973 C5orf47Q569G3 176 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC10-210ENST00000483973 C4orf26Q17RF5 130 aa5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC10-210ENST00000483973 LINC00643Q86TS7 51 aa5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC10-210ENST00000483973 SVIPQ8NHG7 77 aa5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC10-210ENST00000483973 KRTAP5-9P26371 169 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC10-210ENST00000483973 KRTAP10-5P60370 271 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC10-210ENST00000483973 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC10-210ENST00000483973 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
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