RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 C9orf92A6NGG3 77 aa6.4□□□□□ -1.38
PRAME-210ENST00000442481 J3QR89 54 aa6.4□□□□□ -1.38
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.39□□□□□ -1.39
PRAME-210ENST00000442481 MT1HP80294 61 aa6.38□□□□□ -1.39
PRAME-210ENST00000442481 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.37□□□□□ -1.39
PRAME-210ENST00000442481 A0A1B0GW54 56 aa6.37□□□□□ -1.39
PRAME-210ENST00000442481 C1orf195Q5TG92 126 aa6.37□□□□□ -1.39
PRAME-210ENST00000442481 LINC00846Q9NV44 126 aa6.37□□□□□ -1.39
PRAME-210ENST00000442481 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.37□□□□□ -1.39
PRAME-210ENST00000442481 K7ERU9 68 aa6.36□□□□□ -1.39
PRAME-210ENST00000442481 ACYP1P07311 99 aa6.36□□□□□ -1.39
PRAME-210ENST00000442481 Q5XG85 94 aa6.36□□□□□ -1.39
PRAME-210ENST00000442481 PCOTHQ58A44 107 aa6.35□□□□□ -1.39
PRAME-210ENST00000442481 M0R2T5 61 aa6.34□□□□□ -1.39
PRAME-210ENST00000442481 NREPQ16612 68 aa6.34□□□□□ -1.39
PRAME-210ENST00000442481 Q6ZVQ6 151 aa6.34□□□□□ -1.39
PRAME-210ENST00000442481 UBL5Q9BZL1 73 aa6.34□□□□□ -1.39
PRAME-210ENST00000442481 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PRAME-210ENST00000442481 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.32□□□□□ -1.4
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PRAME-210ENST00000442481 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.3□□□□□ -1.4
PRAME-210ENST00000442481 Q96NJ1 140 aa6.3□□□□□ -1.4
PRAME-210ENST00000442481 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.29□□□□□ -1.4
PRAME-210ENST00000442481 IGKV4-1P06312 121 aa6.28□□□□□ -1.4
PRAME-210ENST00000442481 SIGMAR1Q99720 223 aa6.28□□□□□ -1.4
PRAME-210ENST00000442481 BPY2O14599 106 aa6.27□□□□□ -1.41
PRAME-210ENST00000442481 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.26□□□□□ -1.41
PRAME-210ENST00000442481 J3KT08 172 aa6.26□□□□□ -1.41
PRAME-210ENST00000442481 LINC00643Q86TS7 51 aa6.25□□□□□ -1.41
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.23□□□□□ -1.41
PRAME-210ENST00000442481 DSCR10P59022 87 aa6.23□□□□□ -1.41
PRAME-210ENST00000442481 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.22□□□□□ -1.41
PRAME-210ENST00000442481 A8MWP4 228 aa6.21□□□□□ -1.42
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PRAME-210ENST00000442481 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PRAME-210ENST00000442481 CXCL6P80162 114 aa6.21□□□□□ -1.42
PRAME-210ENST00000442481 Q8N9L7 120 aa6.21□□□□□ -1.42
PRAME-210ENST00000442481 K7EQZ3 153 aa6.2□□□□□ -1.42
PRAME-210ENST00000442481 NDUFB1O75438 58 aa6.2□□□□□ -1.42
PRAME-210ENST00000442481 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.19□□□□□ -1.42
PRAME-210ENST00000442481 A0A1B0GVX0 72 aa6.19□□□□□ -1.42
PRAME-210ENST00000442481 MT-ATP8P03928 68 aa6.17□□□□□ -1.42
PRAME-210ENST00000442481 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PRAME-210ENST00000442481 PRR15Q8IV56 129 aa6.17□□□□□ -1.42
PRAME-210ENST00000442481 C8orf87E5RJ46 101 aa6.14□□□□□ -1.43
PRAME-210ENST00000442481 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.14□□□□□ -1.43
PRAME-210ENST00000442481 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.14□□□□□ -1.43
PRAME-210ENST00000442481 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.14□□□□□ -1.43
PRAME-210ENST00000442481 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PRAME-210ENST00000442481 A0A087WVE0 104 aa6.12□□□□□ -1.43
PRAME-210ENST00000442481 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.12□□□□□ -1.43
