RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 MOBPQ13875 183 aa10.71□□□□□ -0.69
ATG4B-217ENST00000475693 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa10.71□□□□□ -0.69
ATG4B-217ENST00000475693 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa10.69□□□□□ -0.7
ATG4B-217ENST00000475693 Q8N1X5 172 aa10.69□□□□□ -0.7
ATG4B-217ENST00000475693 IGFL1Q6UW32 110 aa10.69□□□□□ -0.7
ATG4B-217ENST00000475693 PRR26Q8N8Z3 221 aa10.66□□□□□ -0.7
ATG4B-217ENST00000475693 HERC2O95714 4834 aa10.64□□□□□ -0.71
ATG4B-217ENST00000475693 ABCA13Q86UQ4 5058 aa10.64□□□□□ -0.71
ATG4B-217ENST00000475693 DSCR10P59022 87 aa10.64□□□□□ -0.71
ATG4B-217ENST00000475693 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-217ENST00000475693 FAT3Q8TDW7 4589 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-217ENST00000475693 V9GYY9 64 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-217ENST00000475693 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
ATG4B-217ENST00000475693 FAM229BQ4G0N7 80 aa10.58□□□□□ -0.72
ATG4B-217ENST00000475693 TNXBP22105 4242 aa10.58□□□□□ -0.72
ATG4B-217ENST00000475693 K7EQZ3 153 aa10.57□□□□□ -0.72
ATG4B-217ENST00000475693 C1orf195Q5TG92 126 aa10.56□□□□□ -0.72
ATG4B-217ENST00000475693 HCG22E2RYF7 251 aa10.56□□□□□ -0.72
ATG4B-217ENST00000475693 TYMSOSQ8TAI1 123 aa10.55□□□□□ -0.72
ATG4B-217ENST00000475693 hDV103S1A0JD37 113 aa10.53□□□□□ -0.72
ATG4B-217ENST00000475693 A0A087WSZ3 146 aa10.52□□□□□ -0.73
ATG4B-217ENST00000475693 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-217ENST00000475693 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-217ENST00000475693 NDUFB1O75438 58 aa10.5□□□□□ -0.73
ATG4B-217ENST00000475693 BRK1Q8WUW1 75 aa10.48□□□□□ -0.73
ATG4B-217ENST00000475693 DEFB116Q30KQ4 102 aa10.46□□□□□ -0.73
ATG4B-217ENST00000475693 MPLKIPQ8TAP9 179 aa10.46□□□□□ -0.74
ATG4B-217ENST00000475693 Q1T7F1 81 aa10.45□□□□□ -0.74
ATG4B-217ENST00000475693 C1orf64Q8NEQ6 169 aa10.45□□□□□ -0.74
ATG4B-217ENST00000475693 MP68P56378 58 aa10.42□□□□□ -0.74
ATG4B-217ENST00000475693 H3BPC8 53 aa10.42□□□□□ -0.74
ATG4B-217ENST00000475693 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
ATG4B-217ENST00000475693 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
ATG4B-217ENST00000475693 KRTAP10-8P60410 259 aa10.41□□□□□ -0.74
ATG4B-217ENST00000475693 LINC00304Q8N9R0 145 aa10.41□□□□□ -0.74
ATG4B-217ENST00000475693 PCLOQ9Y6V0 5065 aa10.39□□□□□ -0.75
ATG4B-217ENST00000475693 TRAV22A0A0B4J277 110 aa10.38□□□□□ -0.75
ATG4B-217ENST00000475693 MT1HL1P0DM35 61 aa10.38□□□□□ -0.75
ATG4B-217ENST00000475693 C4orf48Q5BLP8 95 aa10.37□□□□□ -0.75
ATG4B-217ENST00000475693 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa10.37□□□□□ -0.75
ATG4B-217ENST00000475693 PRR15Q8IV56 129 aa10.37□□□□□ -0.75
ATG4B-217ENST00000475693 WFDC13Q8IUB5 93 aa10.35□□□□□ -0.75
ATG4B-217ENST00000475693 CD164Q04900 197 aa10.34□□□□□ -0.75
ATG4B-217ENST00000475693 A8MWP4 228 aa10.34□□□□□ -0.75
ATG4B-217ENST00000475693 Q96NJ1 140 aa10.33□□□□□ -0.76
ATG4B-217ENST00000475693 LINC00472Q9H8W2 130 aa10.33□□□□□ -0.76
ATG4B-217ENST00000475693 CASC2Q6XLA1 102 aa10.32□□□□□ -0.76
ATG4B-217ENST00000475693 SPINK1P00995 79 aa10.3□□□□□ -0.76
ATG4B-217ENST00000475693 LINC00208Q96KT6 92 aa10.3□□□□□ -0.76
ATG4B-217ENST00000475693 RETNLBQ9BQ08 111 aa10.3□□□□□ -0.76
ATG4B-217ENST00000475693 PMAIP1Q13794 54 aa10.29□□□□□ -0.76
ATG4B-217ENST00000475693 H0Y9P7 68 aa10.28□□□□□ -0.76
ATG4B-217ENST00000475693 SPAG11AQ6PDA7 123 aa10.26□□□□□ -0.77
