RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472108.1

USP20-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 1,811 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-204ENST00000472108 FAT1Q14517 4588 aa9.58□□□□□ -0.88
USP20-204ENST00000472108 LINC00472Q9H8W2 130 aa9.58□□□□□ -0.88
USP20-204ENST00000472108 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa9.57□□□□□ -0.88
USP20-204ENST00000472108 MP68P56378 58 aa9.56□□□□□ -0.88
USP20-204ENST00000472108 DEFB116Q30KQ4 102 aa9.55□□□□□ -0.88
USP20-204ENST00000472108 PRO0628Q9UI54 55 aa9.54□□□□□ -0.88
USP20-204ENST00000472108 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
USP20-204ENST00000472108 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.54□□□□□ -0.88
USP20-204ENST00000472108 PRR15Q8IV56 129 aa9.53□□□□□ -0.88
USP20-204ENST00000472108 hDV103S1A0JD37 113 aa9.52□□□□□ -0.89
USP20-204ENST00000472108 A8MWP4 228 aa9.52□□□□□ -0.89
USP20-204ENST00000472108 Q5VSD8 79 aa9.52□□□□□ -0.89
USP20-204ENST00000472108 PRR26Q8N8Z3 221 aa9.52□□□□□ -0.89
USP20-204ENST00000472108 Q96NJ1 140 aa9.52□□□□□ -0.89
USP20-204ENST00000472108 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa9.49□□□□□ -0.89
USP20-204ENST00000472108 HSPG2P98160 4391 aa9.48□□□□□ -0.89
USP20-204ENST00000472108 Q1T7F1 81 aa9.47□□□□□ -0.89
USP20-204ENST00000472108 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.47□□□□□ -0.89
USP20-204ENST00000472108 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.47□□□□□ -0.89
USP20-204ENST00000472108 CASC2Q6XLA1 102 aa9.46□□□□□ -0.9
USP20-204ENST00000472108 TRAV22A0A0B4J277 110 aa9.45□□□□□ -0.9
USP20-204ENST00000472108 C1orf64Q8NEQ6 169 aa9.45□□□□□ -0.9
USP20-204ENST00000472108 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa9.45□□□□□ -0.9
USP20-204ENST00000472108 SPINK1P00995 79 aa9.44□□□□□ -0.9
USP20-204ENST00000472108 V9GYY9 64 aa9.43□□□□□ -0.9
USP20-204ENST00000472108 WFDC13Q8IUB5 93 aa9.42□□□□□ -0.9
USP20-204ENST00000472108 Q8N1X5 172 aa9.42□□□□□ -0.9
USP20-204ENST00000472108 LINC00304Q8N9R0 145 aa9.42□□□□□ -0.9
USP20-204ENST00000472108 LIMD2Q9BT23 127 aa9.42□□□□□ -0.9
USP20-204ENST00000472108 RYR1P21817 5038 aa9.41□□□□□ -0.9
USP20-204ENST00000472108 SPAG11AQ6PDA7 123 aa9.41□□□□□ -0.9
USP20-204ENST00000472108 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa9.41□□□□□ -0.9
USP20-204ENST00000472108 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
USP20-204ENST00000472108 RPS29P62273 56 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
USP20-204ENST00000472108 H0Y9P7 68 aa9.38□□□□□ -0.91
USP20-204ENST00000472108 LINC00208Q96KT6 92 aa9.38□□□□□ -0.91
USP20-204ENST00000472108 C1orf195Q5TG92 126 aa9.37□□□□□ -0.91
USP20-204ENST00000472108 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa9.36□□□□□ -0.91
USP20-204ENST00000472108 KIAA1109Q2LD37 5005 aa9.36□□□□□ -0.91
USP20-204ENST00000472108 MPLKIPQ8TAP9 179 aa9.35□□□□□ -0.91
USP20-204ENST00000472108 A0A1B0GVX0 72 aa9.35□□□□□ -0.91
USP20-204ENST00000472108 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa9.34□□□□□ -0.91
USP20-204ENST00000472108 KRTAP10-8P60410 259 aa9.32□□□□□ -0.92
USP20-204ENST00000472108 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa9.31□□□□□ -0.92
USP20-204ENST00000472108 C8orf17Q9NRJ1 99 aa9.3□□□□□ -0.92
USP20-204ENST00000472108 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.28□□□□□ -0.92
USP20-204ENST00000472108 BRK1Q8WUW1 75 aa9.28□□□□□ -0.92
USP20-204ENST00000472108 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa9.25□□□□□ -0.93
USP20-204ENST00000472108 C8orf87E5RJ46 101 aa9.23□□□□□ -0.93