PRAME-210ENST00000442481 LINC00313P59037 77 aa6.12□□□□□ -1.43
PRAME-210ENST00000442481 Q75L30 129 aa6.12□□□□□ -1.43
PRAME-210ENST00000442481 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.12□□□□□ -1.43
PRAME-210ENST00000442481 HCG22E2RYF7 251 aa6.1□□□□□ -1.43
PRAME-210ENST00000442481 CASC2Q6XLA1 102 aa6.09□□□□□ -1.43
PRAME-210ENST00000442481 IMUPQ9GZP8 106 aa6.09□□□□□ -1.43
PRAME-210ENST00000442481 hDV103S1A0JD37 113 aa6.08□□□□□ -1.44
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.07□□□□□ -1.44
PRAME-210ENST00000442481 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.07□□□□□ -1.44
PRAME-210ENST00000442481 A8MUU9 505 aa6.06□□□□□ -1.44
PRAME-210ENST00000442481 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.06□□□□□ -1.44
PRAME-210ENST00000442481 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PRAME-210ENST00000442481 SSPOA2VEC9 5147 aa6.05□□□□□ -1.44
PRAME-210ENST00000442481 NDUFS5O43920 106 aa6.03□□□□□ -1.44
PRAME-210ENST00000442481 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.02□□□□□ -1.45
PRAME-210ENST00000442481 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.02□□□□□ -1.45
PRAME-210ENST00000442481 USH2AO75445 5202 aa6.02□□□□□ -1.45
PRAME-210ENST00000442481 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PRAME-210ENST00000442481 SCGB1A1P11684 91 aa5.99□□□□□ -1.45
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.98□□□□□ -1.45
PRAME-210ENST00000442481 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PRAME-210ENST00000442481 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PRAME-210ENST00000442481 ATOX1O00244 68 aa5.93□□□□□ -1.46
PRAME-210ENST00000442481 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PRAME-210ENST00000442481 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.93□□□□□ -1.46
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.92□□□□□ -1.46
PRAME-210ENST00000442481 OCR1Q9BZK8 76 aa5.92□□□□□ -1.46
PRAME-210ENST00000442481 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PRAME-210ENST00000442481 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.91□□□□□ -1.46
PRAME-210ENST00000442481 FAM236CP0DP71 79 aa5.91□□□□□ -1.46
PRAME-210ENST00000442481 UQCRQO14949 82 aa5.9□□□□□ -1.46
PRAME-210ENST00000442481 Q5W150 140 aa5.9□□□□□ -1.46
PRAME-210ENST00000442481 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.89□□□□□ -1.47
PRAME-210ENST00000442481 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.88□□□□□ -1.47
PRAME-210ENST00000442481 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.88□□□□□ -1.47
PRAME-210ENST00000442481 H0Y9P7 68 aa5.87□□□□□ -1.47
PRAME-210ENST00000442481 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.86□□□□□ -1.47
PRAME-210ENST00000442481 MT2AP02795 61 aa5.85□□□□□ -1.47
PRAME-210ENST00000442481 HRES1P13985 223 aa5.84□□□□□ -1.47
PRAME-210ENST00000442481 SERP2Q8N6R1 65 aa5.84□□□□□ -1.47
PRAME-210ENST00000442481 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.84□□□□□ -1.47
PRAME-210ENST00000442481 MP68P56378 58 aa5.83□□□□□ -1.48
PRAME-210ENST00000442481 SPINK7P58062 85 aa5.83□□□□□ -1.48
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP10-10P60014 251 aa5.83□□□□□ -1.48
PRAME-210ENST00000442481 C5orf47Q569G3 176 aa5.83□□□□□ -1.48
PRAME-210ENST00000442481 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.82□□□□□ -1.48
PRAME-210ENST00000442481 MT1FP04733 61 aa5.82□□□□□ -1.48
PRAME-210ENST00000442481 IGKV2-30P06310 120 aa5.82□□□□□ -1.48
PRAME-210ENST00000442481 LINC00208Q96KT6 92 aa5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.9 ms