ATG4B-217ENST00000475693 PRR4Q16378 134 aa10.22□□□□□ -0.77
ATG4B-217ENST00000475693 LIMD2Q9BT23 127 aa10.22□□□□□ -0.77
ATG4B-217ENST00000475693 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa10.2□□□□□ -0.78
ATG4B-217ENST00000475693 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa10.19□□□□□ -0.78
ATG4B-217ENST00000475693 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa10.17□□□□□ -0.78
ATG4B-217ENST00000475693 PSPHP1O15172 72 aa10.17□□□□□ -0.78
ATG4B-217ENST00000475693 J3QL48 77 aa10.15□□□□□ -0.78
ATG4B-217ENST00000475693 RPS29P62273 56 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
ATG4B-217ENST00000475693 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa10.15□□□□□ -0.78
ATG4B-217ENST00000475693 HERC1Q15751 4861 aa10.14□□□□□ -0.79
ATG4B-217ENST00000475693 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa10.14□□□□□ -0.79
ATG4B-217ENST00000475693 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa10.14□□□□□ -0.79
ATG4B-217ENST00000475693 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
ATG4B-217ENST00000475693 A8MUN3 132 aa10.11□□□□□ -0.79
ATG4B-217ENST00000475693 Q5VV11 94 aa10.11□□□□□ -0.79
ATG4B-217ENST00000475693 A0A1B0GVX0 72 aa10.07□□□□□ -0.8
ATG4B-217ENST00000475693 C8orf17Q9NRJ1 99 aa10.06□□□□□ -0.8
ATG4B-217ENST00000475693 LPAP08519 4548 aa10.06□□□□□ -0.8
ATG4B-217ENST00000475693 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa10.05□□□□□ -0.8
ATG4B-217ENST00000475693 COA5Q86WW8 74 aa10.05□□□□□ -0.8
ATG4B-217ENST00000475693 C9orf92A6NGG3 77 aa10.04□□□□□ -0.8
ATG4B-217ENST00000475693 Q75L30 129 aa10.01□□□□□ -0.81
ATG4B-217ENST00000475693 PRR15LQ9BU68 103 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-217ENST00000475693 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-217ENST00000475693 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-217ENST00000475693 LINC00313P59037 77 aa9.97□□□□□ -0.81
ATG4B-217ENST00000475693 PCOTHQ58A44 107 aa9.94□□□□□ -0.82
ATG4B-217ENST00000475693 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.94□□□□□ -0.82
ATG4B-217ENST00000475693 LRP2P98164 4655 aa9.92□□□□□ -0.82
ATG4B-217ENST00000475693 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa9.91□□□□□ -0.82
ATG4B-217ENST00000475693 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa9.9□□□□□ -0.82
ATG4B-217ENST00000475693 NDUFS5O43920 106 aa9.9□□□□□ -0.83
ATG4B-217ENST00000475693 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa9.9□□□□□ -0.83
ATG4B-217ENST00000475693 C8orf87E5RJ46 101 aa9.87□□□□□ -0.83
ATG4B-217ENST00000475693 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa9.86□□□□□ -0.83
ATG4B-217ENST00000475693 A8MU10 97 aa9.86□□□□□ -0.83
ATG4B-217ENST00000475693 A6NED7 52 aa9.85□□□□□ -0.83
ATG4B-217ENST00000475693 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa9.85□□□□□ -0.83
ATG4B-217ENST00000475693 HMCN2Q8NDA2 5059 aa9.85□□□□□ -0.83
ATG4B-217ENST00000475693 HRES1P13985 223 aa9.84□□□□□ -0.83
ATG4B-217ENST00000475693 LCA10Q71F78 164 aa9.84□□□□□ -0.83
ATG4B-217ENST00000475693 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa9.84□□□□□ -0.83
ATG4B-217ENST00000475693 XP32Q5T750 250 aa9.78□□□□□ -0.84
ATG4B-217ENST00000475693 Q5W150 140 aa9.75□□□□□ -0.85
ATG4B-217ENST00000475693 TPRXLQ17RH7 258 aa9.74□□□□□ -0.85
ATG4B-217ENST00000475693 SPTSSBQ8NFR3 76 aa9.73□□□□□ -0.85
ATG4B-217ENST00000475693 A6NN06 94 aa9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.5 ms