USP20-204ENST00000472108 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
USP20-204ENST00000472108 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
USP20-204ENST00000472108 LINC00313P59037 77 aa9.2□□□□□ -0.94
USP20-204ENST00000472108 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
USP20-204ENST00000472108 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.19□□□□□ -0.94
USP20-204ENST00000472108 PRR4Q16378 134 aa9.18□□□□□ -0.94
USP20-204ENST00000472108 TNXBP22105 4242 aa9.17□□□□□ -0.94
USP20-204ENST00000472108 MT1HL1P0DM35 61 aa9.17□□□□□ -0.94
USP20-204ENST00000472108 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
USP20-204ENST00000472108 FAT3Q8TDW7 4589 aa9.14□□□□□ -0.95
USP20-204ENST00000472108 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa9.12□□□□□ -0.95
USP20-204ENST00000472108 RETNLBQ9BQ08 111 aa9.12□□□□□ -0.95
USP20-204ENST00000472108 COA5Q86WW8 74 aa9.11□□□□□ -0.95
USP20-204ENST00000472108 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa9.1□□□□□ -0.95
USP20-204ENST00000472108 NDUFS5O43920 106 aa9.1□□□□□ -0.95
USP20-204ENST00000472108 PSPHP1O15172 72 aa9.1□□□□□ -0.95
USP20-204ENST00000472108 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
USP20-204ENST00000472108 Q5VV11 94 aa9.09□□□□□ -0.95
USP20-204ENST00000472108 A8MUN3 132 aa9.08□□□□□ -0.96
USP20-204ENST00000472108 BIRC6Q9NR09 4857 aa9.07□□□□□ -0.96
USP20-204ENST00000472108 MYCBP2O75592 4640 aa9.07□□□□□ -0.96
USP20-204ENST00000472108 Q75L30 129 aa9.06□□□□□ -0.96
USP20-204ENST00000472108 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.03□□□□□ -0.96
USP20-204ENST00000472108 PCOTHQ58A44 107 aa9.01□□□□□ -0.97
USP20-204ENST00000472108 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa9.01□□□□□ -0.97
USP20-204ENST00000472108 C9orf92A6NGG3 77 aa9□□□□□ -0.97
USP20-204ENST00000472108 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.98□□□□□ -0.97
USP20-204ENST00000472108 PRR15LQ9BU68 103 aa8.98□□□□□ -0.97
USP20-204ENST00000472108 Q5W150 140 aa8.97□□□□□ -0.97
USP20-204ENST00000472108 HRES1P13985 223 aa8.95□□□□□ -0.98
USP20-204ENST00000472108 HERC2O95714 4834 aa8.94□□□□□ -0.98
USP20-204ENST00000472108 ACYP2P14621 99 aa8.94□□□□□ -0.98
USP20-204ENST00000472108 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.94□□□□□ -0.98
USP20-204ENST00000472108 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.93□□□□□ -0.98
USP20-204ENST00000472108 A8MUU9 505 aa8.92□□□□□ -0.98
USP20-204ENST00000472108 PMAIP1Q13794 54 aa8.92□□□□□ -0.98
USP20-204ENST00000472108 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa8.89□□□□□ -0.99
USP20-204ENST00000472108 J3QL48 77 aa8.89□□□□□ -0.99
USP20-204ENST00000472108 A6NED7 52 aa8.87□□□□□ -0.99
USP20-204ENST00000472108 DMAC1Q96GE9 116 aa8.87□□□□□ -0.99
USP20-204ENST00000472108 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.87□□□□□ -0.99
USP20-204ENST00000472108 LCA10Q71F78 164 aa8.82□□□□□ -1
USP20-204ENST00000472108 IGKV2-30P06310 120 aa8.82□□□□□ -1
USP20-204ENST00000472108 XP32Q5T750 250 aa8.8□□□□□ -1
USP20-204ENST00000472108 TPRXLQ17RH7 258 aa8.78□□□□□ -1
USP20-204ENST00000472108 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
USP20-204ENST00000472108 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.74□□□□□ -1.01
USP20-204ENST00000472108 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa8.73□□□□□ -1.01
USP20-204ENST00000472108 A8MU10 97 aa8.7□□□□□ -1.02
USP20-204ENST00000472108 A6NN06 94 aa8.7□□□□□ -1.02
USP20-204ENST00000472108 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.6 ms