RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 DSCR10P59022 87 aa5.92□□□□□ -1.46
RPRD1B-202ENST00000449186 PCOTHQ58A44 107 aa5.92□□□□□ -1.46
RPRD1B-202ENST00000449186 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.92□□□□□ -1.46
RPRD1B-202ENST00000449186 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RPRD1B-202ENST00000449186 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RPRD1B-202ENST00000449186 PDE6GP18545 87 aa5.87□□□□□ -1.47
RPRD1B-202ENST00000449186 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.86□□□□□ -1.47
RPRD1B-202ENST00000449186 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa5.86□□□□□ -1.47
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.85□□□□□ -1.47
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.84□□□□□ -1.47
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A1B0GVX0 72 aa5.83□□□□□ -1.48
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC00313P59037 77 aa5.83□□□□□ -1.48
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A1B0GV90 55 aa5.82□□□□□ -1.48
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RPRD1B-202ENST00000449186 ETDBQ3ZM63 59 aa5.82□□□□□ -1.48
RPRD1B-202ENST00000449186 Q75L30 129 aa5.82□□□□□ -1.48
RPRD1B-202ENST00000449186 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.82□□□□□ -1.48
RPRD1B-202ENST00000449186 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.81□□□□□ -1.48
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A1B0GW54 56 aa5.81□□□□□ -1.48
RPRD1B-202ENST00000449186 A8MUU9 505 aa5.81□□□□□ -1.48
RPRD1B-202ENST00000449186 NREPQ16612 68 aa5.81□□□□□ -1.48
RPRD1B-202ENST00000449186 F8W1H4 67 aa5.8□□□□□ -1.48
RPRD1B-202ENST00000449186 J3KT08 172 aa5.79□□□□□ -1.48
RPRD1B-202ENST00000449186 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.79□□□□□ -1.48
RPRD1B-202ENST00000449186 Q6ZVQ6 151 aa5.79□□□□□ -1.48
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC00846Q9NV44 126 aa5.79□□□□□ -1.48
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.78□□□□□ -1.48
RPRD1B-202ENST00000449186 A8MWP4 228 aa5.78□□□□□ -1.48
RPRD1B-202ENST00000449186 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.77□□□□□ -1.49
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.77□□□□□ -1.49
RPRD1B-202ENST00000449186 Q8N9L7 120 aa5.77□□□□□ -1.49
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.77□□□□□ -1.49
RPRD1B-202ENST00000449186 K7EQZ3 153 aa5.76□□□□□ -1.49
RPRD1B-202ENST00000449186 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.76□□□□□ -1.49
RPRD1B-202ENST00000449186 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.76□□□□□ -1.49
RPRD1B-202ENST00000449186 C8orf87E5RJ46 101 aa5.75□□□□□ -1.49
RPRD1B-202ENST00000449186 PRR15Q8IV56 129 aa5.75□□□□□ -1.49
RPRD1B-202ENST00000449186 NDUFB1O75438 58 aa5.74□□□□□ -1.49
RPRD1B-202ENST00000449186 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.73□□□□□ -1.49
RPRD1B-202ENST00000449186 BPY2O14599 106 aa5.73□□□□□ -1.49
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A0U1RQV1 116 aa5.7□□□□□ -1.5
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.69□□□□□ -1.5
RPRD1B-202ENST00000449186 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RPRD1B-202ENST00000449186 UBL5Q9BZL1 73 aa5.68□□□□□ -1.5
RPRD1B-202ENST00000449186 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.67□□□□□ -1.5
RPRD1B-202ENST00000449186 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RPRD1B-202ENST00000449186 hDV103S1A0JD37 113 aa5.65□□□□□ -1.5
RPRD1B-202ENST00000449186 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.65□□□□□ -1.5
RPRD1B-202ENST00000449186 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RPRD1B-202ENST00000449186 MT1HP80294 61 aa5.64□□□□□ -1.51
