RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 Q8N1X5 172 aa8.25□□□□□ -1.09
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
NISCH-207ENST00000479054 CSAG1Q6PB30 78 aa8.22□□□□□ -1.09
NISCH-207ENST00000479054 HRES1P13985 223 aa8.22□□□□□ -1.09
NISCH-207ENST00000479054 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.19□□□□□ -1.1
NISCH-207ENST00000479054 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa8.18□□□□□ -1.1
NISCH-207ENST00000479054 PANO1I0J062 215 aa8.18□□□□□ -1.1
NISCH-207ENST00000479054 LINC00483Q53H64 154 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-207ENST00000479054 CSMD1Q96PZ7 3565 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-207ENST00000479054 TENM4Q6N022 2769 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-207ENST00000479054 SVEP1Q4LDE5 3571 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-207ENST00000479054 S4R3F8 94 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-207ENST00000479054 A0A0D9SG42 100 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-207ENST00000479054 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-207ENST00000479054 A0A1B0GU33 70 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-207ENST00000479054 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-207ENST00000479054 A6NN06 94 aa8.07□□□□□ -1.12
NISCH-207ENST00000479054 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.04□□□□□ -1.12
NISCH-207ENST00000479054 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.04□□□□□ -1.12
NISCH-207ENST00000479054 Q5W150 140 aa8.01□□□□□ -1.13
NISCH-207ENST00000479054 DMAC1Q96GE9 116 aa7.99□□□□□ -1.13
NISCH-207ENST00000479054 BSNQ9UPA5 3926 aa7.98□□□□□ -1.13
NISCH-207ENST00000479054 PDZD2O15018 2839 aa7.98□□□□□ -1.13
NISCH-207ENST00000479054 LUZP6Q538Z0 58 aa7.97□□□□□ -1.13
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
NISCH-207ENST00000479054 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa7.95□□□□□ -1.14
NISCH-207ENST00000479054 A8MU10 97 aa7.94□□□□□ -1.14
NISCH-207ENST00000479054 R4GN34 69 aa7.93□□□□□ -1.14
NISCH-207ENST00000479054 A0A087X002 238 aa7.92□□□□□ -1.14
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.9□□□□□ -1.14
NISCH-207ENST00000479054 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.89□□□□□ -1.15
NISCH-207ENST00000479054 TENM3Q9P273 2699 aa7.88□□□□□ -1.15
NISCH-207ENST00000479054 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.88□□□□□ -1.15
NISCH-207ENST00000479054 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.85□□□□□ -1.15
NISCH-207ENST00000479054 ROMO1P60602 79 aa7.82□□□□□ -1.16
NISCH-207ENST00000479054 A0A0A0MQY5 61 aa7.82□□□□□ -1.16
NISCH-207ENST00000479054 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.82□□□□□ -1.16
NISCH-207ENST00000479054 OTOGQ6ZRI0 2925 aa7.82□□□□□ -1.16
NISCH-207ENST00000479054 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
NISCH-207ENST00000479054 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.79□□□□□ -1.16
NISCH-207ENST00000479054 VWFP04275 2813 aa7.77□□□□□ -1.16
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.77□□□□□ -1.17
NISCH-207ENST00000479054 PLAC4Q8WY50 150 aa7.76□□□□□ -1.17
NISCH-207ENST00000479054 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.76□□□□□ -1.17
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.75□□□□□ -1.17
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.74□□□□□ -1.17
NISCH-207ENST00000479054 ZFHX3Q15911 3703 aa7.74□□□□□ -1.17
NISCH-207ENST00000479054 CUBNO60494 3623 aa7.74□□□□□ -1.17
NISCH-207ENST00000479054 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
NISCH-207ENST00000479054 VPS13CQ709C8 3753 aa7.74□□□□□ -1.17
NISCH-207ENST00000479054 M0QZ58 72 aa7.73□□□□□ -1.17
NISCH-207ENST00000479054 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
NISCH-207ENST00000479054 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.69□□□□□ -1.18
NISCH-207ENST00000479054 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
NISCH-207ENST00000479054 NDUFAF8A1L188 74 aa7.58□□□□□ -1.2
NISCH-207ENST00000479054 TENM2Q9NT68 2774 aa7.58□□□□□ -1.2
NISCH-207ENST00000479054 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.57□□□□□ -1.2
NISCH-207ENST00000479054 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.55□□□□□ -1.2
NISCH-207ENST00000479054 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
NISCH-207ENST00000479054 TGP01266 2768 aa7.54□□□□□ -1.2
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.51□□□□□ -1.21
NISCH-207ENST00000479054 A8MUU9 505 aa7.5□□□□□ -1.21
NISCH-207ENST00000479054 TPRXLQ17RH7 258 aa7.43□□□□□ -1.22
NISCH-207ENST00000479054 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.41□□□□□ -1.22
NISCH-207ENST00000479054 XP32Q5T750 250 aa7.37□□□□□ -1.23
NISCH-207ENST00000479054 A0A1B0GVY2 172 aa7.3□□□□□ -1.24
NISCH-207ENST00000479054 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
NISCH-207ENST00000479054 TNP1P09430 55 aa7.2□□□□□ -1.26
NISCH-207ENST00000479054 H0YAA0 97 aa7.19□□□□□ -1.26
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.19□□□□□ -1.26
NISCH-207ENST00000479054 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.17□□□□□ -1.26
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP10-8P60410 259 aa7.17□□□□□ -1.26
NISCH-207ENST00000479054 AKAP9Q99996 3911 aa7.15□□□□□ -1.27
NISCH-207ENST00000479054 FBN3Q75N90 2809 aa7.14□□□□□ -1.27
NISCH-207ENST00000479054 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.11□□□□□ -1.27
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP10-10P60014 251 aa7.08□□□□□ -1.28
NISCH-207ENST00000479054 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.07□□□□□ -1.28
NISCH-207ENST00000479054 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
NISCH-207ENST00000479054 P0C880 135 aa7.02□□□□□ -1.29
NISCH-207ENST00000479054 PP632Q6XCG6 107 aa6.98□□□□□ -1.29
NISCH-207ENST00000479054 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
NISCH-207ENST00000479054 COL7A1Q02388 2944 aa6.92□□□□□ -1.3
NISCH-207ENST00000479054 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.75□□□□□ -1.33
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.73□□□□□ -1.33
NISCH-207ENST00000479054 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.69□□□□□ -1.34
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP12-2P59991 146 aa6.63□□□□□ -1.35
NISCH-207ENST00000479054 MT1HL1P0DM35 61 aa6.62□□□□□ -1.35
NISCH-207ENST00000479054 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NISCH-207ENST00000479054 ANK2Q01484 3957 aa6.54□□□□□ -1.36
NISCH-207ENST00000479054 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.53□□□□□ -1.36
NISCH-207ENST00000479054 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.51□□□□□ -1.37
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP12-1P59990 96 aa6.5□□□□□ -1.37
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.49□□□□□ -1.37
NISCH-207ENST00000479054 DNHD1Q96M86 4753 aa6.49□□□□□ -1.37
NISCH-207ENST00000479054 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.47□□□□□ -1.37
NISCH-207ENST00000479054 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
NISCH-207ENST00000479054 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.45□□□□□ -1.38
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