RPRD1B-202ENST00000449186 LCE3BQ5TA77 95 aa5.64□□□□□ -1.51
RPRD1B-202ENST00000449186 NDUFS5O43920 106 aa5.62□□□□□ -1.51
RPRD1B-202ENST00000449186 CASC2Q6XLA1 102 aa5.62□□□□□ -1.51
RPRD1B-202ENST00000449186 HRES1P13985 223 aa5.61□□□□□ -1.51
RPRD1B-202ENST00000449186 Q5W150 140 aa5.6□□□□□ -1.51
RPRD1B-202ENST00000449186 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.6□□□□□ -1.51
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.58□□□□□ -1.52
RPRD1B-202ENST00000449186 HCG22E2RYF7 251 aa5.58□□□□□ -1.52
RPRD1B-202ENST00000449186 SPINK7P58062 85 aa5.58□□□□□ -1.52
RPRD1B-202ENST00000449186 CXCL6P80162 114 aa5.58□□□□□ -1.52
RPRD1B-202ENST00000449186 ACYP1P07311 99 aa5.57□□□□□ -1.52
RPRD1B-202ENST00000449186 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
RPRD1B-202ENST00000449186 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.56□□□□□ -1.52
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.54□□□□□ -1.52
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.54□□□□□ -1.52
RPRD1B-202ENST00000449186 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
RPRD1B-202ENST00000449186 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.5□□□□□ -1.53
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A087WVE0 104 aa5.5□□□□□ -1.53
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.5□□□□□ -1.53
RPRD1B-202ENST00000449186 M0R2T5 61 aa5.5□□□□□ -1.53
RPRD1B-202ENST00000449186 IGKV2-30P06310 120 aa5.5□□□□□ -1.53
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM236CP0DP71 79 aa5.5□□□□□ -1.53
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC00643Q86TS7 51 aa5.5□□□□□ -1.53
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
RPRD1B-202ENST00000449186 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.48□□□□□ -1.53
RPRD1B-202ENST00000449186 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.47□□□□□ -1.53
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.45□□□□□ -1.54
RPRD1B-202ENST00000449186 J3QR89 54 aa5.43□□□□□ -1.54
RPRD1B-202ENST00000449186 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.43□□□□□ -1.54
RPRD1B-202ENST00000449186 C4orf26Q17RF5 130 aa5.41□□□□□ -1.54
RPRD1B-202ENST00000449186 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.41□□□□□ -1.54
RPRD1B-202ENST00000449186 MT-ATP8P03928 68 aa5.37□□□□□ -1.55
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.37□□□□□ -1.55
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.37□□□□□ -1.55
RPRD1B-202ENST00000449186 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.35□□□□□ -1.55
RPRD1B-202ENST00000449186 K7ERU9 68 aa5.35□□□□□ -1.55
RPRD1B-202ENST00000449186 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.35□□□□□ -1.55
RPRD1B-202ENST00000449186 H0Y9P7 68 aa5.34□□□□□ -1.55
RPRD1B-202ENST00000449186 UQCRQO14949 82 aa5.34□□□□□ -1.55
RPRD1B-202ENST00000449186 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.34□□□□□ -1.55
RPRD1B-202ENST00000449186 OCR1Q9BZK8 76 aa5.34□□□□□ -1.55
RPRD1B-202ENST00000449186 H3BS24 57 aa5.33□□□□□ -1.56
RPRD1B-202ENST00000449186 MT2AP02795 61 aa5.32□□□□□ -1.56
RPRD1B-202ENST00000449186 LCE1DQ5T752 114 aa5.31□□□□□ -1.56
RPRD1B-202ENST00000449186 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.3□□□□□ -1.56
RPRD1B-202ENST00000449186 MT1FP04733 61 aa5.29□□□□□ -1.56
RPRD1B-202ENST00000449186 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.28□□□□□ -1.56
RPRD1B-202ENST00000449186 KLKP1Q107X0 134 aa5.27□□□□□ -1.57
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.27□□□□□ -1.57
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC00208Q96KT6 92 aa5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.5 ms